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lvubaby

木虫 (正式写手)

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专业: 传热传质学

[求助] sio2模型建立不正确

不是材料专业，对二氧化硅的结构也不是很熟悉。按别人的过程，在lammps 中建立a晶体二氧化硅的结构，采用create_atoms命令生成原子坐标，可是生成的单元中Si原子与O原子的比例不是1:2啊。按下面的文件生成的结果是340个Si原子和675个O原子。求助各位大神帮忙帮忙解释一下，感激不尽。。。
units       metal
dimension    3
boundary       p p p
atom_style       charge

# Atom definition
lattice       custom 5.4054 &
         a1 0.9095 0.0000 0.0000 &
            a2 -0.4547 0.7876 0.0000 &
         a3 0.0000 0.0000 1.0000 &
            basis 0.4697 0.0000 0.0000 basis 0.0000 0.4697 0.6667 basis 0.5303 0.5303 0.3333 basis 0.4135 0.2669 0.1191 basis 0.2669 0.4135 0.5475 basis 0.7331 0.1466 0.7857 basis 0.5865 0.8534 0.2142 basis 0.8534 0.5865 0.4524 basis 0.1466 0.7331 0.8809

region       simbox block 0 3 0 5 0 5 units lattice

create_box       2 simbox
create_atoms 1 box basis 1 1 basis 2 1 basis 3 1 &
            basis 4 2 basis 5 2 basis 6 2 &
            basis 7 2 basis 8 2 basis 9 2
mass       1 28.0855
mass          2 15.9994

group          siliconatoms type 1
group          oxygenatoms type 2

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海风吹

1楼 2013-11-09 23:55:28

已阅关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

向东1988

金虫 (小有名气)

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引用回帖:

12楼: Originally posted by lvubaby at 2013-11-14 17:03:32
加了个库仑力...

能把势函数那块贴出来吗？我自己写的老是出现错误。

pair_style buck/coul/long 8.0

pair_coeff 1 1 buck 0.0 99 0.0

pair_coeff 1 2 buck 18003.7572 0.2052 133.5381

pair_coeff 2 2 buck 1388.7730 0.3623 175.0

kspace_style ewald/n 1.0e-5