24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 4326  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

123just

金虫 (正式写手)

[求助] 优化出错了,Linear angle in Bend. Error //g09/l103.exe

优化出错了,Linear angle in Bend.
Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l103.exe
用chemoffice 建模,分子画上去之后坐标都是默认的,没有改动过,求帮帮给看一下应该怎么写输入语句呢

%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\1.chk
#p opt rhf/6-31g geom=nocrowd  scf=(maxcyc=1025)

Title Card Required

0 1
C                 -2.96270000   -2.38740000    1.97270000
C                 -3.39150000   -3.20370000    0.93130000
C                 -2.66350000   -3.25830000   -0.25990000
C                 -1.48900000   -2.50100000   -0.43420000
C                 -1.09260000   -1.65540000    0.61660000
C                 -1.81180000   -1.61900000    1.81730000
C                 -0.77380000   -2.59470000   -1.76620000
O                  0.04740000   -0.89260000    0.58230000
C                  0.73490000   -2.63860000   -1.71900000
C                  1.41290000   -3.86570000   -1.69350000
C                  2.80950000   -3.90290000   -1.67320000
C                  3.54450000   -2.71720000   -1.67700000
C                  2.88490000   -1.48960000   -1.68660000
C                  1.48990000   -1.45540000   -1.68660000
O                  0.86580000   -0.23230000   -1.68660000
C                  0.89560000    3.56830000   -3.14220000
C                  0.58810000    4.90000000   -2.86400000
C                  0.03940000    5.24570000   -1.62910000
C                 -0.20180000    4.25970000   -0.67250000
C                  0.10570000    2.92800000   -0.95070000
C                  0.65440000    2.58230000   -2.18560000
C                 -0.79070000    4.63080000    0.65280000
O                 -0.12870000    1.97010000   -0.02140000
C                 -0.94860000    3.40080000    1.49150000
C                 -1.48110000    3.49690000    2.77700000
C                 -1.62810000    2.35090000    3.55850000
C                 -1.24260000    1.10880000    3.05430000
C                 -0.71020000    1.01270000    1.76870000
C                 -0.56310000    2.15870000    0.98730000
O                 -0.04580000    2.06540000   -0.26160000
P                  0.22730000    0.42810000   -0.34360000
C                 -1.34070000   -0.74890000    2.94080000
C                 -0.76130000   -1.61940000    4.04810000
C                 -2.51390000    0.05430000    3.48680000
C                 -0.26750000    0.20390000    2.43090000
C                  0.98450000    1.15300000   -2.48430000
C                  1.56600000    1.04910000   -3.88810000
C                 -0.28100000    0.31050000   -2.39460000
C                  2.00470000    0.64450000   -1.47420000
C                  0.84680000    5.95830000   -3.89080000
C                  0.42560000    7.31400000   -3.33940000
C                  0.04670000    5.65050000   -5.14950000
C                  2.33160000    5.98750000   -4.22840000
C                 -0.29660000   -0.32040000    1.22760000
C                  0.24750000   -0.14820000   -0.18450000
C                 -1.50110000   -1.25200000    1.19820000
C                  0.78480000   -0.91790000    2.11820000
C                 -4.63380000   -4.02420000    1.08700000
C                 -5.18150000   -4.38160000   -0.28840000
C                 -5.67650000   -3.22510000    1.85750000
C                 -4.30800000   -5.30120000    1.85040000
C                  3.66880000   -0.21430000   -1.69680000
C                  5.15790000   -0.53400000   -1.69460000
C                  3.32270000    0.60410000   -0.45990000
C                  3.32380000    0.58510000   -2.94640000
C                  3.51990000   -5.22040000   -1.64730000
C                  2.60110000   -6.30320000   -2.19760000
C                  3.90540000   -5.56100000   -0.21380000
C                  4.77630000   -5.13800000   -2.50420000
C                 -2.19950000    2.45400000    4.93830000
C                 -2.54050000    1.06130000    5.45170000
C                 -3.46160000    3.30570000    4.90250000
C                 -1.17810000    3.09990000    5.86510000
H                 -3.53000000   -2.34910000    2.91430000
H                 -3.01450000   -3.90530000   -1.07740000
H                 -1.06720000   -1.70720000   -2.37030000
H                 -1.08370000   -3.57210000   -2.19910000
H                  0.84140000   -4.80550000   -1.68930000
H                  4.64400000   -2.75120000   -1.67240000
H                  1.32840000    3.29570000   -4.11610000
