24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 786  |  回复: 8
当前主题已经存档。

csfn

荣誉版主 (知名作家)

优秀超版优秀版主优秀区长

[交流] 【讨论】关于量化软件中原子的能量定义的问题

最近在做报告的时候,有人提问,为什么用dmol算出来原子的能量会那么大,原子的能量是怎么定义的?dmol算出来,比如Ti原子的能量有-863.3838261 Ha,也就是23492.6739eV,这个能量是相当大的。量子力学里面,原子的能量应该是包含原子核的能量和电子的能量,考虑近似原子核几乎可以认为静止,能量就只要考虑运动的电子,电子包含动能项,势能项,以及考虑自旋的能量,那么这个考虑电子所带来的能量就不会很大,但是dmol算出来的单个原子的能量就很大~~  从dmol对总能定义来看,他是考虑了无相互作用粒子的动能,库仑作用产生的静电能以及多体贡献的交换关联能。这个能量为什么也会这么大了?又没有存在质量亏损?
在vasp里面能量是怎么定义的了?或者您现在用的或者熟悉的软件里面原子的能量是怎么定义的了?
请大家指点下~~


[ Last edited by csfn on 2008-1-10 at 09:30 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

acridine

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
大概说一下
之前也没太注意过这个问题,看了楼主的帖子自己试了一下
用DMOL算的
首先计算了一个H氢原子,得到的能量大概为0.49 Ha.,而我们知道0.5 Ha 正好是氢原子核外电子轨道能量,因此Dmol算的应该是体系电子的总能量
之后有试了Ti原子,能量确实很大,但仔细观察结果文件会发现由于采用的是全电子计算,因此内层的电子的能量也考虑进去了,因此总能量会很低
如果选择赝势计算得到的总能量就会较小
2楼2007-12-08 12:04:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

carlon

金虫 (小有名气)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版。
能量=动能+势能+交换相关能
其中交换相关能主要用LDA和GGA等各种泛函(如PBE、PW91等)近似估计。
势能则包含电子-核、电子-电子的相互作用
dmol中计算的能量很大,是因为dmol用的是全电子的方法,
也就是体系中所有电子的能量都包含进去,所以体系的能量很大
而CASTEP中则是赝势的方法,不考虑内层电子的能量,所以计算的能量绝对值小很多。
dmol也可以不用全电子的方法计算,比如选择effective core potential处理core的话能量的绝对值应该会减小。
3楼2007-12-08 13:16:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spur

金虫 (正式写手)

谢谢楼上的讲解!!
我也想掺和一下
同样是采用赝势方法,而且渊源颇深的两个软件castep也vasp,怎么对同一个体系计算的总能也不一样呢?虽然只讨论总能没有多大意义,但这个区别究竟来自于何处?
望高人指点!!
4楼2007-12-08 19:46:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

carlon

金虫 (小有名气)

★ ★
spur(金币+2,VIP+0):谢谢解惑!!欢迎常来!! :)
第一:即使都采用赝势的方法,算出能量还是有很大差别,主要是不同的赝势采用了不同的初始价电子构型,比如castep中Ti原子用超软赝势时,价电子构型是3s23p63d24s2,如果是模守恒赝势,则是3d24s2,没有包含3s23p6半核态(semi-core states),这样最后能量也就会不同。另外对于赝势,可以根据自己需要产生,比如用fhipp98软件,这样自己也可以根据需要选择不同的初始价电子构型。
VASP和CASTEP中能量不同,可能是由于赝势文件差别导致。
第二:如果赝势都相同,可能XC交换相关能的估算也可以导致差别,
比如用lda还是gga泛函等。。

[ Last edited by carlon on 2007-12-8 at 20:34 ]
5楼2007-12-08 20:33:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gkd_0000

新虫 (正式写手)

illuminating!!! 谢谢carlon
成功地证实种种大胆的设想和揣测,这难道不正说明我们毕生的工作是无可非议和值得自豪的吗?--柯南道尔
6楼2007-12-22 14:30:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gkd_0000

新虫 (正式写手)

VASP里可以自己设定U值吗?castep好像不可以
成功地证实种种大胆的设想和揣测,这难道不正说明我们毕生的工作是无可非议和值得自豪的吗?--柯南道尔
7楼2007-12-22 14:33:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzgyb

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫警察局局长

优秀版主

浅谈分子总能量问题

★ ★ ★
csfn(金币+3,VIP+0):谢谢您的参与~
在HFSCF方法计算中,体系采取固定核近似后,体系的哈密顿算符分为电子哈密顿和核哈密顿两部分,电子哈密顿分为三部分,电子动能,电子间斥能,及核电排斥,通过单电子近似,得到单电子的HF方程,自洽场的结果得到了电子的能量.核哈密顿分为两部分,核动能及排斥,由于核固定动能为零,只剩下一项,因此体系的能量就是电子能量加上核斥能,,这就是我们计算得到的分子总能量,因为分子在OK时仍在平衡位置振动,要加上零点校正.最后结果即例子中的:
       Sum of electronic and zero-point Energies=   -113.837130
   在分子的热力学计算中,包括了零点能的输出,零点能是对分子的电子能量的矫正,计算了在0K温度下的分子振动能量.但我们计算的热力学数据并不总是在OK时,为了计算在较高温度下的能量,内能也要考虑到总能量中,它包括平动能,转动能,和振动能.注意在计算内能的时候,已经考虑了零点能.下面是一个计算实例
Temperature 298.15 Kelvin.    Pressure  1.0000 Atm.
Zero-point correction=                          0.029201
Thermal corection to Energy=                    0.032054
Thermal correction to Enthalpy=                 0.032999
Thermal correction to Gibbs Free Energy=        0.008244
Sum of electronic and zero-point Energies=   -113.837130
Sum of electronic and thermal Energies=      -113.834277
Sum of electronic and thermal Enthalpies=    -113.833333
Sum of electronic and thermal Free Energies= -113.858087
后面四行的四个能量分别为E0, E, H, G. 计算为
E0=E(elec) + ZPE
E=E0 + E(vib) + E(rol) + E(transl)
H=E + RT
G=H - TS
   上例是在298.15K和1.0Atm下计算的热力学状态函数,EO即我们的分子体系总能量,而在求298.15K下的内能E时,要加上平动能,转动能,和振动能,由统计热力学知,这三项处于激发能级,注意这里的ZPE实际上就是对应E(vib)在OK时的能量,但现在并非0K,有关能量随温度变化公式可参考统计热力著作,最后得到的E就是平常所指的内能U,这正是统计热力学中对内能的定义.对H,G状态函数,不再叙述.
  由于本版无法上传公式,还请见谅,有关内容请参看相关著作.
江南七怪+马玉+洪七公+一灯大师+周伯通教一个弱智儿童=郭靖,天下第一王重阳教七个天资不错的小孩=全真七子,全真七子×3《郭靖,这就是盲目扩招的后果
8楼2008-01-04 15:21:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小笨虫

局长大人
算过渡态要进行零点修正吗
9楼2008-01-04 21:46:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 csfn 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见