应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 优化出错了，Linear angle in Bend. Error //g09/l103.exe
51/1返回列表
查看: 4176  |  回复: 4
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

123just

金虫 (正式写手)

[求助] 优化出错了，Linear angle in Bend. Error //g09/l103.exe

优化出错了，Linear angle in Bend.
Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l103.exe
用chemoffice 建模，分子画上去之后坐标都是默认的，没有改动过，求帮帮给看一下应该怎么写输入语句呢

%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\1.chk
#p opt rhf/6-31g geom=nocrowd  scf=(maxcyc=1025)

Title Card Required

0 1
C                 -2.96270000   -2.38740000    1.97270000
C                 -3.39150000   -3.20370000    0.93130000
C                 -2.66350000   -3.25830000   -0.25990000
C                 -1.48900000   -2.50100000   -0.43420000
C                 -1.09260000   -1.65540000    0.61660000
C                 -1.81180000   -1.61900000    1.81730000
C                 -0.77380000   -2.59470000   -1.76620000
O                  0.04740000   -0.89260000    0.58230000
C                  0.73490000   -2.63860000   -1.71900000
C                  1.41290000   -3.86570000   -1.69350000
C                  2.80950000   -3.90290000   -1.67320000
C                  3.54450000   -2.71720000   -1.67700000
C                  2.88490000   -1.48960000   -1.68660000
C                  1.48990000   -1.45540000   -1.68660000
O                  0.86580000   -0.23230000   -1.68660000
C                  0.89560000    3.56830000   -3.14220000
C                  0.58810000    4.90000000   -2.86400000
C                  0.03940000    5.24570000   -1.62910000
C                 -0.20180000    4.25970000   -0.67250000
C                  0.10570000    2.92800000   -0.95070000
C                  0.65440000    2.58230000   -2.18560000
C                 -0.79070000    4.63080000    0.65280000
O                 -0.12870000    1.97010000   -0.02140000
C                 -0.94860000    3.40080000    1.49150000
C                 -1.48110000    3.49690000    2.77700000
C                 -1.62810000    2.35090000    3.55850000
C                 -1.24260000    1.10880000    3.05430000
C                 -0.71020000    1.01270000    1.76870000
C                 -0.56310000    2.15870000    0.98730000
O                 -0.04580000    2.06540000   -0.26160000
P                  0.22730000    0.42810000   -0.34360000
C                 -1.34070000   -0.74890000    2.94080000
C                 -0.76130000   -1.61940000    4.04810000
C                 -2.51390000    0.05430000    3.48680000
C                 -0.26750000    0.20390000    2.43090000
C                  0.98450000    1.15300000   -2.48430000
C                  1.56600000    1.04910000   -3.88810000
C                 -0.28100000    0.31050000   -2.39460000
C                  2.00470000    0.64450000   -1.47420000
C                  0.84680000    5.95830000   -3.89080000
C                  0.42560000    7.31400000   -3.33940000
C                  0.04670000    5.65050000   -5.14950000
C                  2.33160000    5.98750000   -4.22840000
C                 -0.29660000   -0.32040000    1.22760000
C                  0.24750000   -0.14820000   -0.18450000
C                 -1.50110000   -1.25200000    1.19820000
C                  0.78480000   -0.91790000    2.11820000
C                 -4.63380000   -4.02420000    1.08700000
C                 -5.18150000   -4.38160000   -0.28840000
C                 -5.67650000   -3.22510000    1.85750000
C                 -4.30800000   -5.30120000    1.85040000
C                  3.66880000   -0.21430000   -1.69680000
C                  5.15790000   -0.53400000   -1.69460000
C                  3.32270000    0.60410000   -0.45990000
C                  3.32380000    0.58510000   -2.94640000
C                  3.51990000   -5.22040000   -1.64730000
C                  2.60110000   -6.30320000   -2.19760000
C                  3.90540000   -5.56100000   -0.21380000
C                  4.77630000   -5.13800000   -2.50420000
C                 -2.19950000    2.45400000    4.93830000
C                 -2.54050000    1.06130000    5.45170000
C                 -3.46160000    3.30570000    4.90250000
C                 -1.17810000    3.09990000    5.86510000
H                 -3.53000000   -2.34910000    2.91430000
H                 -3.01450000   -3.90530000   -1.07740000
H                 -1.06720000   -1.70720000   -2.37030000
H                 -1.08370000   -3.57210000   -2.19910000
H                  0.84140000   -4.80550000   -1.68930000
H                  4.64400000   -2.75120000   -1.67240000
