24小时热门版块排行榜    

查看: 4512  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

123just

金虫 (正式写手)

[求助] 优化出错了,Linear angle in Bend. Error //g09/l103.exe

优化出错了,Linear angle in Bend.
Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l103.exe
用chemoffice 建模,分子画上去之后坐标都是默认的,没有改动过,求帮帮给看一下应该怎么写输入语句呢

%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\1.chk
#p opt rhf/6-31g geom=nocrowd  scf=(maxcyc=1025)

Title Card Required

0 1
C                 -2.96270000   -2.38740000    1.97270000
C                 -3.39150000   -3.20370000    0.93130000
C                 -2.66350000   -3.25830000   -0.25990000
C                 -1.48900000   -2.50100000   -0.43420000
C                 -1.09260000   -1.65540000    0.61660000
C                 -1.81180000   -1.61900000    1.81730000
C                 -0.77380000   -2.59470000   -1.76620000
O                  0.04740000   -0.89260000    0.58230000
C                  0.73490000   -2.63860000   -1.71900000
C                  1.41290000   -3.86570000   -1.69350000
C                  2.80950000   -3.90290000   -1.67320000
C                  3.54450000   -2.71720000   -1.67700000
C                  2.88490000   -1.48960000   -1.68660000
C                  1.48990000   -1.45540000   -1.68660000
O                  0.86580000   -0.23230000   -1.68660000
C                  0.89560000    3.56830000   -3.14220000
C                  0.58810000    4.90000000   -2.86400000
C                  0.03940000    5.24570000   -1.62910000
C                 -0.20180000    4.25970000   -0.67250000
C                  0.10570000    2.92800000   -0.95070000
C                  0.65440000    2.58230000   -2.18560000
C                 -0.79070000    4.63080000    0.65280000
O                 -0.12870000    1.97010000   -0.02140000
C                 -0.94860000    3.40080000    1.49150000
C                 -1.48110000    3.49690000    2.77700000
C                 -1.62810000    2.35090000    3.55850000
C                 -1.24260000    1.10880000    3.05430000
C                 -0.71020000    1.01270000    1.76870000
C                 -0.56310000    2.15870000    0.98730000
O                 -0.04580000    2.06540000   -0.26160000
P                  0.22730000    0.42810000   -0.34360000
C                 -1.34070000   -0.74890000    2.94080000
C                 -0.76130000   -1.61940000    4.04810000
C                 -2.51390000    0.05430000    3.48680000
C                 -0.26750000    0.20390000    2.43090000
C                  0.98450000    1.15300000   -2.48430000
C                  1.56600000    1.04910000   -3.88810000
C                 -0.28100000    0.31050000   -2.39460000
C                  2.00470000    0.64450000   -1.47420000
C                  0.84680000    5.95830000   -3.89080000
C                  0.42560000    7.31400000   -3.33940000
C                  0.04670000    5.65050000   -5.14950000
C                  2.33160000    5.98750000   -4.22840000
C                 -0.29660000   -0.32040000    1.22760000
C                  0.24750000   -0.14820000   -0.18450000
C                 -1.50110000   -1.25200000    1.19820000
C                  0.78480000   -0.91790000    2.11820000
C                 -4.63380000   -4.02420000    1.08700000
C                 -5.18150000   -4.38160000   -0.28840000
C                 -5.67650000   -3.22510000    1.85750000
C                 -4.30800000   -5.30120000    1.85040000
C                  3.66880000   -0.21430000   -1.69680000
C                  5.15790000   -0.53400000   -1.69460000
C                  3.32270000    0.60410000   -0.45990000
C                  3.32380000    0.58510000   -2.94640000
C                  3.51990000   -5.22040000   -1.64730000
C                  2.60110000   -6.30320000   -2.19760000
C                  3.90540000   -5.56100000   -0.21380000
C                  4.77630000   -5.13800000   -2.50420000
C                 -2.19950000    2.45400000    4.93830000
C                 -2.54050000    1.06130000    5.45170000
C                 -3.46160000    3.30570000    4.90250000
C                 -1.17810000    3.09990000    5.86510000
H                 -3.53000000   -2.34910000    2.91430000
H                 -3.01450000   -3.90530000   -1.07740000
H                 -1.06720000   -1.70720000   -2.37030000
H                 -1.08370000   -3.57210000   -2.19910000
H                  0.84140000   -4.80550000   -1.68930000
H                  4.64400000   -2.75120000   -1.67240000
H                  1.32840000    3.29570000   -4.11610000
