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请教大家,对称性高,理论加氢后精修不了,该如何处理?
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rglin
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请教大家,对称性高,理论加氢后精修不了,该如何处理?
P4/ncc空间群的,在XP中grow后,用hadd命令加氢后,精修不了,该如何处理?
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2013-11-05 11:11:32
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首先加氢后精修不了,是提示为什么无法精修?
第一,最大的可能,指认错了原子,重新指认.
第二,原子序号有冲突,只需要edit修改一下就行
第三,有可能grow之后,未fuse处理.
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2013-11-05 16:20:02
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rglin
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引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
huangxishan13
at 2013-11-05 16:20:02
首先加氢后精修不了,是提示为什么无法精修?
第一,最大的可能,指认错了原子,重新指认.
第二,原子序号有冲突,只需要edit修改一下就行
第三,有可能grow之后,未fuse处理.
提示是**Bad Afix connectivity:N1 Bonds to C8**
[
Last edited by rglin on 2013-11-6 at 06:28
]
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3楼
2013-11-05 18:08:07
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2014-04-27 22:24:34
主要问题是后面一个,你的热椭球估计很大
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2013-11-05 21:40:46
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估计有的原子上氢加多了吧?
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2013-11-18 06:47:22
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2014-04-27 22:24:41
试试用查夫列加氢,也可能是键长不合理
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6楼
2013-12-20 09:52:34
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