H                 -0.20310000    6.29600000   -1.40960000
H                 -0.11520000    5.34800000    1.17060000
H                 -1.78610000    5.10360000    0.49700000
H                 -1.78520000    4.47650000    3.17460000
H                 -1.35860000    0.20510000    3.67050000
H                  0.05670000    2.86400000   -0.80610000
H                  0.09600000   -2.20640000    3.64910000
H                 -1.54560000   -2.31570000    4.42070000
H                 -0.41110000   -0.97250000    4.88340000
H                 -2.93730000    0.69040000    2.67750000
H                 -3.29820000   -0.64200000    3.85930000
H                 -2.16360000    0.70120000    4.32200000
H                 -0.69000000    0.84050000    1.62160000
H                  0.58950000   -0.38310000    2.03130000
H                  0.08200000    0.85020000    3.26690000
H                  2.49080000    1.66480000   -3.95370000
H                  0.82050000    1.42070000   -4.62630000
H                  1.81140000   -0.01350000   -4.11010000
H                 -0.70600000    0.38640000   -1.36870000
H                 -1.02660000    0.68210000   -3.13280000
H                 -0.03560000   -0.75220000   -2.61660000
H                  1.58070000    0.72000000   -0.44790000
H                  2.92930000    1.26060000   -1.53930000
H                  2.24940000   -0.41810000   -1.69710000
H                  1.01040000    7.53900000   -2.41950000
H                 -0.65950000    7.29270000   -3.09260000
H                  0.61800000    8.10080000   -4.10280000
H                  0.35450000    4.65970000   -5.55250000
H                 -1.03840000    5.62910000   -4.90280000
H                  0.23900000    6.43720000   -5.91290000
H                  2.64050000    4.99700000   -4.63150000
H                  2.91650000    6.21180000   -3.30840000
H                  2.52290000    6.77450000   -4.99180000
H                  1.12770000    0.53260000   -0.16300000
H                 -0.54280000    0.28840000   -0.83530000
H                  0.55500000   -1.13940000   -0.58680000
H                 -1.89870000   -1.37780000    2.23010000
H                 -2.29130000   -0.81540000    0.54730000
H                 -1.19360000   -2.24310000    0.79590000
H                  0.38820000   -1.04410000    3.15040000
H                  1.66480000   -0.23670000    2.14010000
H                  1.09160000   -1.90890000    1.71500000
H                 -4.41950000   -4.96560000   -0.85150000
H                 -5.41970000   -3.44840000   -0.84630000
H                 -6.10520000   -4.99170000   -0.17270000
H                 -5.27620000   -2.96390000    2.86260000
H                 -5.91470000   -2.29190000    1.29960000
H                 -6.60020000   -3.83510000    1.97320000
H                 -3.90760000   -5.04110000    2.85570000
H                 -3.54550000   -5.88490000    1.28760000
H                 -5.23220000   -5.91050000    1.96550000
H                  5.41090000   -1.13200000   -2.59850000
H                  5.41000000   -1.11820000   -0.78140000
H                  5.74070000    0.41420000   -1.70220000
H                  2.23450000    0.83770000   -0.46150000
H                  3.57480000    0.01990000    0.45330000
H                  3.90550000    1.55220000   -0.46750000
H                  2.23570000    0.81920000   -2.94900000
H                  3.57620000   -0.01320000   -3.85040000
H                  3.90710000    1.53300000   -2.95310000
H                  2.31940000   -6.05430000   -3.24520000
H                  1.68290000   -6.36340000   -1.57150000
H                  3.12920000   -7.28270000   -2.17840000
H                  4.57680000   -4.76970000    0.18830000
H                  2.98720000   -5.62120000    0.41240000
H                  4.43350000   -6.54050000   -0.19460000
H                  5.44850000   -4.34690000   -2.10290000
H                  4.49460000   -4.88850000   -3.55170000
H                  5.30360000   -6.11790000   -2.48430000
H                 -1.61820000    0.43880000    5.47780000
H                 -3.28690000    0.58920000    4.77430000
H                 -2.96530000    1.13790000    6.47750000
H                 -3.21240000    4.32350000    4.52730000
H                 -4.20800000    2.83370000    4.22520000
H                 -3.88640000    3.38240000    5.92840000
H                 -0.92820000    4.11780000    5.49080000
H                 -0.25560000    2.47780000    5.89080000
H                 -1.60390000    3.17610000    6.89060000

