24小时热门版块排行榜    

查看: 4579  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

123just

金虫 (正式写手)

[求助] 优化出错了,Linear angle in Bend. Error //g09/l103.exe

优化出错了,Linear angle in Bend.
Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l103.exe
用chemoffice 建模,分子画上去之后坐标都是默认的,没有改动过,求帮帮给看一下应该怎么写输入语句呢

%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\1.chk
#p opt rhf/6-31g geom=nocrowd  scf=(maxcyc=1025)

Title Card Required

0 1
C                 -2.96270000   -2.38740000    1.97270000
C                 -3.39150000   -3.20370000    0.93130000
C                 -2.66350000   -3.25830000   -0.25990000
C                 -1.48900000   -2.50100000   -0.43420000
C                 -1.09260000   -1.65540000    0.61660000
C                 -1.81180000   -1.61900000    1.81730000
C                 -0.77380000   -2.59470000   -1.76620000
O                  0.04740000   -0.89260000    0.58230000
C                  0.73490000   -2.63860000   -1.71900000
C                  1.41290000   -3.86570000   -1.69350000
C                  2.80950000   -3.90290000   -1.67320000
C                  3.54450000   -2.71720000   -1.67700000
C                  2.88490000   -1.48960000   -1.68660000
C                  1.48990000   -1.45540000   -1.68660000
O                  0.86580000   -0.23230000   -1.68660000
C                  0.89560000    3.56830000   -3.14220000
C                  0.58810000    4.90000000   -2.86400000
C                  0.03940000    5.24570000   -1.62910000
C                 -0.20180000    4.25970000   -0.67250000
C                  0.10570000    2.92800000   -0.95070000
C                  0.65440000    2.58230000   -2.18560000
C                 -0.79070000    4.63080000    0.65280000
O                 -0.12870000    1.97010000   -0.02140000
C                 -0.94860000    3.40080000    1.49150000
C                 -1.48110000    3.49690000    2.77700000
C                 -1.62810000    2.35090000    3.55850000
C                 -1.24260000    1.10880000    3.05430000
C                 -0.71020000    1.01270000    1.76870000
C                 -0.56310000    2.15870000    0.98730000
O                 -0.04580000    2.06540000   -0.26160000
P                  0.22730000    0.42810000   -0.34360000
C                 -1.34070000   -0.74890000    2.94080000
C                 -0.76130000   -1.61940000    4.04810000
C                 -2.51390000    0.05430000    3.48680000
C                 -0.26750000    0.20390000    2.43090000
C                  0.98450000    1.15300000   -2.48430000
C                  1.56600000    1.04910000   -3.88810000
C                 -0.28100000    0.31050000   -2.39460000
C                  2.00470000    0.64450000   -1.47420000
C                  0.84680000    5.95830000   -3.89080000
C                  0.42560000    7.31400000   -3.33940000
C                  0.04670000    5.65050000   -5.14950000
C                  2.33160000    5.98750000   -4.22840000
C                 -0.29660000   -0.32040000    1.22760000
C                  0.24750000   -0.14820000   -0.18450000
C                 -1.50110000   -1.25200000    1.19820000
C                  0.78480000   -0.91790000    2.11820000
C                 -4.63380000   -4.02420000    1.08700000
C                 -5.18150000   -4.38160000   -0.28840000
C                 -5.67650000   -3.22510000    1.85750000
C                 -4.30800000   -5.30120000    1.85040000
C                  3.66880000   -0.21430000   -1.69680000
C                  5.15790000   -0.53400000   -1.69460000
C                  3.32270000    0.60410000   -0.45990000
C                  3.32380000    0.58510000   -2.94640000
C                  3.51990000   -5.22040000   -1.64730000
C                  2.60110000   -6.30320000   -2.19760000
C                  3.90540000   -5.56100000   -0.21380000
C                  4.77630000   -5.13800000   -2.50420000
C                 -2.19950000    2.45400000    4.93830000
C                 -2.54050000    1.06130000    5.45170000
C                 -3.46160000    3.30570000    4.90250000
C                 -1.17810000    3.09990000    5.86510000
H                 -3.53000000   -2.34910000    2.91430000
H                 -3.01450000   -3.90530000   -1.07740000
H                 -1.06720000   -1.70720000   -2.37030000
H                 -1.08370000   -3.57210000   -2.19910000
H                  0.84140000   -4.80550000   -1.68930000
H                  4.64400000   -2.75120000   -1.67240000
H                  1.32840000    3.29570000   -4.11610000