H                 -0.20310000    6.29600000   -1.40960000
H                 -0.11520000    5.34800000    1.17060000
H                 -1.78610000    5.10360000    0.49700000
H                 -1.78520000    4.47650000    3.17460000
H                 -1.35860000    0.20510000    3.67050000
H                  0.05670000    2.86400000   -0.80610000
H                  0.09600000   -2.20640000    3.64910000
H                 -1.54560000   -2.31570000    4.42070000
H                 -0.41110000   -0.97250000    4.88340000
H                 -2.93730000    0.69040000    2.67750000
H                 -3.29820000   -0.64200000    3.85930000
H                 -2.16360000    0.70120000    4.32200000
H                 -0.69000000    0.84050000    1.62160000
H                  0.58950000   -0.38310000    2.03130000
H                  0.08200000    0.85020000    3.26690000
H                  2.49080000    1.66480000   -3.95370000
H                  0.82050000    1.42070000   -4.62630000
H                  1.81140000   -0.01350000   -4.11010000
H                 -0.70600000    0.38640000   -1.36870000
H                 -1.02660000    0.68210000   -3.13280000
H                 -0.03560000   -0.75220000   -2.61660000
H                  1.58070000    0.72000000   -0.44790000
H                  2.92930000    1.26060000   -1.53930000
H                  2.24940000   -0.41810000   -1.69710000
H                  1.01040000    7.53900000   -2.41950000
H                 -0.65950000    7.29270000   -3.09260000
H                  0.61800000    8.10080000   -4.10280000
H                  0.35450000    4.65970000   -5.55250000
H                 -1.03840000    5.62910000   -4.90280000
H                  0.23900000    6.43720000   -5.91290000
H                  2.64050000    4.99700000   -4.63150000
H                  2.91650000    6.21180000   -3.30840000
H                  2.52290000    6.77450000   -4.99180000
H                  1.12770000    0.53260000   -0.16300000
H                 -0.54280000    0.28840000   -0.83530000
H                  0.55500000   -1.13940000   -0.58680000
H                 -1.89870000   -1.37780000    2.23010000
H                 -2.29130000   -0.81540000    0.54730000
H                 -1.19360000   -2.24310000    0.79590000
H                  0.38820000   -1.04410000    3.15040000
H                  1.66480000   -0.23670000    2.14010000
H                  1.09160000   -1.90890000    1.71500000
H                 -4.41950000   -4.96560000   -0.85150000
H                 -5.41970000   -3.44840000   -0.84630000
H                 -6.10520000   -4.99170000   -0.17270000
H                 -5.27620000   -2.96390000    2.86260000
H                 -5.91470000   -2.29190000    1.29960000
H                 -6.60020000   -3.83510000    1.97320000
H                 -3.90760000   -5.04110000    2.85570000
H                 -3.54550000   -5.88490000    1.28760000
H                 -5.23220000   -5.91050000    1.96550000
H                  5.41090000   -1.13200000   -2.59850000
H                  5.41000000   -1.11820000   -0.78140000
H                  5.74070000    0.41420000   -1.70220000
H                  2.23450000    0.83770000   -0.46150000
H                  3.57480000    0.01990000    0.45330000
H                  3.90550000    1.55220000   -0.46750000
H                  2.23570000    0.81920000   -2.94900000
H                  3.57620000   -0.01320000   -3.85040000
H                  3.90710000    1.53300000   -2.95310000
H                  2.31940000   -6.05430000   -3.24520000
H                  1.68290000   -6.36340000   -1.57150000
H                  3.12920000   -7.28270000   -2.17840000
H                  4.57680000   -4.76970000    0.18830000
H                  2.98720000   -5.62120000    0.41240000
H                  4.43350000   -6.54050000   -0.19460000
H                  5.44850000   -4.34690000   -2.10290000
H                  4.49460000   -4.88850000   -3.55170000
H                  5.30360000   -6.11790000   -2.48430000
H                 -1.61820000    0.43880000    5.47780000
H                 -3.28690000    0.58920000    4.77430000
H                 -2.96530000    1.13790000    6.47750000
H                 -3.21240000    4.32350000    4.52730000
H                 -4.20800000    2.83370000    4.22520000
H                 -3.88640000    3.38240000    5.92840000
H                 -0.92820000    4.11780000    5.49080000
H                 -0.25560000    2.47780000    5.89080000
H                 -1.60390000    3.17610000    6.89060000