1 2 2.0 6 1.0 64 1.0
2 3 1.0 48 1.0
3 4 2.0 65 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5 6 2.0 8 1.0
6 32 1.0
7 9 1.0 66 1.0 67 1.0
8 31 1.0
9 10 2.0 14 1.0
10 11 1.0 68 1.0
11 12 2.0 56 1.0
12 13 1.0 69 1.0
13 14 2.0 52 1.0
14 15 1.0
15 31 1.0
16 17 2.0 21 1.0 70 1.0
17 18 1.0 40 1.0
18 19 2.0 71 1.0
19 20 1.0 22 1.0
20 21 2.0 23 1.0
21 36 1.0
22 24 1.0 72 1.0 73 1.0
23 31 1.0
24 25 2.0 29 1.0
25 26 1.0 74 1.0
26 27 2.0 60 1.0
27 28 1.0 75 1.0
28 29 2.0 44 1.0
29 30 1.0
30 76 1.0
31
32 33 1.0 34 1.0 35 1.0
33 77 1.0 78 1.0 79 1.0
34 80 1.0 81 1.0 82 1.0
35 83 1.0 84 1.0 85 1.0
36 37 1.0 38 1.0 39 1.0
37 86 1.0 87 1.0 88 1.0
38 89 1.0 90 1.0 91 1.0
39 92 1.0 93 1.0 94 1.0
40 41 1.0 42 1.0 43 1.0
41 95 1.0 96 1.0 97 1.0
42 98 1.0 99 1.0 100 1.0
43 101 1.0 102 1.0 103 1.0
44 45 1.0 46 1.0 47 1.0
45 104 1.0 105 1.0 106 1.0
46 107 1.0 108 1.0 109 1.0
47 110 1.0 111 1.0 112 1.0
48 49 1.0 50 1.0 51 1.0
49 113 1.0 114 1.0 115 1.0
50 116 1.0 117 1.0 118 1.0
51 119 1.0 120 1.0 121 1.0
52 53 1.0 54 1.0 55 1.0
53 122 1.0 123 1.0 124 1.0
54 125 1.0 126 1.0 127 1.0
55 128 1.0 129 1.0 130 1.0
56 57 1.0 58 1.0 59 1.0
57 131 1.0 132 1.0 133 1.0
58 134 1.0 135 1.0 136 1.0
59 137 1.0 138 1.0 139 1.0
60 61 1.0 62 1.0 63 1.0
61 140 1.0 141 1.0 142 1.0
62 143 1.0 144 1.0 145 1.0
63 146 1.0 147 1.0 148 1.0
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
回复此楼
多多和大家探讨电化学的问题
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

123just

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-21 09:29:10
你的分子结构里,粗看了一下,31P和45C,30O和23O,20C和76H, 这些原子互相重叠。
你的分子结构本来就是如此吗?

