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ky96998

金虫 (小有名气)

[交流] 请教3D-QSAR分子叠合的问题

用surflexx分子对接的方法对样本进行叠合来获得分子的构象,样本的对接结果和晶体结构中配体的构象很相似,而且将对接的分子构象全部导出,叠合的很好。但是做活性和对接打分的相关性分析,相关性几乎为零,在COMFA中交叉验证的q2值为-0.487,为什么对接的很好,而q2值反而很差呢,相关性也很差呢?是不是对接方法不妥?这种情况该怎么解决呢?
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zxl102623

银虫 (正式写手)


小红豆(金币+1,VIP+0):3q!优秀!!
你检查一下看分子是不是都在网格点中呢?也或者是你的分子的活性值不好?
2楼2007-12-12 09:26:30
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