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小二丫结婚

金虫 (初入文坛)

[求助] 大肠杆菌基因工程菌表达的L-门冬酰胺酶纯化及酶活测定方法,求指点!已有1人参与

本人构建了一株大肠杆菌基因工程菌,诱导后用于发酵产L-门冬酰胺酶(原设计是胞外表达),我是直接将发酵液挂Ni柱子纯化蛋白(有组氨酸标签),用诱导前发酵液、诱导后发酵液、纯化的目的蛋白同时跑电泳,结果没看到目的蛋白分子量大小的条带。还有,将发酵液离心后的上清液和菌体洗涤后悬浮再破壁的溶液同时测酶活(奈斯勒试剂显色法:1ml0.04M的天冬酰胺底物加1ml0.02MpH=8的磷酸盐缓冲液,37度水浴5min预热后,加入粗酶液500ul37度反应15min后,加入1ml50%的三氯乙酸终止反应。再从终止管里取500ul加到3.5ml蒸馏水中,加入1ml奈斯勒试剂显色15min,500nm处测OD值),结果值很低;在测OD值之前我将浑浊的反应液都离心过了,加入奈斯勒试剂后明明看到颜色变得深黄,然后测OD值时却显示很低,实在不知道原因。请各位高手给点建议~~~谢谢
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xdfy0301

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


137167741: 金币+1, 小木虫交流,共同进步~~ 2014-01-19 08:52:43
对照样品颜色怎么样?可能本来酶活就低或者标准曲线太大不在最适范围,低酶活对应的吸光值低
2楼2013-12-09 12:37:31
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ruoqiu.xiao

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 小二丫结婚 at 2013-12-13 15:30:40
大仙问到我心坎上了,我自问数理化一塌糊涂(表问我为什么这个水平还搞科研,还研究生毕业了。。。)我确实是搞不清楚公式数理关系,也推算不出来,所以想走捷径让大仙们告诉我答案的,结果还是。。。没弄懂。很感 ...

好吧,看在两朵红花的份儿上,给菇凉示范一遍如何推倒,如果菇凉要拿我实践,我是不会拒绝滴
硫酸铵标准品浓度为0.001M,那么铵离子浓度为0.002M。
在显色反应中,菇凉从终止管里取了0.5mL酶水解体系,那么我猜菇凉加硫酸铵标准品的时候应该也是0.5mL,基于该假设,
标准品显色反应中,铵离子物质的量应该为:
n(ammonia)=2*10^-3 mole/L*0.5*10^-3 L=1*10^-6 mole=1μmole。
我们再假设,菇凉你的酶水解体系中门冬酰胺酶的浓度恰到好处,以至于从终止管里取出来的0.5mL酶水解体系中也含有1μmole铵,那么在15min的水解反应时间内,平均每min生成的铵的物质的量,或者说水解速率,应改为:
Hydrolysis velocity = 1μmole/15min=(1/15) μmole/min
注意水解速率单位是μmole/min,这恰恰也是酶活单位(通常1个单位酶活就是1U),也就是说,水解速率就是酶活,所以,
Asparaginase activity= Hydrolysis velocity=(1/15) μmole/min =(1/15) U (注:通常1个单位酶活就是1U)。
也就是说,从终止管里取出来的0.5mL酶水解体系中含有(1/15) U的门冬酰胺酶,而终止管里原来有3.5mL,所以,终止管里总共含有(7/15) U的门冬酰胺酶。
最开始,菇凉你向终止管里加入了0.5mL粗酶液,那么,
粗酶液的酶活应该为(7/15) U / 0.5ml = (14/15) U/mL。
也就是说,如果菇凉你的粗酶液酶活为(14/15) U/mL,那么显色反应后的读数应该与0.001M硫酸铵标准品显色反应后的读数是一样的,也就是说,
0.001M硫酸铵标准品代表(14/15) U/mL的粗酶液。

求红花求推倒各种求
Today-will-be-history.
8楼2013-12-13 20:50:19
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小二丫结婚

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xdfy0301 at 2013-12-09 12:37:31
对照样品颜色怎么样?可能本来酶活就低或者标准曲线太大不在最适范围,低酶活对应的吸光值低

对照颜色看着正常,比样品颜色淡。我还想问个问题,发酵液在冰箱过夜是否会影响酶活?我觉得好像不太正常
人生若只如初见,何事秋风悲画扇。
3楼2013-12-09 15:07:44
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ruoqiu.xiao

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

只说酶活测定方法,我个人的理解:

1. 粗酶液里面有没有含氮有机物啊,菇凉你有木有做空白对照啊(是酶样自己的空白对照,不是标准品的对照),就是先加三氯乙酸,然后水浴15min,水浴结束后再加粗酶液。

2. 标准品对照问题,硫酸铵标准品浓度多少,A500多少?与酶样A500相比怎么样?