你好,我这个分子又出错了,改了输入文件,麻烦你帮忙看一下,到底什么情况啊,跑了快十天了,结果Atoms too close.Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l202.exe.  我只想优化一下这个分子,如果可以的话麻烦帮我建一个输入文件吧。非常感谢

%chk=/home/cxw/1-opt.chk
#p opt=cartesian rhf/6-31g geom=(connectivity,nocrowd) scf=maxcyc=1025

Title Card Required

0 1
C                 -2.88308699   -2.54399815    1.94205103
C                 -3.31188699   -3.36029815    0.90065103
C                 -2.58388699   -3.41489815   -0.29054897
C                 -1.36118309   -2.54525071   -0.31823544
C                 -1.12175886   -1.91571891    0.55145747
C                 -1.67161901   -1.78422483    1.67453107
C                 -0.69418699   -2.75129815   -1.79684897
C                  0.81451301   -2.79519815   -1.74964897
C                  1.49251301   -4.02229815   -1.72414897
C                  2.88911301   -4.05949815   -1.70384897
C                  3.62411301   -2.87379815   -1.70764897
C                  2.96451301   -1.64619815   -1.71724897
C                  1.56951301   -1.61199815   -1.71724897
O                  0.94541301   -0.38889815   -1.71724897
C                  0.94627761    3.17998837   -3.31221853
C                  0.63877761    4.51168837   -3.03401853
C                  0.09007761    4.85738837   -1.79911853
C                 -0.15112239    3.87138837   -0.84251853
C                  0.15637761    2.53968837   -1.12071853
C                  0.70507761    2.19398837   -2.35561853
C                 -0.74002239    4.24248837    0.48278147
C                 -0.89792239    3.01248837    1.32148147
C                 -1.43042239    3.10858837    2.60698147
C                 -1.57742239    1.96258837    3.38848147
C                 -1.19192239    0.72048837    2.88428147
C                 -0.65952239    0.62438837    1.59868147
C                 -0.47064494    1.75225019    0.72027200
P                  0.30691301    0.27150185   -0.37424897
C                 -1.20051901   -0.91412483    2.79803107
C                 -0.62111901   -1.78462483    3.90533107
C                 -2.37371901   -0.11092483    3.34403107
C                 -0.12731901    0.03867517    2.28813107
C                  1.03517761    0.76468837   -2.65431853
C                  1.61667761    0.66078837   -4.05811853
C                 -0.23032239   -0.07781163   -2.56461853
C                  2.05537761    0.25618837   -1.64421853
C                  0.89747761    5.56998837   -4.06081853
C                  0.47627761    6.92568837   -3.50941853
C                  0.09737761    5.26218837   -5.31951853
C                  2.38227761    5.59918837   -4.39841853
C                 -0.24592239   -0.70871163    1.05758147
C                  0.14704205   -0.58434391    0.03772285
C                 -0.95770309   -1.25922629    1.04020800
C                  0.67712312   -1.21871689    1.81776673
C                 -4.55418699   -4.18079815    1.05635103
C                 -5.10188699   -4.53819815   -0.31904897
C                 -5.59688699   -3.38169815    1.82685103
C                 -4.22838699   -5.45779815    1.81975103
C                  3.74841301   -0.37089815   -1.72744897
C                  5.23751301   -0.69059815   -1.72524897
C                  3.40231301    0.44750185   -0.49054897
C                  3.40341301    0.42850185   -2.97704897
C                  3.59951301   -5.37699815   -1.67794897
C                  2.68071301   -6.45979815   -2.22824897
C                  3.98501301   -5.71759815   -0.24444897
C                  4.85591301   -5.29459815   -2.53484897
C                 -2.14882239    2.06568837    4.76828147
C                 -2.48982239    0.67298837    5.28168147
C                 -3.41092239    2.91738837    4.73248147
C                 -1.12742239    2.71158837    5.69508147
H                 -3.45038699   -2.50569815    2.88365103
H                 -2.93488699   -4.06189815   -1.10804897
H                 -0.98758699   -1.86379815   -2.40094897
H                 -1.00408699   -3.72869815   -2.22974897
H                  0.92101301   -4.96209815   -1.71994897
H                  4.72361301   -2.90779815   -1.70304897
H                  1.37907761    2.90738837   -4.28611853
H                 -0.15242239    5.90768837   -1.57961853
H                 -0.06452239    4.95968837    1.00058147
H                 -1.73542239    4.71528837    0.32698147
H                 -1.73452239    4.08818837    3.00458147
H                 -1.30792239   -0.18321163    3.50048147