1 2 2.0 6 1.0 64 1.0
2 3 1.0 48 1.0
3 4 2.0 65 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5 6 2.0 8 1.0
6 32 1.0
7 9 1.0 66 1.0 67 1.0
8 31 1.0
9 10 2.0 14 1.0
10 11 1.0 68 1.0
11 12 2.0 56 1.0
12 13 1.0 69 1.0
13 14 2.0 52 1.0
14 15 1.0
15 31 1.0
16 17 2.0 21 1.0 70 1.0
17 18 1.0 40 1.0
18 19 2.0 71 1.0
19 20 1.0 22 1.0
20 21 2.0 23 1.0
21 36 1.0
22 24 1.0 72 1.0 73 1.0
23 31 1.0
24 25 2.0 29 1.0
25 26 1.0 74 1.0
26 27 2.0 60 1.0
27 28 1.0 75 1.0
28 29 2.0 44 1.0
29 30 1.0
30 76 1.0
31
32 33 1.0 34 1.0 35 1.0
33 77 1.0 78 1.0 79 1.0
34 80 1.0 81 1.0 82 1.0
35 83 1.0 84 1.0 85 1.0
36 37 1.0 38 1.0 39 1.0
37 86 1.0 87 1.0 88 1.0
38 89 1.0 90 1.0 91 1.0
39 92 1.0 93 1.0 94 1.0
40 41 1.0 42 1.0 43 1.0
41 95 1.0 96 1.0 97 1.0
42 98 1.0 99 1.0 100 1.0
43 101 1.0 102 1.0 103 1.0
44 45 1.0 46 1.0 47 1.0
45 104 1.0 105 1.0 106 1.0
46 107 1.0 108 1.0 109 1.0
47 110 1.0 111 1.0 112 1.0
48 49 1.0 50 1.0 51 1.0
49 113 1.0 114 1.0 115 1.0
50 116 1.0 117 1.0 118 1.0
51 119 1.0 120 1.0 121 1.0
52 53 1.0 54 1.0 55 1.0
53 122 1.0 123 1.0 124 1.0
54 125 1.0 126 1.0 127 1.0
55 128 1.0 129 1.0 130 1.0
56 57 1.0 58 1.0 59 1.0
57 131 1.0 132 1.0 133 1.0
58 134 1.0 135 1.0 136 1.0
59 137 1.0 138 1.0 139 1.0
60 61 1.0 62 1.0 63 1.0
61 140 1.0 141 1.0 142 1.0
62 143 1.0 144 1.0 145 1.0
63 146 1.0 147 1.0 148 1.0
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
回复此楼
多多和大家探讨电化学的问题
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

123just

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-21 09:29:10
你的分子结构里,粗看了一下,31P和45C,30O和23O,20C和76H, 这些原子互相重叠。
你的分子结构本来就是如此吗?

你好,我这个分子又出错了,改了输入文件,麻烦你帮忙看一下,到底什么情况啊,跑了快十天了,结果Atoms too close.Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l202.exe.  我只想优化一下这个分子,如果可以的话麻烦帮我建一个输入文件吧。非常感谢

%chk=/home/cxw/1-opt.chk
#p opt=cartesian rhf/6-31g geom=(connectivity,nocrowd) scf=maxcyc=1025