H                 -0.20310000    6.29600000   -1.40960000
H                 -0.11520000    5.34800000    1.17060000
H                 -1.78610000    5.10360000    0.49700000
H                 -1.78520000    4.47650000    3.17460000
H                 -1.35860000    0.20510000    3.67050000
H                  0.05670000    2.86400000   -0.80610000
H                  0.09600000   -2.20640000    3.64910000
H                 -1.54560000   -2.31570000    4.42070000
H                 -0.41110000   -0.97250000    4.88340000
H                 -2.93730000    0.69040000    2.67750000
H                 -3.29820000   -0.64200000    3.85930000
H                 -2.16360000    0.70120000    4.32200000
H                 -0.69000000    0.84050000    1.62160000
H                  0.58950000   -0.38310000    2.03130000
H                  0.08200000    0.85020000    3.26690000
H                  2.49080000    1.66480000   -3.95370000
H                  0.82050000    1.42070000   -4.62630000
H                  1.81140000   -0.01350000   -4.11010000
H                 -0.70600000    0.38640000   -1.36870000
H                 -1.02660000    0.68210000   -3.13280000
H                 -0.03560000   -0.75220000   -2.61660000
H                  1.58070000    0.72000000   -0.44790000
H                  2.92930000    1.26060000   -1.53930000
H                  2.24940000   -0.41810000   -1.69710000
H                  1.01040000    7.53900000   -2.41950000
H                 -0.65950000    7.29270000   -3.09260000
H                  0.61800000    8.10080000   -4.10280000
H                  0.35450000    4.65970000   -5.55250000
H                 -1.03840000    5.62910000   -4.90280000
H                  0.23900000    6.43720000   -5.91290000
H                  2.64050000    4.99700000   -4.63150000
H                  2.91650000    6.21180000   -3.30840000
H                  2.52290000    6.77450000   -4.99180000
H                  1.12770000    0.53260000   -0.16300000
H                 -0.54280000    0.28840000   -0.83530000
H                  0.55500000   -1.13940000   -0.58680000
H                 -1.89870000   -1.37780000    2.23010000
H                 -2.29130000   -0.81540000    0.54730000
H                 -1.19360000   -2.24310000    0.79590000
H                  0.38820000   -1.04410000    3.15040000
H                  1.66480000   -0.23670000    2.14010000
H                  1.09160000   -1.90890000    1.71500000
H                 -4.41950000   -4.96560000   -0.85150000
H                 -5.41970000   -3.44840000   -0.84630000
H                 -6.10520000   -4.99170000   -0.17270000
H                 -5.27620000   -2.96390000    2.86260000
H                 -5.91470000   -2.29190000    1.29960000
H                 -6.60020000   -3.83510000    1.97320000
H                 -3.90760000   -5.04110000    2.85570000
H                 -3.54550000   -5.88490000    1.28760000
H                 -5.23220000   -5.91050000    1.96550000
H                  5.41090000   -1.13200000   -2.59850000
H                  5.41000000   -1.11820000   -0.78140000
H                  5.74070000    0.41420000   -1.70220000
H                  2.23450000    0.83770000   -0.46150000
H                  3.57480000    0.01990000    0.45330000
H                  3.90550000    1.55220000   -0.46750000
H                  2.23570000    0.81920000   -2.94900000
H                  3.57620000   -0.01320000   -3.85040000
H                  3.90710000    1.53300000   -2.95310000
H                  2.31940000   -6.05430000   -3.24520000
H                  1.68290000   -6.36340000   -1.57150000
H                  3.12920000   -7.28270000   -2.17840000
H                  4.57680000   -4.76970000    0.18830000
H                  2.98720000   -5.62120000    0.41240000
H                  4.43350000   -6.54050000   -0.19460000
H                  5.44850000   -4.34690000   -2.10290000
H                  4.49460000   -4.88850000   -3.55170000
H                  5.30360000   -6.11790000   -2.48430000
H                 -1.61820000    0.43880000    5.47780000
H                 -3.28690000    0.58920000    4.77430000
H                 -2.96530000    1.13790000    6.47750000
H                 -3.21240000    4.32350000    4.52730000
H                 -4.20800000    2.83370000    4.22520000
H                 -3.88640000    3.38240000    5.92840000
H                 -0.92820000    4.11780000    5.49080000
H                 -0.25560000    2.47780000    5.89080000
H                 -1.60390000    3.17610000    6.89060000