H                  0.23618099   -2.37162483    3.50633107
H                 -1.40541901   -2.48092483    4.27793107
H                 -0.27091901   -1.13772483    4.74063107
H                 -2.79711901    0.52517517    2.53473107
H                 -3.15801901   -0.80722483    3.71653107
H                 -2.02341901    0.53597517    4.17923107
H                  0.56569272   -0.43600148    1.96499514
H                  0.22218099    0.68497517    3.12413107
H                  2.54147761    1.27648837   -4.12371853
H                  0.87117761    1.03238837   -4.79631853
H                  1.86207761   -0.40181163   -4.28011853
H                 -0.61215974   -0.00961997   -1.64290808
H                 -0.97592239    0.29378837   -3.30281853
H                  0.01507761   -1.14051163   -2.78661853
H                  1.63137761    0.33168837   -0.61791853
H                  2.97997761    0.87228837   -1.70931853
H                  2.30007761   -0.80641163   -1.86711853
H                  1.06107761    7.15068837   -2.58951853
H                 -0.60882239    6.90438837   -3.26261853
H                  0.66867761    7.71248837   -4.27281853
H                  0.40517761    4.27138837   -5.72251853
H                 -0.98772239    5.24078837   -5.07281853
H                  0.28967761    6.04888837   -6.08291853
H                  2.69117761    4.60868837   -4.80151853
H                  2.96717761    5.82348837   -3.47841853
H                  2.57357761    6.38618837   -5.16181853
H                  1.02724205    0.09645609    0.05922285
H                 -0.64325795   -0.14774391   -0.61307715
H                  0.45454205   -1.57554391   -0.36457715
H                 -1.74790309   -0.82262629    0.38930800
H                  0.28052312   -1.34491689    2.84996673
H                  1.55712312   -0.53751689    1.83966673
H                  0.98392312   -2.20971689    1.41456673
H                 -4.33988699   -5.12219815   -0.88214897
H                 -5.34008699   -3.60499815   -0.87694897
H                 -6.02558699   -5.14829815   -0.20334897
H                 -5.19658699   -3.12049815    2.83195103
H                 -5.83508699   -2.44849815    1.26895103
H                 -6.52058699   -3.99169815    1.94255103
H                 -3.82798699   -5.19769815    2.82505103
H                 -3.46588699   -6.04149815    1.25695103
H                 -5.15258699   -6.06709815    1.93485103
H                  5.49051301   -1.28859815   -2.62914897
H                  5.48961301   -1.27479815   -0.81204897
H                  5.82031301    0.25760185   -1.73284897
H                  2.31411301    0.68110185   -0.49214897
H                  3.65441301   -0.13669815    0.42265103
H                  3.98511301    1.39560185   -0.49814897
H                  2.31531301    0.66260185   -2.97964897
H                  3.65581301   -0.16979815   -3.88104897
H                  3.98671301    1.37640185   -2.98374897
H                  2.39901301   -6.21089815   -3.27584897
H                  1.76251301   -6.51999815   -1.60214897
H                  3.20881301   -7.43929815   -2.20904897
H                  4.65641301   -4.92629815    0.15765103
H                  3.06681301   -5.77779815    0.38175103
H                  4.51311301   -6.69709815   -0.22524897
H                  5.52811301   -4.50349815   -2.13354897
H                  4.57421301   -5.04509815   -3.58234897
H                  5.38321301   -6.27449815   -2.51494897
H                 -1.56752239    0.05048837    5.30778147
H                 -3.23622239    0.20088837    4.60428147
H                 -2.91462239    0.74958837    6.30748147
H                 -3.16172239    3.93518837    4.35728147
H                 -4.15732239    2.44538837    4.05518147
H                 -3.83572239    2.99408837    5.75838147
H                 -0.87752239    3.72948837    5.32078147
H                 -0.20492239    2.08948837    5.72078147
H                 -1.55322239    2.78778837    6.72058147
O                  0.12199602    0.61151947    0.44827631
O                  0.67757345    1.39101437   -0.15220717
H                 -1.04950199   -0.46508016    1.65995834
H                 -0.59891134   -1.22852890    1.74803961
H                 -0.68119826   -0.35253712    0.15056772
O                 -0.55503393   -1.57588317   -0.86908828
H                  0.94069406   -0.06236818    0.74086641

