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雪狼乖乖
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z-matrix 计算HCN居然出错~~
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# opt=z-matrix am1 Title Card Required 0 1 C H 1 B1 N 1 B2 2 A1 B1 1.06898300 B2 1.16018400 A1 180.00000000 以下是出错信息： Error on Z-matrix card number 3 angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180. Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed: --------------------------------------------------------------------------------------------------- Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES) CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J --------------------------------------------------------------------------------------------------- 1 1 C 2 2 H 1 1.068983( 1) 3 3 N 1 1.160184( 2) 2 180.000( 3) --------------------------------------------------------------------------------------------------- Error termination via Lnk1e in e:\g09w\l716.exe at Mon Dec 02 21:29:13 2013. 请问：为何会提示180°超过计算范围？这个在算法上是什么原因造成的？有人说是势能求梯度时报错造成的。 我将角度修改为179°时，运行正常，但是当角度优化到180°时又报错了。 如果取消z矩阵的话，优化正常结束。 求教 |
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三个呈线性的分子的键角是不能使用的，键角对所有直角坐标的偏导数都为0。另外，线性分子的自由度比非线性分子多1，而多出的正是对应键角弯曲自由度的；在两个垂直方向键角的张合构成两个简并自由度。要正确描述线性分子，需要设置一个虚原子，才能得到正确的3N-5个自由度。 C H 1 B1 X 1 1.0 2 90.0 N 1 B2 3 90.0 2 180.00 B1 1.06898300 B2 1.16018400 详细解释可以在高斯网站找到 http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/c_zmat.htm 找到Using dummy atoms这一节，就有HCN这个分子的例子。 |
6楼2013-12-03 00:40:49
7楼2013-12-03 08:19:12