1 2 2.0 6 1.0 64 1.0
2 3 1.0 48 1.0
3 4 2.0 65 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5 6 2.0 8 1.0
6 32 1.0
7 9 1.0 66 1.0 67 1.0
8 31 1.0
9 10 2.0 14 1.0
10 11 1.0 68 1.0
11 12 2.0 56 1.0
12 13 1.0 69 1.0
13 14 2.0 52 1.0
14 15 1.0
15 31 1.0
16 17 2.0 21 1.0 70 1.0
17 18 1.0 40 1.0
18 19 2.0 71 1.0
19 20 1.0 22 1.0
20 21 2.0 23 1.0
21 36 1.0
22 24 1.0 72 1.0 73 1.0
23 31 1.0
24 25 2.0 29 1.0
25 26 1.0 74 1.0
26 27 2.0 60 1.0
27 28 1.0 75 1.0
28 29 2.0 44 1.0
29 30 1.0
30 76 1.0
31
32 33 1.0 34 1.0 35 1.0
33 77 1.0 78 1.0 79 1.0
34 80 1.0 81 1.0 82 1.0
35 83 1.0 84 1.0 85 1.0
36 37 1.0 38 1.0 39 1.0
37 86 1.0 87 1.0 88 1.0
38 89 1.0 90 1.0 91 1.0
39 92 1.0 93 1.0 94 1.0
40 41 1.0 42 1.0 43 1.0
41 95 1.0 96 1.0 97 1.0
42 98 1.0 99 1.0 100 1.0
43 101 1.0 102 1.0 103 1.0
44 45 1.0 46 1.0 47 1.0
45 104 1.0 105 1.0 106 1.0
46 107 1.0 108 1.0 109 1.0
47 110 1.0 111 1.0 112 1.0
48 49 1.0 50 1.0 51 1.0
49 113 1.0 114 1.0 115 1.0
50 116 1.0 117 1.0 118 1.0
51 119 1.0 120 1.0 121 1.0
52 53 1.0 54 1.0 55 1.0
53 122 1.0 123 1.0 124 1.0
54 125 1.0 126 1.0 127 1.0
55 128 1.0 129 1.0 130 1.0
56 57 1.0 58 1.0 59 1.0
57 131 1.0 132 1.0 133 1.0
58 134 1.0 135 1.0 136 1.0
59 137 1.0 138 1.0 139 1.0
60 61 1.0 62 1.0 63 1.0
61 140 1.0 141 1.0 142 1.0
62 143 1.0 144 1.0 145 1.0
63 146 1.0 147 1.0 148 1.0
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
回复此楼
多多和大家探讨电化学的问题
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

123just

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-21 09:29:10
你的分子结构里,粗看了一下,31P和45C,30O和23O,20C和76H, 这些原子互相重叠。
你的分子结构本来就是如此吗?

你好,我这个分子又出错了,改了输入文件,麻烦你帮忙看一下,到底什么情况啊,跑了快十天了,结果Atoms too close.Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l202.exe.  我只想优化一下这个分子,如果可以的话麻烦帮我建一个输入文件吧。非常感谢

%chk=/home/cxw/1-opt.chk
#p opt=cartesian rhf/6-31g geom=(connectivity,nocrowd) scf=maxcyc=1025