H                  1.32840000    3.29570000   -4.11610000
H                 -0.20310000    6.29600000   -1.40960000
H                 -0.11520000    5.34800000    1.17060000
H                 -1.78610000    5.10360000    0.49700000
H                 -1.78520000    4.47650000    3.17460000
H                 -1.35860000    0.20510000    3.67050000
H                  0.05670000    2.86400000   -0.80610000
H                  0.09600000   -2.20640000    3.64910000
H                 -1.54560000   -2.31570000    4.42070000
H                 -0.41110000   -0.97250000    4.88340000
H                 -2.93730000    0.69040000    2.67750000
H                 -3.29820000   -0.64200000    3.85930000
H                 -2.16360000    0.70120000    4.32200000
H                 -0.69000000    0.84050000    1.62160000
H                  0.58950000   -0.38310000    2.03130000
H                  0.08200000    0.85020000    3.26690000
H                  2.49080000    1.66480000   -3.95370000
H                  0.82050000    1.42070000   -4.62630000
H                  1.81140000   -0.01350000   -4.11010000
H                 -0.70600000    0.38640000   -1.36870000
H                 -1.02660000    0.68210000   -3.13280000
H                 -0.03560000   -0.75220000   -2.61660000
H                  1.58070000    0.72000000   -0.44790000
H                  2.92930000    1.26060000   -1.53930000
H                  2.24940000   -0.41810000   -1.69710000
H                  1.01040000    7.53900000   -2.41950000
H                 -0.65950000    7.29270000   -3.09260000
H                  0.61800000    8.10080000   -4.10280000
H                  0.35450000    4.65970000   -5.55250000
H                 -1.03840000    5.62910000   -4.90280000
H                  0.23900000    6.43720000   -5.91290000
H                  2.64050000    4.99700000   -4.63150000
H                  2.91650000    6.21180000   -3.30840000
H                  2.52290000    6.77450000   -4.99180000
H                  1.12770000    0.53260000   -0.16300000
H                 -0.54280000    0.28840000   -0.83530000
H                  0.55500000   -1.13940000   -0.58680000
H                 -1.89870000   -1.37780000    2.23010000
H                 -2.29130000   -0.81540000    0.54730000
H                 -1.19360000   -2.24310000    0.79590000
H                  0.38820000   -1.04410000    3.15040000
H                  1.66480000   -0.23670000    2.14010000
H                  1.09160000   -1.90890000    1.71500000
H                 -4.41950000   -4.96560000   -0.85150000
H                 -5.41970000   -3.44840000   -0.84630000
H                 -6.10520000   -4.99170000   -0.17270000
H                 -5.27620000   -2.96390000    2.86260000
H                 -5.91470000   -2.29190000    1.29960000
H                 -6.60020000   -3.83510000    1.97320000
H                 -3.90760000   -5.04110000    2.85570000
H                 -3.54550000   -5.88490000    1.28760000
H                 -5.23220000   -5.91050000    1.96550000
H                  5.41090000   -1.13200000   -2.59850000
H                  5.41000000   -1.11820000   -0.78140000
H                  5.74070000    0.41420000   -1.70220000
H                  2.23450000    0.83770000   -0.46150000
H                  3.57480000    0.01990000    0.45330000
H                  3.90550000    1.55220000   -0.46750000
H                  2.23570000    0.81920000   -2.94900000
H                  3.57620000   -0.01320000   -3.85040000
H                  3.90710000    1.53300000   -2.95310000
H                  2.31940000   -6.05430000   -3.24520000
H                  1.68290000   -6.36340000   -1.57150000
H                  3.12920000   -7.28270000   -2.17840000
H                  4.57680000   -4.76970000    0.18830000
H                  2.98720000   -5.62120000    0.41240000
H                  4.43350000   -6.54050000   -0.19460000
H                  5.44850000   -4.34690000   -2.10290000
H                  4.49460000   -4.88850000   -3.55170000
H                  5.30360000   -6.11790000   -2.48430000
H                 -1.61820000    0.43880000    5.47780000
H                 -3.28690000    0.58920000    4.77430000
H                 -2.96530000    1.13790000    6.47750000
H                 -3.21240000    4.32350000    4.52730000
H                 -4.20800000    2.83370000    4.22520000
H                 -3.88640000    3.38240000    5.92840000
H                 -0.92820000    4.11780000    5.49080000
H                 -0.25560000    2.47780000    5.89080000
H                 -1.60390000    3.17610000    6.89060000