Title Card Required

0 1
C                 -2.88308699   -2.54399815    1.94205103
C                 -3.31188699   -3.36029815    0.90065103
C                 -2.58388699   -3.41489815   -0.29054897
C                 -1.36118309   -2.54525071   -0.31823544
C                 -1.12175886   -1.91571891    0.55145747
C                 -1.67161901   -1.78422483    1.67453107
C                 -0.69418699   -2.75129815   -1.79684897
C                  0.81451301   -2.79519815   -1.74964897
C                  1.49251301   -4.02229815   -1.72414897
C                  2.88911301   -4.05949815   -1.70384897
C                  3.62411301   -2.87379815   -1.70764897
C                  2.96451301   -1.64619815   -1.71724897
C                  1.56951301   -1.61199815   -1.71724897
O                  0.94541301   -0.38889815   -1.71724897
C                  0.94627761    3.17998837   -3.31221853
C                  0.63877761    4.51168837   -3.03401853
C                  0.09007761    4.85738837   -1.79911853
C                 -0.15112239    3.87138837   -0.84251853
C                  0.15637761    2.53968837   -1.12071853
C                  0.70507761    2.19398837   -2.35561853
C                 -0.74002239    4.24248837    0.48278147
C                 -0.89792239    3.01248837    1.32148147
C                 -1.43042239    3.10858837    2.60698147
C                 -1.57742239    1.96258837    3.38848147
C                 -1.19192239    0.72048837    2.88428147
C                 -0.65952239    0.62438837    1.59868147
C                 -0.47064494    1.75225019    0.72027200
P                  0.30691301    0.27150185   -0.37424897
C                 -1.20051901   -0.91412483    2.79803107
C                 -0.62111901   -1.78462483    3.90533107
C                 -2.37371901   -0.11092483    3.34403107
C                 -0.12731901    0.03867517    2.28813107
C                  1.03517761    0.76468837   -2.65431853
C                  1.61667761    0.66078837   -4.05811853
C                 -0.23032239   -0.07781163   -2.56461853
C                  2.05537761    0.25618837   -1.64421853
C                  0.89747761    5.56998837   -4.06081853
C                  0.47627761    6.92568837   -3.50941853
C                  0.09737761    5.26218837   -5.31951853
C                  2.38227761    5.59918837   -4.39841853
C                 -0.24592239   -0.70871163    1.05758147
C                  0.14704205   -0.58434391    0.03772285
C                 -0.95770309   -1.25922629    1.04020800
C                  0.67712312   -1.21871689    1.81776673
C                 -4.55418699   -4.18079815    1.05635103
C                 -5.10188699   -4.53819815   -0.31904897
C                 -5.59688699   -3.38169815    1.82685103
C                 -4.22838699   -5.45779815    1.81975103
C                  3.74841301   -0.37089815   -1.72744897
C                  5.23751301   -0.69059815   -1.72524897
C                  3.40231301    0.44750185   -0.49054897
C                  3.40341301    0.42850185   -2.97704897
C                  3.59951301   -5.37699815   -1.67794897
C                  2.68071301   -6.45979815   -2.22824897
C                  3.98501301   -5.71759815   -0.24444897
C                  4.85591301   -5.29459815   -2.53484897
C                 -2.14882239    2.06568837    4.76828147
C                 -2.48982239    0.67298837    5.28168147
C                 -3.41092239    2.91738837    4.73248147
C                 -1.12742239    2.71158837    5.69508147
H                 -3.45038699   -2.50569815    2.88365103
H                 -2.93488699   -4.06189815   -1.10804897
H                 -0.98758699   -1.86379815   -2.40094897
H                 -1.00408699   -3.72869815   -2.22974897
H                  0.92101301   -4.96209815   -1.71994897
H                  4.72361301   -2.90779815   -1.70304897
H                  1.37907761    2.90738837   -4.28611853
H                 -0.15242239    5.90768837   -1.57961853
H                 -0.06452239    4.95968837    1.00058147
H                 -1.73542239    4.71528837    0.32698147
H                 -1.73452239    4.08818837    3.00458147
H                 -1.30792239   -0.18321163    3.50048147
H                  0.23618099   -2.37162483    3.50633107
H                 -1.40541901   -2.48092483    4.27793107
H                 -0.27091901   -1.13772483    4.74063107
H                 -2.79711901    0.52517517    2.53473107
H                 -3.15801901   -0.80722483    3.71653107
H                 -2.02341901    0.53597517    4.17923107
H                  0.56569272   -0.43600148    1.96499514
H                  0.22218099    0.68497517    3.12413107
H                  2.54147761    1.27648837   -4.12371853
H                  0.87117761    1.03238837   -4.79631853
H                  1.86207761   -0.40181163   -4.28011853
H                 -0.61215974   -0.00961997   -1.64290808
H                 -0.97592239    0.29378837   -3.30281853
H                  0.01507761   -1.14051163   -2.78661853
H                  1.63137761    0.33168837   -0.61791853
H                  2.97997761    0.87228837   -1.70931853
H                  2.30007761   -0.80641163   -1.86711853
H                  1.06107761    7.15068837   -2.58951853
H                 -0.60882239    6.90438837   -3.26261853
H                  0.66867761    7.71248837   -4.27281853
H                  0.40517761    4.27138837   -5.72251853
H                 -0.98772239    5.24078837   -5.07281853
H                  0.28967761    6.04888837   -6.08291853
H                  2.69117761    4.60868837   -4.80151853
H                  2.96717761    5.82348837   -3.47841853
H                  2.57357761    6.38618837   -5.16181853
H                  1.02724205    0.09645609    0.05922285
H                 -0.64325795   -0.14774391   -0.61307715
H                  0.45454205   -1.57554391   -0.36457715
H                 -1.74790309   -0.82262629    0.38930800
H                  0.28052312   -1.34491689    2.84996673
H                  1.55712312   -0.53751689    1.83966673
H                  0.98392312   -2.20971689    1.41456673
H                 -4.33988699   -5.12219815   -0.88214897
H                 -5.34008699   -3.60499815   -0.87694897
H                 -6.02558699   -5.14829815   -0.20334897
H                 -5.19658699   -3.12049815    2.83195103
H                 -5.83508699   -2.44849815    1.26895103
H                 -6.52058699   -3.99169815    1.94255103
H                 -3.82798699   -5.19769815    2.82505103
H                 -3.46588699   -6.04149815    1.25695103
H                 -5.15258699   -6.06709815    1.93485103
H                  5.49051301   -1.28859815   -2.62914897
H                  5.48961301   -1.27479815   -0.81204897
H                  5.82031301    0.25760185   -1.73284897
H                  2.31411301    0.68110185   -0.49214897
H                  3.65441301   -0.13669815    0.42265103
H                  3.98511301    1.39560185   -0.49814897
H                  2.31531301    0.66260185   -2.97964897
H                  3.65581301   -0.16979815   -3.88104897
H                  3.98671301    1.37640185   -2.98374897
H                  2.39901301   -6.21089815   -3.27584897
H                  1.76251301   -6.51999815   -1.60214897
H                  3.20881301   -7.43929815   -2.20904897
H                  4.65641301   -4.92629815    0.15765103
H                  3.06681301   -5.77779815    0.38175103
H                  4.51311301   -6.69709815   -0.22524897
H                  5.52811301   -4.50349815   -2.13354897
H                  4.57421301   -5.04509815   -3.58234897
H                  5.38321301   -6.27449815   -2.51494897
H                 -1.56752239    0.05048837    5.30778147
H                 -3.23622239    0.20088837    4.60428147
H                 -2.91462239    0.74958837    6.30748147
H                 -3.16172239    3.93518837    4.35728147
H                 -4.15732239    2.44538837    4.05518147
H                 -3.83572239    2.99408837    5.75838147
H                 -0.87752239    3.72948837    5.32078147
H                 -0.20492239    2.08948837    5.72078147
H                 -1.55322239    2.78778837    6.72058147
O                  0.12199602    0.61151947    0.44827631
O                  0.67757345    1.39101437   -0.15220717
H                 -1.04950199   -0.46508016    1.65995834
H                 -0.59891134   -1.22852890    1.74803961
H                 -0.68119826   -0.35253712    0.15056772
O                 -0.55503393   -1.57588317   -0.86908828
H                  0.94069406   -0.06236818    0.74086641

