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jmcookie

金虫 (小有名气)

[求助] KEGG Mapper 已有1人参与

小弟现在在做基因组代谢网络,现有个问题想请教各位大虫,就是我把我建立的代谢网络粗模型(储存在excel的文件)如何利用KEGG Mapper将其可视化,便于我查找Gap?还有就是excel数据如何转换成SBML语言格式的文件?最好各位具体点说,小弟在此不胜感激,对合适的答案小弟愿意继续追加金币。

[ Last edited by jmcookie on 2013-11-5 at 10:53 ]
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libranjie

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


jmcookie: 金币+1, 有帮助, 非常感谢 2013-12-26 19:08:19
http://www.genome.jp/kegg/tool/map_pathway2.html
如果你输入了合适的可以识别的ID,例如KO编号,加颜色,将基因组的基因对应的KO编号输入KEGG就会得到图片,
其中存在的呈色彩,不通、不存在的用黑色表示。
5楼2013-12-26 16:54:32
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yechao0911

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


jmcookie: 金币+1 2013-11-30 08:11:07
哥们哪个学校的?怎么那么多人开始搞代谢网络了
2楼2013-11-29 22:03:09
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jmcookie

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yechao0911 at 2013-11-29 22:03:09
哥们哪个学校的?怎么那么多人开始搞代谢网络了

就是带着做做,丰富哈内容,不过这代谢网络还真是有些麻烦,你做过这个没?
3楼2013-11-30 08:11:18
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yechao0911

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jmcookie at 2013-11-30 08:11:18
就是带着做做,丰富哈内容,不过这代谢网络还真是有些麻烦,你做过这个没?...

略懂点
4楼2013-11-30 16:22:35
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