1 2 2.0 6 1.0 64 1.0
2 3 1.0 48 1.0
3 4 2.0 65 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5 6 2.0 8 1.0
6 32 1.0
7 9 1.0 66 1.0 67 1.0
8 31 1.0
9 10 2.0 14 1.0
10 11 1.0 68 1.0
11 12 2.0 56 1.0
12 13 1.0 69 1.0
13 14 2.0 52 1.0
14 15 1.0
15 31 1.0
16 17 2.0 21 1.0 70 1.0
17 18 1.0 40 1.0
18 19 2.0 71 1.0
19 20 1.0 22 1.0
20 21 2.0 23 1.0
21 36 1.0
22 24 1.0 72 1.0 73 1.0
23 31 1.0
24 25 2.0 29 1.0
25 26 1.0 74 1.0
26 27 2.0 60 1.0
27 28 1.0 75 1.0
28 29 2.0 44 1.0
29 30 1.0
30 76 1.0
31
32 33 1.0 34 1.0 35 1.0
33 77 1.0 78 1.0 79 1.0
34 80 1.0 81 1.0 82 1.0
35 83 1.0 84 1.0 85 1.0
36 37 1.0 38 1.0 39 1.0
37 86 1.0 87 1.0 88 1.0
38 89 1.0 90 1.0 91 1.0
39 92 1.0 93 1.0 94 1.0
40 41 1.0 42 1.0 43 1.0
41 95 1.0 96 1.0 97 1.0
42 98 1.0 99 1.0 100 1.0
43 101 1.0 102 1.0 103 1.0
44 45 1.0 46 1.0 47 1.0
45 104 1.0 105 1.0 106 1.0
46 107 1.0 108 1.0 109 1.0
47 110 1.0 111 1.0 112 1.0
48 49 1.0 50 1.0 51 1.0
49 113 1.0 114 1.0 115 1.0
50 116 1.0 117 1.0 118 1.0
51 119 1.0 120 1.0 121 1.0
52 53 1.0 54 1.0 55 1.0
53 122 1.0 123 1.0 124 1.0
54 125 1.0 126 1.0 127 1.0
55 128 1.0 129 1.0 130 1.0
56 57 1.0 58 1.0 59 1.0
57 131 1.0 132 1.0 133 1.0
58 134 1.0 135 1.0 136 1.0
59 137 1.0 138 1.0 139 1.0
60 61 1.0 62 1.0 63 1.0
61 140 1.0 141 1.0 142 1.0
62 143 1.0 144 1.0 145 1.0
63 146 1.0 147 1.0 148 1.0
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
多多和大家探讨电化学的问题
1楼2013-10-21 09:09:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

123just

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-21 09:29:10
你的分子结构里，粗看了一下，31P和45C，30O和23O，20C和76H， 这些原子互相重叠。
你的分子结构本来就是如此吗？

你好，我这个分子又出错了，改了输入文件，麻烦你帮忙看一下，到底什么情况啊，跑了快十天了，结果Atoms too close.Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l202.exe.  我只想优化一下这个分子，如果可以的话麻烦帮我建一个输入文件吧。非常感谢

%chk=/home/cxw/1-opt.chk
#p opt=cartesian rhf/6-31g geom=(connectivity,nocrowd) scf=maxcyc=1025

