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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD脂质膜序列参数是怎么一回事？
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yylcx

金虫 (正式写手)

[求助] NAMD脂质膜序列参数是怎么一回事？

各位前辈大神，烦请帮忙看下：关于脂质膜的重氢序列参数, Scd到底是怎么一回事？其中的角度，已经图中横坐标：carbon atom number 具体是指什么呢
NAMD脂质膜序列参数是怎么一回事？
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1楼 2013-11-19 16:33:40
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29050801

新虫 (小有名气)
是不是要用namd模拟细胞膜？
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个人主页http://cnrdn.com/pXg5
2楼2013-11-19 20:32:17
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yylcx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 29050801 at 2013-11-19 20:32:17
是不是要用namd模拟细胞膜？

不完全是吧，只是简单的POPE膜，是我想计算下在模拟过程中膜的有序性，需要这个参数，可是我看不懂。。。。。
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3楼2013-11-19 20:38:32
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yylcx: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-11-20 08:40:10
ben_ladeng: 金币+2, 谢谢指教 2013-11-20 20:23:14
建议：
1、仔细阅读你看的文献
2、模拟脂质膜，改用gromacs 吧，gromacs手册上的g_order 对这个参数介绍的很详细。
3、carbon atom number  应该是POPE 疏水端的碳原子的序列
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4楼2013-11-19 22:01:46
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yylcx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-11-19 22:01:46
建议：
1、仔细阅读你看的文献
2、模拟脂质膜，改用gromacs 吧，gromacs手册上的g_order 对这个参数介绍的很详细。
3、carbon atom number  应该是POPE 疏水端的碳原子的序列

好的，多谢多谢
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5楼2013-11-20 08:39:58
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