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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » dispersion在弱相互作用中所占的比重
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dongch04

银虫 (正式写手)

[求助] dispersion在弱相互作用中所占的比重

本人刚开始接触量化计算，想请教资深虫虫一个问题：dispersion在计算弱相互作用中所占比重的百分比。最好能有文献支持

目前计算体系中的弱相互作用主要是OH-O氢键，涉及部分CH-Pi相互作用。但计算版本中不含dispersion，如果dispersion所占比重不大就不考虑它的作用了。

如能推荐这方面的资料，也万分感谢！
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1楼 2013-11-18 21:36:22
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看看作者grimme的文章吧,具体占多少，真的不是很清楚
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2楼2013-11-18 22:53:55
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dongch04

银虫 (正式写手)
谢谢推荐，认真看了本站诸多大牛的帖子，讨论了一些弱相互作用的计算。由于目前结果已经把b3lyp算完，不想再考虑色散作用重新计算，当初选泛函的时候认为体系主要是羟基间的氢键作用，CH-Pi作用很少，因此想给出一个百分比例说明现有的方法也是可行的。
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3楼2013-11-18 23:44:38
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bittersmile

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-11-20 09:19:03
你最好挑一个目前结果中的结构用dft-d重新算一个，不用优化，直接算相互作用，然后和dft比较，不就有一个百分比了么？这样做更能验证你的实例到底dispersion重要不重要。
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4楼2013-11-19 00:17:07
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virtualzx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-11-19 05:19:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by dongch04 at 2013-11-18 10:44:38
谢谢推荐，认真看了本站诸多大牛的帖子，讨论了一些弱相互作用的计算。由于目前结果已经把b3lyp算完，不想再考虑色散作用重新计算，当初选泛函的时候认为体系主要是羟基间的氢键作用，CH-Pi作用很少，因此想给出一个 ...

我也没有数字，如果你不带电荷，色散力在OH...O大概是20-30%的样子，CH-pi的比例要高一些，但是也不好估计，各人算得差别很大。

不过有20%色散力不代表B3LYP就一定会误差20%。色散力的误差和基组造成的误差一般符号相反相互抵消，密度泛函本身也有些不确定性，所以如果运气好可能差的不太多。最好算下单点验证下。
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5楼2013-11-19 00:25:53
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dongch04

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by bittersmile at 2013-11-19 00:17:07
你最好挑一个目前结果中的结构用dft-d重新算一个，不用优化，直接算相互作用，然后和dft比较，不就有一个百分比了么？这样做更能验证你的实例到底dispersion重要不重要。

我用的gaussian03还不包含dft-d的模块，所以才有这个问题的。
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6楼2013-11-19 23:29:25
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dongch04

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by virtualzx at 2013-11-19 00:25:53
我也没有数字，如果你不带电荷，色散力在OH...O大概是20-30%的样子，CH-pi的比例要高一些，但是也不好估计，各人算得差别很大。

不过有20%色散力不代表B3LYP就一定会误差20%。色散力的误差和基组造成的误差一般 ...

我也考虑这个具体比例很难给出，因为相较体系不同肯定反映出来的权重也不同，不过如果能有一个统一的范围比例就最好了。

还有我的计算体系中同时含有oh-o和ch-pi，只是oh-o和oh-oh氢键更多些，还有我用的基组算是挺高了，B3LYP/6-311+G(d)加上MP2/6-311++G(d, p)。不知是否会影响到色散作用的比例？
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7楼2013-11-19 23:36:55
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virtualzx

木虫 (著名写手)
★ ★
gkf高: 金币+2 2013-11-20 09:19:15
引用回帖:
7楼: Originally posted by dongch04 at 2013-11-19 10:36:55
我也考虑这个具体比例很难给出，因为相较体系不同肯定反映出来的权重也不同，不过如果能有一个统一的范围比例就最好了。

还有我的计算体系中同时含有oh-o和ch-pi，只是oh-o和oh-oh氢键更多些，还有我用的基组算 ...

6-311+G(d)其实是蛮小的基组，但是你体系太大的话也没什么办法。但我的意思是，基组太大了结果反而差得远，这个大小的基组很可能给你比大基组更好的结果，但是paper上当然不能这么说。你是多大的体系呢？GAMESS也可以做DFT-D3的
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8楼2013-11-20 07:47:20
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dongch04

银虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by virtualzx at 2013-11-20 07:47:20
6-311+G(d)其实是蛮小的基组，但是你体系太大的话也没什么办法。但我的意思是，基组太大了结果反而差得远，这个大小的基组很可能给你比大基组更好的结果，但是paper上当然不能这么说。你是多大的体系呢？GAMESS也可 ...

我的体系有52个原子，cho。由于计算资源的限制再高的基组算的太慢，并且因为加入了zpe矫正，还有频率计算很耗时间（我算的构型很多）。就是不知道paper上怎么回避这个问题，才考虑能不能加上百分比来说明，看来想找到有根有据的支持是不太可能了
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9楼2013-11-20 11:16:25
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virtualzx

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by dongch04 at 2013-11-19 22:16:25
我的体系有52个原子，cho。由于计算资源的限制再高的基组算的太慢，并且因为加入了zpe矫正，还有频率计算很耗时间（我算的构型很多）。就是不知道paper上怎么回避这个问题，才考虑能不能加上百分比来说明，看来想找 ...

其实你可以在gamess下做单点DFT-D，和你本来的单点计算的相互作用能对比一下，不一定要重新做zpe，这样应该不会太费时间
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10楼2013-11-20 11:29:45
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