| 查看: 1584 | 回复: 14 | ||
| 【奖励】 本帖被评价10次，作者wjmed增加金币 9.5 个 | ||
| 当前主题已经存档。 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[资源]
分子对接软件HEX介绍
|
||
|
在前些日子发了一个AutoDock的使用札记 见 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=644156 一时手痒，再次把HEX使用方法总结放在这里。如果大家支持，我会逐渐把自己的软件使用心得拿出来给大家共享的。 HEX是运行在各个平台的分子对接软件，主要用于考察大分子之间的相互作用，对学术用户免费。 下载： http://www.csd.abdn.ac.uk/hex/ 分为如下几个版本： windows sgi linux（rh9） linux（fc4） －－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－ HEX的安装 对于linux（fc4）版本安装，需要文件： hex-4e-rt.tgz 数据文件，各个平台都需要 hex-4e-lnx-fc4.tgz 可执行文件，用于intel fc4平台。 对于readme中提到的hex_configure.bin文件，其实是调用上述两个文件，所以手动安装的情况下不需要该文件。 #cd /usr/local #mkdir hex #tar zxvf 路径/hex-4e-lnx-fc4.tgz 释放出exe目录，其中有两个可执行文件。 #tar zxvf 路径/hex-4e-rt.tgz 释放出其他目录。 #vi /etc/bashrc 编辑/etc/bashrc文件，添加如下信息： export HEX_ROOT = /usr/local/hex # required #export HEX_PDB= /home/dritchie/pdb #export HEX_MACROS= #export HEX_COLOUR= #export HEX_DATA= export HEX_CACHE= /tmp/hex_cache export HEX_STARTUP= $HEX_ROOT/examples/startup.mac export HEX_CPUS= 2 export HEX_MESSAGES= yes export HEX_STEREO= yes PATH = $PATH:$HEX_ROOT/bin :wq 保存退出。 安装完毕。 －－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－ 使用非常简单，图形界面，分别输入两个蛋白，然后运行就可以了。 [ Last edited by wjmed on 2007-12-14 at 09:01 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
重庆交大26年硕士生招生拟调剂通知已出！欢迎加入光子学微结构与器件课题组。
已经有0人回复
-
UJN物理学专业调剂
已经有12人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有129人回复
-
北京纳米能源与系统研究所王中林院士/曹南颖研究员课题组招收2026硕士研究生1名
已经有0人回复
-
山西大同大学物理学硕士研究生招收调剂生
已经有0人回复
-
[调剂信息]211智能人工感知方向国家青年特聘专家课题组招收调剂研究生
已经有0人回复
-
［调剂信息］211智能人工感知方向国家青年特聘专家课题组招收调剂研究生
已经有0人回复
-
[调剂信息]211智能人工感知方向国家青年特聘专家课题组招收调剂研究生
已经有0人回复
-
一志愿物理所凝聚态物理352求调剂
已经有0人回复
-
0702一志愿吉大B区求调剂 本科期间发表一篇Sci
已经有1人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
8楼2007-12-16 19:54:45
2楼2007-12-14 09:06:37
3楼2007-12-14 11:12:51
4楼2007-12-14 11:45:20
5