Title Card Required

0 1
C                 -2.88308699   -2.54399815    1.94205103
C                 -3.31188699   -3.36029815    0.90065103
C                 -2.58388699   -3.41489815   -0.29054897
C                 -1.36118309   -2.54525071   -0.31823544
C                 -1.12175886   -1.91571891    0.55145747
C                 -1.67161901   -1.78422483    1.67453107
C                 -0.69418699   -2.75129815   -1.79684897
C                  0.81451301   -2.79519815   -1.74964897
C                  1.49251301   -4.02229815   -1.72414897
C                  2.88911301   -4.05949815   -1.70384897
C                  3.62411301   -2.87379815   -1.70764897
C                  2.96451301   -1.64619815   -1.71724897
C                  1.56951301   -1.61199815   -1.71724897
O                  0.94541301   -0.38889815   -1.71724897
C                  0.94627761    3.17998837   -3.31221853
C                  0.63877761    4.51168837   -3.03401853
C                  0.09007761    4.85738837   -1.79911853
C                 -0.15112239    3.87138837   -0.84251853
C                  0.15637761    2.53968837   -1.12071853
C                  0.70507761    2.19398837   -2.35561853
C                 -0.74002239    4.24248837    0.48278147
C                 -0.89792239    3.01248837    1.32148147
C                 -1.43042239    3.10858837    2.60698147
C                 -1.57742239    1.96258837    3.38848147
C                 -1.19192239    0.72048837    2.88428147
C                 -0.65952239    0.62438837    1.59868147
C                 -0.47064494    1.75225019    0.72027200
P                  0.30691301    0.27150185   -0.37424897
C                 -1.20051901   -0.91412483    2.79803107
C                 -0.62111901   -1.78462483    3.90533107
C                 -2.37371901   -0.11092483    3.34403107
C                 -0.12731901    0.03867517    2.28813107
C                  1.03517761    0.76468837   -2.65431853
C                  1.61667761    0.66078837   -4.05811853
C                 -0.23032239   -0.07781163   -2.56461853
C                  2.05537761    0.25618837   -1.64421853
C                  0.89747761    5.56998837   -4.06081853
C                  0.47627761    6.92568837   -3.50941853
C                  0.09737761    5.26218837   -5.31951853
C                  2.38227761    5.59918837   -4.39841853
C                 -0.24592239   -0.70871163    1.05758147
C                  0.14704205   -0.58434391    0.03772285
C                 -0.95770309   -1.25922629    1.04020800
C                  0.67712312   -1.21871689    1.81776673
C                 -4.55418699   -4.18079815    1.05635103
C                 -5.10188699   -4.53819815   -0.31904897
C                 -5.59688699   -3.38169815    1.82685103
C                 -4.22838699   -5.45779815    1.81975103
C                  3.74841301   -0.37089815   -1.72744897
C                  5.23751301   -0.69059815   -1.72524897
C                  3.40231301    0.44750185   -0.49054897
C                  3.40341301    0.42850185   -2.97704897
C                  3.59951301   -5.37699815   -1.67794897
C                  2.68071301   -6.45979815   -2.22824897
C                  3.98501301   -5.71759815   -0.24444897
C                  4.85591301   -5.29459815   -2.53484897
C                 -2.14882239    2.06568837    4.76828147
C                 -2.48982239    0.67298837    5.28168147
C                 -3.41092239    2.91738837    4.73248147
C                 -1.12742239    2.71158837    5.69508147
H                 -3.45038699   -2.50569815    2.88365103
H                 -2.93488699   -4.06189815   -1.10804897
H                 -0.98758699   -1.86379815   -2.40094897
H                 -1.00408699   -3.72869815   -2.22974897
H                  0.92101301   -4.96209815   -1.71994897
H                  4.72361301   -2.90779815   -1.70304897
H                  1.37907761    2.90738837   -4.28611853
H                 -0.15242239    5.90768837   -1.57961853
H                 -0.06452239    4.95968837    1.00058147
H                 -1.73542239    4.71528837    0.32698147
H                 -1.73452239    4.08818837    3.00458147
H                 -1.30792239   -0.18321163    3.50048147
H                  0.23618099   -2.37162483    3.50633107
H                 -1.40541901   -2.48092483    4.27793107
H                 -0.27091901   -1.13772483    4.74063107
H                 -2.79711901    0.52517517    2.53473107
H                 -3.15801901   -0.80722483    3.71653107
H                 -2.02341901    0.53597517    4.17923107
H                  0.56569272   -0.43600148    1.96499514
H                  0.22218099    0.68497517    3.12413107
H                  2.54147761    1.27648837   -4.12371853
H                  0.87117761    1.03238837   -4.79631853
H                  1.86207761   -0.40181163   -4.28011853
H                 -0.61215974   -0.00961997   -1.64290808
H                 -0.97592239    0.29378837   -3.30281853
H                  0.01507761   -1.14051163   -2.78661853
H                  1.63137761    0.33168837   -0.61791853
H                  2.97997761    0.87228837   -1.70931853
H                  2.30007761   -0.80641163   -1.86711853
H                  1.06107761    7.15068837   -2.58951853
H                 -0.60882239    6.90438837   -3.26261853
H                  0.66867761    7.71248837   -4.27281853
H                  0.40517761    4.27138837   -5.72251853
H                 -0.98772239    5.24078837   -5.07281853
H                  0.28967761    6.04888837   -6.08291853
H                  2.69117761    4.60868837   -4.80151853
H                  2.96717761    5.82348837   -3.47841853
H                  2.57357761    6.38618837   -5.16181853
H                  1.02724205    0.09645609    0.05922285
H                 -0.64325795   -0.14774391   -0.61307715
H                  0.45454205   -1.57554391   -0.36457715
H                 -1.74790309   -0.82262629    0.38930800
H                  0.28052312   -1.34491689    2.84996673
H                  1.55712312   -0.53751689    1.83966673
H                  0.98392312   -2.20971689    1.41456673
H                 -4.33988699   -5.12219815   -0.88214897
H                 -5.34008699   -3.60499815   -0.87694897
H                 -6.02558699   -5.14829815   -0.20334897
H                 -5.19658699   -3.12049815    2.83195103
H                 -5.83508699   -2.44849815    1.26895103
H                 -6.52058699   -3.99169815    1.94255103
H                 -3.82798699   -5.19769815    2.82505103
H                 -3.46588699   -6.04149815    1.25695103
H                 -5.15258699   -6.06709815    1.93485103
H                  5.49051301   -1.28859815   -2.62914897
H                  5.48961301   -1.27479815   -0.81204897
H                  5.82031301    0.25760185   -1.73284897
H                  2.31411301    0.68110185   -0.49214897
H                  3.65441301   -0.13669815    0.42265103
H                  3.98511301    1.39560185   -0.49814897
H                  2.31531301    0.66260185   -2.97964897
H                  3.65581301   -0.16979815   -3.88104897
H                  3.98671301    1.37640185   -2.98374897
H                  2.39901301   -6.21089815   -3.27584897
H                  1.76251301   -6.51999815   -1.60214897
H                  3.20881301   -7.43929815   -2.20904897
H                  4.65641301   -4.92629815    0.15765103
H                  3.06681301   -5.77779815    0.38175103
H                  4.51311301   -6.69709815   -0.22524897
H                  5.52811301   -4.50349815   -2.13354897
H                  4.57421301   -5.04509815   -3.58234897
H                  5.38321301   -6.27449815   -2.51494897
H                 -1.56752239    0.05048837    5.30778147
H                 -3.23622239    0.20088837    4.60428147
H                 -2.91462239    0.74958837    6.30748147
H                 -3.16172239    3.93518837    4.35728147
H                 -4.15732239    2.44538837    4.05518147
H                 -3.83572239    2.99408837    5.75838147
H                 -0.87752239    3.72948837    5.32078147
H                 -0.20492239    2.08948837    5.72078147
H                 -1.55322239    2.78778837    6.72058147
O                  0.12199602    0.61151947    0.44827631
O                  0.67757345    1.39101437   -0.15220717
H                 -1.04950199   -0.46508016    1.65995834
H                 -0.59891134   -1.22852890    1.74803961
H                 -0.68119826   -0.35253712    0.15056772
O                 -0.55503393   -1.57588317   -0.86908828
H                  0.94069406   -0.06236818    0.74086641

