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在生成wfn文件的时,什么情况下需要加nosymm
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xllifan
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在生成wfn文件的时,什么情况下需要加nosymm
本人是刚开始学Multiwfn,在生成wfn文件的时候,看有的文献上说需要加nosymm
在此请教各位,在生成wfn文件的时,什么情况下需要加nosymm 谢谢!
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1楼
2013-11-26 17:12:59
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7楼
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Originally posted by
xllifan
at 2013-11-27 18:16:20
对不起,忘记说了。我是打算画The electron density difference contour line maps。 我看了些资料,有的说需要,有的说不需要。疑惑中。...
取决于你用谁减去谁。诸如都是同一个体系,计算它的激发态(垂直激发)和基态的密度差,就不需要nosymm,因为分子结构是相同的,即便高斯自动把体系放置到标准朝向下,对这两个状态也是完全一致的。如果你拿复合物的密度减去每个片段的密度,就需要利用nosymm避免高斯自动调整体系坐标,否则会导致片段的坐标和复合物的坐标不对应。
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9楼
2013-11-27 21:36:47
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zhou2009: 金币+3
2013-11-26 20:19:08
通常都不需要加,除非手册里具体指明需要加,或者你希望wfn文件里的原子坐标和你输入文件里的坐标完全一致(不加nosymm的话程序会自动将坐标调整到标准朝向下)。诸如做片段密度差图时,每个片段坐标必须和复合物的坐标一致,此时就得靠nosymm来保证坐标不自动调整。
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2楼
2013-11-26 17:37:22
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2楼
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sobereva
at 2013-11-26 17:37:22
通常都不需要加,除非手册里具体指明需要加,或者你希望wfn文件里的原子坐标和你输入文件里的坐标完全一致(不加nosymm的话程序会自动将坐标调整到标准朝向下)。诸如做片段密度差图时,每个片段坐标必须和复合物的 ...
非常感谢你的回复。我是在画变形密度的密度差图。请问您需要加nosymm吗?
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3楼
2013-11-26 22:45:06
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xllifan
at 2013-11-26 22:45:06
非常感谢你的回复。我是在画变形密度的密度差图。请问您需要加nosymm吗?...
你是指的进入主功能3、4、5之后选-2对应的那个deformation property么?如果是指的那个,生成分子的波函数文件时不需要nosymm。因为Multiwfn会自动把每个原子的波函数的中心放置到相应原子核位置上。
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4楼
2013-11-26 23:54:37
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