Title Card Required

0 1
C                 -2.88308699   -2.54399815    1.94205103
C                 -3.31188699   -3.36029815    0.90065103
C                 -2.58388699   -3.41489815   -0.29054897
C                 -1.36118309   -2.54525071   -0.31823544
C                 -1.12175886   -1.91571891    0.55145747
C                 -1.67161901   -1.78422483    1.67453107
C                 -0.69418699   -2.75129815   -1.79684897
C                  0.81451301   -2.79519815   -1.74964897
C                  1.49251301   -4.02229815   -1.72414897
C                  2.88911301   -4.05949815   -1.70384897
C                  3.62411301   -2.87379815   -1.70764897
C                  2.96451301   -1.64619815   -1.71724897
C                  1.56951301   -1.61199815   -1.71724897
O                  0.94541301   -0.38889815   -1.71724897
C                  0.94627761    3.17998837   -3.31221853
C                  0.63877761    4.51168837   -3.03401853
C                  0.09007761    4.85738837   -1.79911853
C                 -0.15112239    3.87138837   -0.84251853
C                  0.15637761    2.53968837   -1.12071853
C                  0.70507761    2.19398837   -2.35561853
C                 -0.74002239    4.24248837    0.48278147
C                 -0.89792239    3.01248837    1.32148147
C                 -1.43042239    3.10858837    2.60698147
C                 -1.57742239    1.96258837    3.38848147
C                 -1.19192239    0.72048837    2.88428147
C                 -0.65952239    0.62438837    1.59868147
C                 -0.47064494    1.75225019    0.72027200
P                  0.30691301    0.27150185   -0.37424897
C                 -1.20051901   -0.91412483    2.79803107
C                 -0.62111901   -1.78462483    3.90533107
C                 -2.37371901   -0.11092483    3.34403107
C                 -0.12731901    0.03867517    2.28813107
C                  1.03517761    0.76468837   -2.65431853
C                  1.61667761    0.66078837   -4.05811853
C                 -0.23032239   -0.07781163   -2.56461853
C                  2.05537761    0.25618837   -1.64421853
C                  0.89747761    5.56998837   -4.06081853
C                  0.47627761    6.92568837   -3.50941853
C                  0.09737761    5.26218837   -5.31951853
C                  2.38227761    5.59918837   -4.39841853
C                 -0.24592239   -0.70871163    1.05758147
C                  0.14704205   -0.58434391    0.03772285
C                 -0.95770309   -1.25922629    1.04020800
C                  0.67712312   -1.21871689    1.81776673
C                 -4.55418699   -4.18079815    1.05635103
C                 -5.10188699   -4.53819815   -0.31904897
C                 -5.59688699   -3.38169815    1.82685103
C                 -4.22838699   -5.45779815    1.81975103
C                  3.74841301   -0.37089815   -1.72744897
C                  5.23751301   -0.69059815   -1.72524897
C                  3.40231301    0.44750185   -0.49054897
C                  3.40341301    0.42850185   -2.97704897
C                  3.59951301   -5.37699815   -1.67794897
C                  2.68071301   -6.45979815   -2.22824897
C                  3.98501301   -5.71759815   -0.24444897
C                  4.85591301   -5.29459815   -2.53484897
C                 -2.14882239    2.06568837    4.76828147
C                 -2.48982239    0.67298837    5.28168147
C                 -3.41092239    2.91738837    4.73248147
C                 -1.12742239    2.71158837    5.69508147
H                 -3.45038699   -2.50569815    2.88365103
H                 -2.93488699   -4.06189815   -1.10804897
H                 -0.98758699   -1.86379815   -2.40094897
H                 -1.00408699   -3.72869815   -2.22974897
H                  0.92101301   -4.96209815   -1.71994897
H                  4.72361301   -2.90779815   -1.70304897
H                  1.37907761    2.90738837   -4.28611853
H                 -0.15242239    5.90768837   -1.57961853
H                 -0.06452239    4.95968837    1.00058147
H                 -1.73542239    4.71528837    0.32698147
H                 -1.73452239    4.08818837    3.00458147
H                 -1.30792239   -0.18321163    3.50048147
H                  0.23618099   -2.37162483    3.50633107
H                 -1.40541901   -2.48092483    4.27793107