1 2 2.0 6 1.0 61 1.0
2 3 1.0 45 1.0
3 4 2.0 62 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5 6 2.0 147 1.0
6 29 1.0
7 8 1.0 63 1.0 64 1.0
8 9 2.0 13 1.0
9 10 1.0 65 1.0
10 11 2.0 53 1.0
11 12 1.0 66 1.0
12 13 2.0 49 1.0
13 14 1.0
14 28 1.0
15 16 2.0 20 1.0 67 1.0
16 17 1.0 37 1.0
17 18 2.0 68 1.0
18 19 1.0 21 1.0
19 20 2.0 143 1.0
20 33 1.0
21 22 1.0 69 1.0 70 1.0
22 23 2.0 27 1.0
23 24 1.0 71 1.0
24 25 2.0 57 1.0
25 26 1.0 72 1.0
26 27 2.0 41 1.0
27 142 1.0
28 143 1.0 147 1.0
29 30 1.0 31 1.0 32 1.0
30 73 1.0 74 1.0 75 1.0
31 76 1.0 77 1.0 78 1.0
32 79 1.0 80 1.0 144 1.0
33 34 1.0 35 1.0 36 1.0
34 81 1.0 82 1.0 83 1.0
35 84 1.0 85 1.0 86 1.0
36 87 1.0 88 1.0 89 1.0
37 38 1.0 39 1.0 40 1.0
38 90 1.0 91 1.0 92 1.0
39 93 1.0 94 1.0 95 1.0
40 96 1.0 97 1.0 98 1.0
41 42 1.0 43 1.0 44 1.0
42 99 1.0 100 1.0 101 1.0
43 102 1.0 145 1.0 146 1.0
44 103 1.0 104 1.0 105 1.0
45 46 1.0 47 1.0 48 1.0
46 106 1.0 107 1.0 108 1.0
47 109 1.0 110 1.0 111 1.0
48 112 1.0 113 1.0 114 1.0
49 50 1.0 51 1.0 52 1.0
50 115 1.0 116 1.0 117 1.0
51 118 1.0 119 1.0 120 1.0
52 121 1.0 122 1.0 123 1.0
53 54 1.0 55 1.0 56 1.0
54 124 1.0 125 1.0 126 1.0
55 127 1.0 128 1.0 129 1.0
56 130 1.0 131 1.0 132 1.0
57 58 1.0 59 1.0 60 1.0
58 133 1.0 134 1.0 135 1.0
59 136 1.0 137 1.0 138 1.0
60 139 1.0 140 1.0 141 1.0
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142 148 1.0
143
144
145
146
147
148
多多和大家探讨电化学的问题
4楼2013-11-13 12:43:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:56:54
123just: 金币+3, ★★★很有帮助, 把构型重新整了一下,还是出错了Error in internal coordinate system,L103 2013-10-23 10:16:38
初始构型不合理,

