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【分享】Tripos Sybyl Mol2原子类型
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在分子模拟中，Tripos公司的MOL2格式是比较通用的文件格式，所以弄清其中的原子类型就比较重要。 下面我贴了3张图片，前一张是在sybyl的使用手册中截取下来的，后面两张是从分析对接软件gold的使用手册中截取下来的，以供大家参考。 本来是pdf的，不过考虑到上传pdf，大家下载还需要金币，就又保存为了图片，这样就可以直接下载了。 csfn 大虾建议我把自己发的关于分子模拟的帖子总结一下，我认为这个建议不错。 不过，电脑中还有很多以前的心得体会，我想再整理一下，再发一些帖子后，把这些总结成一个目录。 非常感谢大家一直来的支持！ [ Last edited by mingdong on 2008-12-11 at 09:39 ] |
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这里John E. Kerrigan教授针对一些软件写的教程，非常好 http://www2.umdnj.edu/~kerrigje/structbio_II.htm 其中包括楼上提供的gold教程 |
7楼2007-12-24 21:03:22
8楼2007-12-24 22:48:01
9楼2007-12-25 09:15:09
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您是问老汉？ 呵呵 南拳北腿源少林 爬冰卧雪四体勤 N年苟延象牙塔 远渡重洋次等人 物化开路算能量 分析作眼观谱峰 合成乃是家常菜 无机晶体算应用 曾学Fortran玩到死（到死=DOS，微软公司早期的单用户操作系统）， 调试C语言摸秃顶。 Java到处去调试， Perl站内忙运行。 Sybyl死啃SGI， 其实Linux也能赢。 加拿大出了个MOE， Accelrys混大名。 体系小了没意思， 分子大了还难成。 QM/MM双双上， 依天哪能缺屠龙？ 药物设计钱难瞢， 材料纳米却好碰。 随便用个能带论， 凑上数据来表征。 开源自由思想好， 可惜中国贡献轻。 拿来主义未百年， 抄袭剽窃已成风。 老汉年迈脑还灵， 尚能饭否死硬撑。 岂愿如此衰败体， 再捆官僚系统绳？ 一台电脑能上网， 两指频敲字成行。 三顿素餐吃半饱， 四世同堂我据中。 [ Last edited by yalefield on 2007-12-25 at 10:35 ] |
10楼2007-12-25 10:31:28
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