H                 -0.27091901   -1.13772483    4.74063107
H                 -2.79711901    0.52517517    2.53473107
H                 -3.15801901   -0.80722483    3.71653107
H                 -2.02341901    0.53597517    4.17923107
H                  0.56569272   -0.43600148    1.96499514
H                  0.22218099    0.68497517    3.12413107
H                  2.54147761    1.27648837   -4.12371853
H                  0.87117761    1.03238837   -4.79631853
H                  1.86207761   -0.40181163   -4.28011853
H                 -0.61215974   -0.00961997   -1.64290808
H                 -0.97592239    0.29378837   -3.30281853
H                  0.01507761   -1.14051163   -2.78661853
H                  1.63137761    0.33168837   -0.61791853
H                  2.97997761    0.87228837   -1.70931853
H                  2.30007761   -0.80641163   -1.86711853
H                  1.06107761    7.15068837   -2.58951853
H                 -0.60882239    6.90438837   -3.26261853
H                  0.66867761    7.71248837   -4.27281853
H                  0.40517761    4.27138837   -5.72251853
H                 -0.98772239    5.24078837   -5.07281853
H                  0.28967761    6.04888837   -6.08291853
H                  2.69117761    4.60868837   -4.80151853
H                  2.96717761    5.82348837   -3.47841853
H                  2.57357761    6.38618837   -5.16181853
H                  1.02724205    0.09645609    0.05922285
H                 -0.64325795   -0.14774391   -0.61307715
H                  0.45454205   -1.57554391   -0.36457715
H                 -1.74790309   -0.82262629    0.38930800
H                  0.28052312   -1.34491689    2.84996673
H                  1.55712312   -0.53751689    1.83966673
H                  0.98392312   -2.20971689    1.41456673
H                 -4.33988699   -5.12219815   -0.88214897
H                 -5.34008699   -3.60499815   -0.87694897
H                 -6.02558699   -5.14829815   -0.20334897
H                 -5.19658699   -3.12049815    2.83195103
H                 -5.83508699   -2.44849815    1.26895103
H                 -6.52058699   -3.99169815    1.94255103
H                 -3.82798699   -5.19769815    2.82505103
H                 -3.46588699   -6.04149815    1.25695103
H                 -5.15258699   -6.06709815    1.93485103
H                  5.49051301   -1.28859815   -2.62914897
H                  5.48961301   -1.27479815   -0.81204897
H                  5.82031301    0.25760185   -1.73284897
H                  2.31411301    0.68110185   -0.49214897
H                  3.65441301   -0.13669815    0.42265103
H                  3.98511301    1.39560185   -0.49814897
H                  2.31531301    0.66260185   -2.97964897
H                  3.65581301   -0.16979815   -3.88104897
H                  3.98671301    1.37640185   -2.98374897
H                  2.39901301   -6.21089815   -3.27584897
H                  1.76251301   -6.51999815   -1.60214897
H                  3.20881301   -7.43929815   -2.20904897
H                  4.65641301   -4.92629815    0.15765103
H                  3.06681301   -5.77779815    0.38175103
H                  4.51311301   -6.69709815   -0.22524897
H                  5.52811301   -4.50349815   -2.13354897
H                  4.57421301   -5.04509815   -3.58234897
H                  5.38321301   -6.27449815   -2.51494897
H                 -1.56752239    0.05048837    5.30778147
H                 -3.23622239    0.20088837    4.60428147
H                 -2.91462239    0.74958837    6.30748147
H                 -3.16172239    3.93518837    4.35728147
H                 -4.15732239    2.44538837    4.05518147
H                 -3.83572239    2.99408837    5.75838147
H                 -0.87752239    3.72948837    5.32078147
H                 -0.20492239    2.08948837    5.72078147
H                 -1.55322239    2.78778837    6.72058147
O                  0.12199602    0.61151947    0.44827631
O                  0.67757345    1.39101437   -0.15220717
H                 -1.04950199   -0.46508016    1.65995834
H                 -0.59891134   -1.22852890    1.74803961
H                 -0.68119826   -0.35253712    0.15056772
O                 -0.55503393   -1.57588317   -0.86908828
H                  0.94069406   -0.06236818    0.74086641