1 2 2.0 6 1.0 61 1.0
2 3 1.0 45 1.0
3 4 2.0 62 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5 6 2.0 147 1.0
6 29 1.0
7 8 1.0 63 1.0 64 1.0
8 9 2.0 13 1.0
9 10 1.0 65 1.0
10 11 2.0 53 1.0
11 12 1.0 66 1.0
12 13 2.0 49 1.0
13 14 1.0
14 28 1.0
15 16 2.0 20 1.0 67 1.0
16 17 1.0 37 1.0
17 18 2.0 68 1.0
18 19 1.0 21 1.0
19 20 2.0 143 1.0
20 33 1.0
21 22 1.0 69 1.0 70 1.0
22 23 2.0 27 1.0
23 24 1.0 71 1.0
24 25 2.0 57 1.0
25 26 1.0 72 1.0
26 27 2.0 41 1.0
27 142 1.0
28 143 1.0 147 1.0
29 30 1.0 31 1.0 32 1.0
30 73 1.0 74 1.0 75 1.0
31 76 1.0 77 1.0 78 1.0
32 79 1.0 80 1.0 144 1.0
33 34 1.0 35 1.0 36 1.0
34 81 1.0 82 1.0 83 1.0
35 84 1.0 85 1.0 86 1.0
36 87 1.0 88 1.0 89 1.0
37 38 1.0 39 1.0 40 1.0
38 90 1.0 91 1.0 92 1.0
39 93 1.0 94 1.0 95 1.0
40 96 1.0 97 1.0 98 1.0
41 42 1.0 43 1.0 44 1.0
42 99 1.0 100 1.0 101 1.0
43 102 1.0 145 1.0 146 1.0
44 103 1.0 104 1.0 105 1.0
45 46 1.0 47 1.0 48 1.0
46 106 1.0 107 1.0 108 1.0
47 109 1.0 110 1.0 111 1.0
48 112 1.0 113 1.0 114 1.0
49 50 1.0 51 1.0 52 1.0
50 115 1.0 116 1.0 117 1.0
51 118 1.0 119 1.0 120 1.0
52 121 1.0 122 1.0 123 1.0
53 54 1.0 55 1.0 56 1.0
54 124 1.0 125 1.0 126 1.0
55 127 1.0 128 1.0 129 1.0
56 130 1.0 131 1.0 132 1.0
57 58 1.0 59 1.0 60 1.0
58 133 1.0 134 1.0 135 1.0
59 136 1.0 137 1.0 138 1.0
60 139 1.0 140 1.0 141 1.0
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142 148 1.0
143
144
145
146
147
148
多多和大家探讨电化学的问题
4楼2013-11-13 12:43:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:56:54
123just: 金币+3, ★★★很有帮助, 把构型重新整了一下,还是出错了Error in internal coordinate system,L103 2013-10-23 10:16:38
初始构型不合理,

