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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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yelverxm

金虫 (小有名气)

[交流] 求教高维QSAR

刚发现计算机模拟的板块，药物设计版面竟然没有贴啊。

我就发个问题请教下各位高手吧

本人最近正在学习4DQSAR，但是主要想利用4D的技术做个QSPR模型，但不知道采样的那些程序有现成的可利用的吗？

如果现编的话，本人还是有一定困难的啰
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In God we trust
1楼 2007-12-07 01:32:38
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luai071

木虫 (著名写手)
★
小红豆(金币+1,VIP+0):感谢分享！辛苦了！
高维的QSAR我认为很大程度上还是概念性的，没有得到全面认可和普遍应用，如果想找已有的算法或程序的话，可以从查阅文献入手。
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2楼2007-12-07 12:21:50
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yelverxm

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by luai071 at 2007-12-7 12:21:
高维的QSAR我认为很大程度上还是概念性的，没有得到全面认可和普遍应用，如果想找已有的算法或程序的话，可以从查阅文献入手。

我也觉得高维QSAR没有得到广泛认同，想Hopfinger提出4DQSAR之后，发的20多篇文章绝大部分还是他自己写的……

但是我觉得其作为一种解决构象敏感的方法，可以试下。

还得看论文去呀^^
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In God we trust
3楼2007-12-08 02:11:47
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luai071

木虫 (著名写手)
是啊，前沿东西一定得靠自学，往往“权威”也不懂
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4楼2007-12-10 14:22:00
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

呵呵，5D QSAR都已经出来喽

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，希望继续关注计算模拟版
Sylvie Ducki, Grant Mackenzie, Nicholas J. Lawrence, and James P. Snyder
Quantitative Structure-Activity Relationship (5D-QSAR) Study of Combretastatin-like Analogues as Inhibitors of Tubulin Assembly
J. Med. Chem., 48 (2), 457-465, 2005.

Vedani A, Dobler M.
5D-QSAR: the key for simulating induced fit?
J Med Chem. 2002. 45(11):2139-2149

Vedani A, Dobler M, Dollinger H, Hasselbach KM, Birke F, Lill MA.
Novel ligands for the chemokine receptor-3 (CCR3): a receptor-modeling study based on 5D-QSAR.
J Med Chem. 2005. 48(5):1515-1527
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5楼2007-12-10 22:11:55
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yelverxm

金虫 (小有名气)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，希望继续关注计算模拟版
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2007-12-10 22:11:
Sylvie Ducki, Grant Mackenzie, Nicholas J. Lawrence, and James P. Snyder
Quantitative Structure-Activity Relationship (5D-QSAR) Study of Combretastatin-like Analogues as Inhibitors of Tubu ...

查了文献，其实6D的都出来了，但是，由于做的是QSPR模型，不需要考虑受体信息，所以只打算用4D的来消除构象选择所造成的误差。

目前只是设想，还请多多指教啊
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In God we trust
6楼2007-12-11 02:50:14
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yelverxm

金虫 (小有名气)

未来QSAR的方向

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，希望继续关注计算模拟版
我个人的见解未来的QSAR发展应该还集中在两方面：

1.基于受体的QSAR模型，即RD-QSAR；
2.结构表征，即更有效描述子的构建；

偶今年大四，想尽量认清楚未来的发展趋势，谢谢大家指导啊，嘿嘿
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In God we trust
7楼2007-12-11 03:10:27
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