1 2 2.0 6 1.0 61 1.0
2 3 1.0 45 1.0
3 4 2.0 62 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5 6 2.0 147 1.0
6 29 1.0
7 8 1.0 63 1.0 64 1.0
8 9 2.0 13 1.0
9 10 1.0 65 1.0
10 11 2.0 53 1.0
11 12 1.0 66 1.0
12 13 2.0 49 1.0
13 14 1.0
14 28 1.0
15 16 2.0 20 1.0 67 1.0
16 17 1.0 37 1.0
17 18 2.0 68 1.0
18 19 1.0 21 1.0
19 20 2.0 143 1.0
20 33 1.0
21 22 1.0 69 1.0 70 1.0
22 23 2.0 27 1.0
23 24 1.0 71 1.0
24 25 2.0 57 1.0
25 26 1.0 72 1.0
26 27 2.0 41 1.0
27 142 1.0
28 143 1.0 147 1.0
29 30 1.0 31 1.0 32 1.0
30 73 1.0 74 1.0 75 1.0
31 76 1.0 77 1.0 78 1.0
32 79 1.0 80 1.0 144 1.0
33 34 1.0 35 1.0 36 1.0
34 81 1.0 82 1.0 83 1.0
35 84 1.0 85 1.0 86 1.0
36 87 1.0 88 1.0 89 1.0
37 38 1.0 39 1.0 40 1.0
38 90 1.0 91 1.0 92 1.0
39 93 1.0 94 1.0 95 1.0
40 96 1.0 97 1.0 98 1.0
41 42 1.0 43 1.0 44 1.0
42 99 1.0 100 1.0 101 1.0
43 102 1.0 145 1.0 146 1.0
44 103 1.0 104 1.0 105 1.0
45 46 1.0 47 1.0 48 1.0
46 106 1.0 107 1.0 108 1.0
47 109 1.0 110 1.0 111 1.0
48 112 1.0 113 1.0 114 1.0
49 50 1.0 51 1.0 52 1.0
50 115 1.0 116 1.0 117 1.0
51 118 1.0 119 1.0 120 1.0
52 121 1.0 122 1.0 123 1.0
53 54 1.0 55 1.0 56 1.0
54 124 1.0 125 1.0 126 1.0
55 127 1.0 128 1.0 129 1.0
56 130 1.0 131 1.0 132 1.0
57 58 1.0 59 1.0 60 1.0
58 133 1.0 134 1.0 135 1.0
59 136 1.0 137 1.0 138 1.0
60 139 1.0 140 1.0 141 1.0
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142 148 1.0
143
144
145
146
147
148
多多和大家探讨电化学的问题
4楼2013-11-13 12:43:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:56:54
123just: 金币+3, ★★★很有帮助, 把构型重新整了一下,还是出错了Error in internal coordinate system,L103 2013-10-23 10:16:38
初始构型不合理,

