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shan-sa

金虫 (正式写手)

[求助] 植物表达蛋白,能看到荧光,westernblot 却杂不出来,为什么?

在植物体中,表达了一个融合GFP的蛋白,看荧光是有的,然后取样做western,却杂不出来,阳性对照能杂出来,请问大家有没有遇到这种情况?
我把头皮想破了还是想不出为什么....谢谢!
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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kx444555: 金币+4, 鼓励交流 2013-10-23 10:38:19
最可能的一种情况,目的蛋白质与GFP共价连接后的新的蛋白质的空间结构发生了改变,GFP那部分还是天然构象,但是目的蛋白的表位因为目地蛋白质折叠异常或者因为GFP形成的空间位阻使得抗原表位被遮盖。可以用蛋白质的三维结构预测软件预测一下目的蛋白质与GFP共价连接后的新的蛋白质的空间结构,看看目的蛋白质的构象与天然构象是不是发生了改变。

目的蛋白质与GFP共价连接之间的肽链也该是数个亲水的氨基酸残基,这样对于目的蛋白质与GFP各自的折叠影响较小。
4楼2013-10-23 10:16:28
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feichen2008

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-23 10:38:14
有没有做阴性对照,看荧光阴性对照很重要,很有可能是自发荧光,植物都有自发荧光
2楼2013-10-22 10:31:45
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shan-sa

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by feichen2008 at 2013-10-22 10:31:45
有没有做阴性对照,看荧光阴性对照很重要,很有可能是自发荧光,植物都有自发荧光

谢谢关注~阴性阳性都有。而且可以确定是荧光。
3楼2013-10-23 08:46:42
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zhouxiaofei

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-23 10:38:23
是不是蛋白变性不完全,理论上蛋白在做跑page胶的时候都不存在二级结构的。
5楼2013-10-23 10:26:55
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