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wjmed

木虫 (正式写手)


[资源] 【分享】Tripos Sybyl Mol2原子类型

在分子模拟中,Tripos公司的MOL2格式是比较通用的文件格式,所以弄清其中的原子类型就比较重要。
下面我贴了3张图片,前一张是在sybyl的使用手册中截取下来的,后面两张是从分析对接软件gold的使用手册中截取下来的,以供大家参考。
本来是pdf的,不过考虑到上传pdf,大家下载还需要金币,就又保存为了图片,这样就可以直接下载了。
csfn 大虾建议我把自己发的关于分子模拟的帖子总结一下,我认为这个建议不错。
不过,电脑中还有很多以前的心得体会,我想再整理一下,再发一些帖子后,把这些总结成一个目录。
非常感谢大家一直来的支持!

[ Last edited by mingdong on 2008-12-11 at 09:39 ]
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lavinia

金虫 (正式写手)


希望楼主今后多发一些关于SYBYL使用的帖子,我在学习中,有太多不会的。谢谢
4楼2007-12-24 09:34:22
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2楼2007-12-24 08:22:41
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lavinia

金虫 (正式写手)


谢谢,受益非浅。我是SYBYL新手,想问一下如何在SYBYL中把蛋白质复合物拆分为配体和受体文件,谢谢!
3楼2007-12-24 09:30:30
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★ ★
spur(金币+2,VIP+0):感谢参与!欢迎常来!:)
MOL2文件格式虽然是Tripos公司发明的,
并且是该公司的SYBYL软件的主力文件格式,
但是,由于该格式考虑得比较周到(例如,比MDL公司的MOL格式),
因此在其他软件中,应用也相当广泛。

在分子对接方面,DOCK, AutoDock和ArgusLab都用MOL2格式。
5楼2007-12-24 10:23:39
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