3. 酶活定义问题,菇凉你是如何定义酶活的 (比如可以定义1min生成1μmole氨定义为1U)?理论上根据硫酸氨标准品浓度和门冬酰胺酶反应时间, 可以计算出硫酸铵标准品代表多少酶活的,这样才能计算你粗酶液的酶活,粗酶液A500低不代表酶活低

4. 奈斯勒试剂是自己配的还是买的碘化汞钾?建议你在测定时候看看A500稳定不稳定,如果用碘化汞钾的话,读数有可能是不太稳定的。

这个是中国药典里面的门冬酰胺酶酶活测定方法:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6333558&fpage=1

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4楼2013-12-10 19:51:27
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小二丫结婚

金虫 (初入文坛)

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4楼: Originally posted by ruoqiu.xiao at 2013-12-10 19:51:27
只说酶活测定方法,我个人的理解:

1. 粗酶液里面有没有含氮有机物啊,菇凉你有木有做空白对照啊(是酶样自己的空白对照,不是标准品的对照),就是先加三氯乙酸,然后水浴15min,水浴结束后再加粗酶液。

2. 标 ...

首先,粗酶液空白对照做了。我用了近似药典的方法,硫酸铵浓度是0.001mol/L,A450为0.247,我觉得这个值可以一直用,不用每次都测。酶活定义:一个门冬酰胺酶单位相当于每分钟分解门冬酰胺产生1umoL氨所需的酶量。用药典里的公式带进去算,数值是很低的。奈斯勒试剂是我自己配的,现配现用,读数时不太稳定,刚开始我以为是机器的问题,后来发现别的机器也一样数据混乱。本身吸光度法就不太靠谱,现在每次测得数据都不一样,彻底不知道酶活是多少了。。。。
人生若只如初见,何事秋风悲画扇。
5楼2013-12-11 10:43:42
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ruoqiu.xiao

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小二丫结婚: 金币+10 2014-03-06 15:20:23
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小二丫结婚 at 2013-12-11 10:43:42
首先,粗酶液空白对照做了。我用了近似药典的方法,硫酸铵浓度是0.001mol/L,A450为0.247,我觉得这个值可以一直用,不用每次都测。酶活定义:一个门冬酰胺酶单位相当于每分钟分解门冬酰胺产生1umoL氨所需的酶量。 ...

1. 确定公式里面的倍数关系没搞错?如果你深信自己没搞错,能不能自己推导出来?能不能像推倒男朋友一样熟练地推导公式?比如说,菇凉你知道自己配的0.001M硫酸铵相当于多少单位的酶活吗?

2. 既然你都发现显色反应不稳定的问题了,那每次测酶活时候为什么不再测定标准品A500 (还是A450?)呢?每次测定数值肯定都会有变化的。

3. 我觉得显色反应不稳定没多大关系,只要能够保证酶样和标准品同时加入奈斯勒试剂,或加入的先后时间间隔不大。如果菇凉你能做到在短时间内加完奈斯勒试剂,接下来在测定A500时候,可以每隔几分钟读一次A500,当然也是在短时间内读完(所以建议用酶标仪,不要用光度计),然后用每次读数分别去计算酶活,最后你会发现若干次酶活测定结果误差其实不是很大。

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6楼2013-12-11 15:35:27
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小二丫结婚

金虫 (初入文坛)

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6楼: Originally posted by ruoqiu.xiao at 2013-12-11 15:35:27
1. 确定公式里面的倍数关系没搞错?如果你深信自己没搞错,能不能自己推导出来?能不能像推倒男朋友一样熟练地推导公式?比如说,菇凉你知道自己配的0.001M硫酸铵相当于多少单位的酶活吗?

2. 既然你都发现显色 ...

大仙问到我心坎上了,我自问数理化一塌糊涂(表问我为什么这个水平还搞科研,还研究生毕业了。。。)我确实是搞不清楚公式数理关系,也推算不出来,所以想走捷径让大仙们告诉我答案的,结果还是。。。没弄懂。很感激大仙的答复,就让我一个人默默的流内吧
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7楼2013-12-13 15:30:40
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xdfy0301

新虫 (初入文坛)

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3楼: Originally posted by 小二丫结婚 at 2013-12-09 15:07:44
对照颜色看着正常,比样品颜色淡。我还想问个问题,发酵液在冰箱过夜是否会影响酶活?我觉得好像不太正常...

在冰箱中过夜会有一定的影响,但具体的影响与你的酶所处的环境相关,如果是粗酶液,异源蛋白酶可能会对酶产生降解
9楼2013-12-16 15:26:09
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小二丫结婚

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xdfy0301 at 2013-12-16 15:26:09
在冰箱中过夜会有一定的影响,但具体的影响与你的酶所处的环境相关,如果是粗酶液,异源蛋白酶可能会对酶产生降解...

想问一下,异源蛋白酶是什么?怎么个降解法
人生若只如初见,何事秋风悲画扇。
10楼2013-12-17 13:50:21
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