230号O原子与300号O原子几乎重叠了。
31号P和45号C也是。

新手还是要多检查初始构型。
2楼2013-10-21 09:25:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:57:03
123just: 金币+3, ★★★很有帮助, 把构型重新整了一下,还是出错了Error in internal coordinate system,L103 2013-10-23 10:16:53
你的分子结构里,粗看了一下,31P和45C,30O和23O,20C和76H, 这些原子互相重叠。
你的分子结构本来就是如此吗?
3楼2013-10-21 09:29:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2013-11-13 19:36:32
引用回帖:
4楼: Originally posted by 123just at 2013-11-13 12:43:18
你好,我这个分子又出错了,改了输入文件,麻烦你帮忙看一下,到底什么情况啊,跑了快十天了,结果Atoms too close.Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l202.exe.  我只想优化一下这个分子,如 ...

我照你的分子去画画来画去都少了12个原子。。。。你那分子画得看得人眼睛花。。。建议你用GV重新画一个,适当调整一两个二面角让某些看上去很近的原子隔得远一些,然后在优化看看,用nosymm打破对称性试试
5楼2013-11-13 13:41:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +37 医学老男孩 2026-08-13 86/4300 2026-08-18 00:18 by longsantaizi
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +4 基诺咪客 2026-08-17 4/200 2026-08-17 16:10 by Vivilian
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +12 Ldrop2023 2026-08-13 15/750 2026-08-17 15:02 by 小豌豆_发芽
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
信息提示
请填处理意见