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匿名

用户注销 (著名写手)
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1楼 2013-11-15 08:53:25
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
simeilian: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-11-24 22:02:25
你用dfix限制相邻两个原子的距离到正常值，例如：dfix c1 c2 1.5
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2楼2013-11-15 14:37:13
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liuhouting

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
simeilian: 金币+5 2013-11-24 22:02:48
首先检测空间群是否错误，晶体空间群错误的情况容易出现精修不稳地和散架。
如果没有错误就要dfix限定精修了
命令格式如下：
dfix 键长 偏移误差 原子对
例如：苯环C=C键
dfix 1.34 0.02 C1 C2
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3楼2013-11-15 17:48:32
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yuezhifang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
simeilian: 金币+2 2013-11-24 22:02:52
看一下是否衍射强度不够，如果在5以下就重新收数据吧
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4楼2013-11-16 16:40:52
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匿名

用户注销 (著名写手)
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5楼2013-11-24 22:06:48
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sufeng1788

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by simeilian at 2013-11-24 22:06:48
我现在只是限定了健长，我的无序是没有配位的羧基，其中不对称单元中有一个碳，两个O，然后grow之后会出现两个C，三个O，是不是C和O都是无序的，这种情况我怎么设Part1 和Part2呀...

你在一个原子坐标上定两个原子，分配占有度，然后grow删除其一个坐标原子
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6楼2013-11-25 22:07:48
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