230号O原子与300号O原子几乎重叠了。
31号P和45号C也是。

新手还是要多检查初始构型。
2楼2013-10-21 09:25:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:57:03
123just: 金币+3, ★★★很有帮助, 把构型重新整了一下,还是出错了Error in internal coordinate system,L103 2013-10-23 10:16:53
你的分子结构里,粗看了一下,31P和45C,30O和23O,20C和76H, 这些原子互相重叠。
你的分子结构本来就是如此吗?
3楼2013-10-21 09:29:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2013-11-13 19:36:32
引用回帖:
4楼: Originally posted by 123just at 2013-11-13 12:43:18
你好,我这个分子又出错了,改了输入文件,麻烦你帮忙看一下,到底什么情况啊,跑了快十天了,结果Atoms too close.Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l202.exe.  我只想优化一下这个分子,如 ...

我照你的分子去画画来画去都少了12个原子。。。。你那分子画得看得人眼睛花。。。建议你用GV重新画一个,适当调整一两个二面角让某些看上去很近的原子隔得远一些,然后在优化看看,用nosymm打破对称性试试
5楼2013-11-13 13:41:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学工程与技术324调剂 +13 孙常华 2026-04-09 14/700 2026-04-09 23:10 by LHGeng
[考研] 本科西工大 0856 324求调剂 +9 wysyjs25 2026-04-09 9/450 2026-04-09 22:18 by bljnqdcc
[考研] 电子信息270求调剂 +11 terminal469 2026-04-07 11/550 2026-04-09 18:28 by hy861222
[考研] 一志愿西南大学生物学学硕344 求生物学相关调剂/生物与医药 +7 超人不会飞@ 2026-04-08 7/350 2026-04-09 09:35 by gong120082
[考研] 347材料专硕求调剂 +18 zj8215216 2026-04-06 18/900 2026-04-08 16:27 by luoyongfeng
[考研] 283求调剂 +19 A child 2026-04-04 19/950 2026-04-08 14:26 by xingguangj
[考研] 312求调剂 +4 Say Never 2026-04-04 4/200 2026-04-08 08:41 by barlinike
[考研] 363求调剂 +9 zh096 2026-04-04 9/450 2026-04-07 21:51 by 418490947
[考研] 本科生物信息学,总分362 求07 08调剂 +6 q小倩1210 2026-04-06 6/300 2026-04-07 19:40 by macy2011
[考研] 301求调剂 +18 121. 2026-04-04 18/900 2026-04-07 17:49 by 蓝云思雨
[考研] 325 调剂 +6 QQ小虾 2026-04-07 6/300 2026-04-07 15:17 by Ccclqqq
[考研] 软工学硕299求调剂 +6 useryy 2026-04-07 6/300 2026-04-07 09:50 by vgtyfty
[考研] 085405软件工程301分求调剂,专硕可跨专业,四六级已过 +3 静静想想 2026-04-05 3/150 2026-04-06 15:23 by nepu_uu
[考研] 一志愿9材料学硕297已过六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-04-04 12/600 2026-04-05 19:04 by 蓝云思雨
[考研] 材料调剂 +7 dxy调剂 2026-04-04 7/350 2026-04-05 09:15 by 陌秋26
[考研] 求生物学学硕调剂——364分 +7 云朵遛弯指南 2026-04-04 7/350 2026-04-04 22:49 by zhyzzh
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +4 zhouzhen654 2026-04-03 4/200 2026-04-04 18:10 by 猪会飞
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +6 cs0106 2026-04-03 6/300 2026-04-04 11:20 by w_xuqing
[考研] 305求调剂 +3 77Qi 2026-04-03 3/150 2026-04-03 23:01 by qzxyhcsy
[考研] 求材料调剂 一志愿南昌大学 328分 +5 yyy..... 2026-04-03 5/250 2026-04-03 13:46 by 百灵童888
信息提示
请填处理意见