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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Multiwfn » 在生成wfn文件的时，什么情况下需要加nosymm
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xllifan

木虫 (小有名气)

[求助] 在生成wfn文件的时，什么情况下需要加nosymm

本人是刚开始学Multiwfn，在生成wfn文件的时候，看有的文献上说需要加nosymm
在此请教各位，在生成wfn文件的时，什么情况下需要加nosymm  谢谢！
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1楼 2013-11-26 17:12:59
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★ ★ ★ ★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2013-11-26 18:42:07
zhou2009: 金币+3 2013-11-26 20:19:08
通常都不需要加，除非手册里具体指明需要加，或者你希望wfn文件里的原子坐标和你输入文件里的坐标完全一致（不加nosymm的话程序会自动将坐标调整到标准朝向下）。诸如做片段密度差图时，每个片段坐标必须和复合物的坐标一致，此时就得靠nosymm来保证坐标不自动调整。
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2楼2013-11-26 17:37:22
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xllifan

木虫 (小有名气)
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2楼: Originally posted by sobereva at 2013-11-26 17:37:22
通常都不需要加，除非手册里具体指明需要加，或者你希望wfn文件里的原子坐标和你输入文件里的坐标完全一致（不加nosymm的话程序会自动将坐标调整到标准朝向下）。诸如做片段密度差图时，每个片段坐标必须和复合物的 ...

非常感谢你的回复。我是在画变形密度的密度差图。请问您需要加nosymm吗？
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3楼2013-11-26 22:45:06
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
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3楼: Originally posted by xllifan at 2013-11-26 22:45:06
非常感谢你的回复。我是在画变形密度的密度差图。请问您需要加nosymm吗？...

你是指的进入主功能3、4、5之后选-2对应的那个deformation property么？如果是指的那个，生成分子的波函数文件时不需要nosymm。因为Multiwfn会自动把每个原子的波函数的中心放置到相应原子核位置上。
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4楼2013-11-26 23:54:37
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xllifan

木虫 (小有名气)
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4楼: Originally posted by sobereva at 2013-11-26 23:54:37
你是指的进入主功能3、4、5之后选-2对应的那个deformation property么？如果是指的那个，生成分子的波函数文件时不需要nosymm。因为Multiwfn会自动把每个原子的波函数的中心放置到相应原子核位置上。...

我的意思是在由向高斯提交生成wfn的文件中，是否需要nosymm。比如：
# pw91pw91/6-311+g* nosymm output=wfn pop=full
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5楼2013-11-27 07:29:58
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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5楼: Originally posted by xllifan at 2013-11-27 07:29:58
我的意思是在由向高斯提交生成wfn的文件中，是否需要nosymm。比如：
# pw91pw91/6-311+g* nosymm output=wfn pop=full...

这还是取决于这个文件打算用于什么目的的分析。通常不需要。
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xllifan
6楼2013-11-27 13:26:21
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xllifan

木虫 (小有名气)
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6楼: Originally posted by sobereva at 2013-11-27 13:26:21
这还是取决于这个文件打算用于什么目的的分析。通常不需要。...

对不起，忘记说了。我是打算画The electron density difference contour line maps。 我看了些资料，有的说需要，有的说不需要。疑惑中。
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7楼2013-11-27 18:16:20
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xllifan

木虫 (小有名气)
送红花一朵
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6楼: Originally posted by sobereva at 2013-11-27 13:26:21
这还是取决于这个文件打算用于什么目的的分析。通常不需要。...

我是打算画The electron density difference contour line maps
不知道需要吗？还有，我看有的说需要，有的不需要。疑惑中。
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8楼2013-11-27 18:17:23
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sobereva

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7楼: Originally posted by xllifan at 2013-11-27 18:16:20
对不起，忘记说了。我是打算画The electron density difference contour line maps。 我看了些资料，有的说需要，有的说不需要。疑惑中。...

取决于你用谁减去谁。诸如都是同一个体系，计算它的激发态（垂直激发）和基态的密度差，就不需要nosymm，因为分子结构是相同的，即便高斯自动把体系放置到标准朝向下，对这两个状态也是完全一致的。如果你拿复合物的密度减去每个片段的密度，就需要利用nosymm避免高斯自动调整体系坐标，否则会导致片段的坐标和复合物的坐标不对应。
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9楼2013-11-27 21:36:47
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xllifan

木虫 (小有名气)
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9楼: Originally posted by sobereva at 2013-11-27 21:36:47
取决于你用谁减去谁。诸如都是同一个体系，计算它的激发态（垂直激发）和基态的密度差，就不需要nosymm，因为分子结构是相同的，即便高斯自动把体系放置到标准朝向下，对这两个状态也是完全一致的。如果你拿复合物 ...

非常感谢。明白了。
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10楼2013-11-28 06:26:28
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