1 2 2.0 6 1.0 61 1.0
2 3 1.0 45 1.0
3 4 2.0 62 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5 6 2.0 147 1.0
6 29 1.0
7 8 1.0 63 1.0 64 1.0
8 9 2.0 13 1.0
9 10 1.0 65 1.0
10 11 2.0 53 1.0
11 12 1.0 66 1.0
12 13 2.0 49 1.0
13 14 1.0
14 28 1.0
15 16 2.0 20 1.0 67 1.0
16 17 1.0 37 1.0
17 18 2.0 68 1.0
18 19 1.0 21 1.0
19 20 2.0 143 1.0
20 33 1.0
21 22 1.0 69 1.0 70 1.0
22 23 2.0 27 1.0
23 24 1.0 71 1.0
24 25 2.0 57 1.0
25 26 1.0 72 1.0
26 27 2.0 41 1.0
27 142 1.0
28 143 1.0 147 1.0
29 30 1.0 31 1.0 32 1.0
30 73 1.0 74 1.0 75 1.0
31 76 1.0 77 1.0 78 1.0
32 79 1.0 80 1.0 144 1.0
33 34 1.0 35 1.0 36 1.0
34 81 1.0 82 1.0 83 1.0
35 84 1.0 85 1.0 86 1.0
36 87 1.0 88 1.0 89 1.0
37 38 1.0 39 1.0 40 1.0
38 90 1.0 91 1.0 92 1.0
39 93 1.0 94 1.0 95 1.0
40 96 1.0 97 1.0 98 1.0
41 42 1.0 43 1.0 44 1.0
42 99 1.0 100 1.0 101 1.0
43 102 1.0 145 1.0 146 1.0
44 103 1.0 104 1.0 105 1.0
45 46 1.0 47 1.0 48 1.0
46 106 1.0 107 1.0 108 1.0
47 109 1.0 110 1.0 111 1.0
48 112 1.0 113 1.0 114 1.0
49 50 1.0 51 1.0 52 1.0
50 115 1.0 116 1.0 117 1.0
51 118 1.0 119 1.0 120 1.0
52 121 1.0 122 1.0 123 1.0
53 54 1.0 55 1.0 56 1.0
54 124 1.0 125 1.0 126 1.0
55 127 1.0 128 1.0 129 1.0
56 130 1.0 131 1.0 132 1.0
57 58 1.0 59 1.0 60 1.0
58 133 1.0 134 1.0 135 1.0
59 136 1.0 137 1.0 138 1.0
60 139 1.0 140 1.0 141 1.0
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142 148 1.0
143
144
145
146
147
148
赞一下 回复此楼
多多和大家探讨电化学的问题
4楼2013-11-13 12:43:18
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:56:54
123just: 金币+3, ★★★很有帮助, 把构型重新整了一下，还是出错了Error in internal coordinate system，L103 2013-10-23 10:16:38
初始构型不合理，

230号O原子与300号O原子几乎重叠了。
31号P和45号C也是。

新手还是要多检查初始构型。
赞一下 回复此楼
2楼2013-10-21 09:25:47
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:57:03
123just: 金币+3, ★★★很有帮助, 把构型重新整了一下，还是出错了Error in internal coordinate system，L103 2013-10-23 10:16:53
你的分子结构里，粗看了一下，31P和45C，30O和23O，20C和76H， 这些原子互相重叠。
你的分子结构本来就是如此吗？
赞一下 回复此楼
3楼2013-10-21 09:29:10
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2013-11-13 19:36:32
引用回帖:
4楼: Originally posted by 123just at 2013-11-13 12:43:18
你好，我这个分子又出错了，改了输入文件，麻烦你帮忙看一下，到底什么情况啊，跑了快十天了，结果Atoms too close.Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l202.exe.  我只想优化一下这个分子，如 ...

我照你的分子去画画来画去都少了12个原子。。。。你那分子画得看得人眼睛花。。。建议你用GV重新画一个，适当调整一两个二面角让某些看上去很近的原子隔得远一些，然后在优化看看，用nosymm打破对称性试试
赞一下 回复此楼
5楼2013-11-13 13:41:57
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