24小时热门版块排行榜    

查看: 1542  |  回复: 20
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xiaowandouer

木虫 (正式写手)

[交流] 切实可行的计算机模拟的体系最大有多大?

切实可行的计算机模拟的体系最大有多大?相应的计算软件呢?
欢迎大家交流。谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

引用回帖:
Originally posted by xiaowandouer at 2007-12-25 09:12:




不知道您算的这些体系是否包含重原子?并行算吗?
我最近用linux版高斯在算,含过渡金属
大约200个基函数,要差不多两天一个构型
感觉基函数再多,用高斯已经无法忍受,因为要算的构型太多
可能并行会 ...

我那个帖子中的数据指的是极限的情形,是我成功做过的最大的计算,那个1530个基函数的频率计算在双核2.4G的酷睿CPU上运行,耗费了我16天的时间

我不知道你用什么方法在什么样的电脑上计算,200个基函数计算,在DFT-B3LYP水平,我的电脑(酷睿4核2.4CPU/4G内存)优化加频率最多也就是0.5个小时,MP2水平也不会超过两个小时,就算两年前买的P4 3.0G的CPU/1G内存的电脑,MP2也不应该超过1天的。

我算的体系也经常含有过渡金属的,你是否定义了大的极化函数,比如3df,在基函数数量相同的情况下,含大的极化函数的计算会相对慢一些。

并行计算当然会提高速度,比如同一台机器上使用两个CPU差不多能提升90%的性能,四个CPU大概能相当于3.2个单CPU的速度,前提是你要运行那些并行处理较好的计算
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
9楼2007-12-25 10:33:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):平安夜,圣诞,元旦节日发主题帖或应助,额外加金币一个祝福~~
我用gaussian计算相对多一些
在DFT-B3LYP水平上,
单点做过3000个基函数的
几何优化做过2000个基函数的
频率做过1530个基函数的
MP2水平做过几何优化,最大大约1000个基函数
MP2频率在基函数大于600时重来没有算成功过,最大使用16G硬盘空间给限制死了。64位的Gaussian可能能解决。

大家补充
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
2楼2007-12-24 15:40:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cationly

木虫 (正式写手)


csfn(金币+1,VIP+0):平安夜,圣诞,元旦节日发主题帖或应助,额外加金币一个祝福~~
vasp 算过100个原子的体系.
算了半个多月,8核并行
3楼2007-12-24 15:47:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

carlon

金虫 (小有名气)

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):平安夜,圣诞,元旦节日发主题帖或应助,额外加金币一个祝福~~
要看什么软件和什么方法了
如果是密度泛函的方法,可能能处理的原子数较少
特别是高斯,原子数多了而且有重原子的话会相对麻烦
如果是ms的话,一般20个左右原子还是可以算算的
如果是分子力学和分子动力学,算的体系可能是几百个原子把。
4楼2007-12-24 18:24:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 科研孤儿太难了 +14 我4大白菜 2026-08-20 15/750 2026-08-20 22:33 by 袁向阳007
[基金申请] 让我中一个面上吧! +8 大萍1987 2026-08-20 10/500 2026-08-20 21:48 by 大萍1987
[基金申请] 言之凿凿,明天官网会通知放榜? +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
信息提示
请填处理意见