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小弟现在在做基因组代谢网络，现有个问题想请教各位大虫，就是我把我建立的代谢网络粗模型（储存在excel的文件）如何利用KEGG Mapper将其可视化，便于我查找Gap？还有就是excel数据如何转换成SBML语言格式的文件？最好各位具体点说，小弟在此不胜感激，对合适的答案小弟愿意继续追加金币。 [ Last edited by jmcookie on 2013-11-5 at 10:53 ] |
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3楼2013-11-30 08:11:18
yechao0911
木虫 (正式写手)
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- 专业: 系统生物学
2楼2013-11-29 22:03:09
yechao0911
木虫 (正式写手)
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4楼2013-11-30 16:22:35
libranjie
木虫 (小有名气)
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- 专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
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jmcookie: 金币+1, ★有帮助, 非常感谢 2013-12-26 19:08:19
jmcookie: 金币+1, ★有帮助, 非常感谢 2013-12-26 19:08:19
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http://www.genome.jp/kegg/tool/map_pathway2.html 如果你输入了合适的可以识别的ID，例如KO编号，加颜色，将基因组的基因对应的KO编号输入KEGG就会得到图片， 其中存在的呈色彩，不通、不存在的用黑色表示。 |
5楼2013-12-26 16:54:32