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jmcookie

金虫 (小有名气)

[求助] KEGG Mapper 已有1人参与

小弟现在在做基因组代谢网络，现有个问题想请教各位大虫，就是我把我建立的代谢网络粗模型（储存在excel的文件）如何利用KEGG Mapper将其可视化，便于我查找Gap？还有就是excel数据如何转换成SBML语言格式的文件？最好各位具体点说，小弟在此不胜感激，对合适的答案小弟愿意继续追加金币。

[ Last edited by jmcookie on 2013-11-5 at 10:53 ]
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1楼 2013-11-05 10:52:04
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libranjie

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
jmcookie: 金币+1, ★有帮助, 非常感谢 2013-12-26 19:08:19
http://www.genome.jp/kegg/tool/map_pathway2.html
如果你输入了合适的可以识别的ID，例如KO编号，加颜色，将基因组的基因对应的KO编号输入KEGG就会得到图片，
其中存在的呈色彩，不通、不存在的用黑色表示。
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5楼2013-12-26 16:54:32
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yechao0911

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
jmcookie: 金币+1 2013-11-30 08:11:07
哥们哪个学校的？怎么那么多人开始搞代谢网络了
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2楼2013-11-29 22:03:09
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jmcookie

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yechao0911 at 2013-11-29 22:03:09
哥们哪个学校的？怎么那么多人开始搞代谢网络了

就是带着做做，丰富哈内容，不过这代谢网络还真是有些麻烦，你做过这个没？
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3楼2013-11-30 08:11:18
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yechao0911

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jmcookie at 2013-11-30 08:11:18
就是带着做做，丰富哈内容，不过这代谢网络还真是有些麻烦，你做过这个没？...

略懂点
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4楼2013-11-30 16:22:35
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