应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » dispersion在弱相互作用中所占的比重
141/2返回列表12下一页
查看: 1706  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

dongch04

银虫 (正式写手)

[求助] dispersion在弱相互作用中所占的比重

本人刚开始接触量化计算，想请教资深虫虫一个问题：dispersion在计算弱相互作用中所占比重的百分比。最好能有文献支持

目前计算体系中的弱相互作用主要是OH-O氢键，涉及部分CH-Pi相互作用。但计算版本中不含dispersion，如果dispersion所占比重不大就不考虑它的作用了。

如能推荐这方面的资料，也万分感谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

气态分子化学动力学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-11-18 21:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看看作者grimme的文章吧,具体占多少，真的不是很清楚
赞一下 回复此楼
2楼2013-11-18 22:53:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongch04

银虫 (正式写手)
谢谢推荐，认真看了本站诸多大牛的帖子，讨论了一些弱相互作用的计算。由于目前结果已经把b3lyp算完，不想再考虑色散作用重新计算，当初选泛函的时候认为体系主要是羟基间的氢键作用，CH-Pi作用很少，因此想给出一个百分比例说明现有的方法也是可行的。
赞一下 回复此楼
3楼2013-11-18 23:44:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bittersmile

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-11-20 09:19:03
你最好挑一个目前结果中的结构用dft-d重新算一个，不用优化，直接算相互作用，然后和dft比较，不就有一个百分比了么？这样做更能验证你的实例到底dispersion重要不重要。
赞一下 回复此楼
4楼2013-11-19 00:17:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

virtualzx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-11-19 05:19:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by dongch04 at 2013-11-18 10:44:38
谢谢推荐，认真看了本站诸多大牛的帖子，讨论了一些弱相互作用的计算。由于目前结果已经把b3lyp算完，不想再考虑色散作用重新计算，当初选泛函的时候认为体系主要是羟基间的氢键作用，CH-Pi作用很少，因此想给出一个 ...

我也没有数字，如果你不带电荷，色散力在OH...O大概是20-30%的样子，CH-pi的比例要高一些，但是也不好估计，各人算得差别很大。

不过有20%色散力不代表B3LYP就一定会误差20%。色散力的误差和基组造成的误差一般符号相反相互抵消，密度泛函本身也有些不确定性，所以如果运气好可能差的不太多。最好算下单点验证下。
赞一下 回复此楼
5楼2013-11-19 00:25:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongch04

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by bittersmile at 2013-11-19 00:17:07
你最好挑一个目前结果中的结构用dft-d重新算一个，不用优化，直接算相互作用，然后和dft比较，不就有一个百分比了么？这样做更能验证你的实例到底dispersion重要不重要。

我用的gaussian03还不包含dft-d的模块，所以才有这个问题的。
赞一下 回复此楼
6楼2013-11-19 23:29:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongch04

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by virtualzx at 2013-11-19 00:25:53
我也没有数字，如果你不带电荷，色散力在OH...O大概是20-30%的样子，CH-pi的比例要高一些，但是也不好估计，各人算得差别很大。

不过有20%色散力不代表B3LYP就一定会误差20%。色散力的误差和基组造成的误差一般 ...

我也考虑这个具体比例很难给出，因为相较体系不同肯定反映出来的权重也不同，不过如果能有一个统一的范围比例就最好了。

还有我的计算体系中同时含有oh-o和ch-pi，只是oh-o和oh-oh氢键更多些，还有我用的基组算是挺高了，B3LYP/6-311+G(d)加上MP2/6-311++G(d, p)。不知是否会影响到色散作用的比例？
赞一下 回复此楼
7楼2013-11-19 23:36:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

virtualzx

木虫 (著名写手)
★ ★
gkf高: 金币+2 2013-11-20 09:19:15
引用回帖:
7楼: Originally posted by dongch04 at 2013-11-19 10:36:55
我也考虑这个具体比例很难给出，因为相较体系不同肯定反映出来的权重也不同，不过如果能有一个统一的范围比例就最好了。

还有我的计算体系中同时含有oh-o和ch-pi，只是oh-o和oh-oh氢键更多些，还有我用的基组算 ...

6-311+G(d)其实是蛮小的基组，但是你体系太大的话也没什么办法。但我的意思是，基组太大了结果反而差得远，这个大小的基组很可能给你比大基组更好的结果，但是paper上当然不能这么说。你是多大的体系呢？GAMESS也可以做DFT-D3的
赞一下 回复此楼
8楼2013-11-20 07:47:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongch04

银虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by virtualzx at 2013-11-20 07:47:20
6-311+G(d)其实是蛮小的基组，但是你体系太大的话也没什么办法。但我的意思是，基组太大了结果反而差得远，这个大小的基组很可能给你比大基组更好的结果，但是paper上当然不能这么说。你是多大的体系呢？GAMESS也可 ...

我的体系有52个原子，cho。由于计算资源的限制再高的基组算的太慢，并且因为加入了zpe矫正，还有频率计算很耗时间（我算的构型很多）。就是不知道paper上怎么回避这个问题，才考虑能不能加上百分比来说明，看来想找到有根有据的支持是不太可能了
赞一下 回复此楼
9楼2013-11-20 11:16:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

virtualzx

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by dongch04 at 2013-11-19 22:16:25
我的体系有52个原子，cho。由于计算资源的限制再高的基组算的太慢，并且因为加入了zpe矫正，还有频率计算很耗时间（我算的构型很多）。就是不知道paper上怎么回避这个问题，才考虑能不能加上百分比来说明，看来想找 ...

其实你可以在gamess下做单点DFT-D，和你本来的单点计算的相互作用能对比一下，不一定要重新做zpe，这样应该不会太费时间
赞一下 回复此楼
10楼2013-11-20 11:29:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dongch04 的主题更新
141/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 3/150 2026-11-10 01:40 by FChKX8meu1ds
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 4/200 2026-11-10 01:29 by FChKX8meu1ds
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 延安大学回应“副教授留绝笔信”：确已离世，正核实举报内容 +3 yexuqing 2026-11-04 5/250 2026-11-07 13:22 by 苏东坡二世
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