230号O原子与300号O原子几乎重叠了。
31号P和45号C也是。

新手还是要多检查初始构型。
2楼2013-10-21 09:25:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:57:03
123just: 金币+3, ★★★很有帮助, 把构型重新整了一下,还是出错了Error in internal coordinate system,L103 2013-10-23 10:16:53
你的分子结构里,粗看了一下,31P和45C,30O和23O,20C和76H, 这些原子互相重叠。
你的分子结构本来就是如此吗?
3楼2013-10-21 09:29:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2013-11-13 19:36:32
引用回帖:
4楼: Originally posted by 123just at 2013-11-13 12:43:18
你好,我这个分子又出错了,改了输入文件,麻烦你帮忙看一下,到底什么情况啊,跑了快十天了,结果Atoms too close.Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l202.exe.  我只想优化一下这个分子,如 ...

我照你的分子去画画来画去都少了12个原子。。。。你那分子画得看得人眼睛花。。。建议你用GV重新画一个,适当调整一两个二面角让某些看上去很近的原子隔得远一些,然后在优化看看,用nosymm打破对称性试试
5楼2013-11-13 13:41:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 10:26 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 09:59 by JzYBbHIXWSrW
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 5/250 2026-09-29 09:52 by JzYBbHIXWSrW
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-29 09:24 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:42 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:34 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:18 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[有机交流] 同一个分子,一条来自文献,一条来自AI——不告诉你答案,你会选哪条? +3 tianxiaoxian 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:44 by tianxiaoxian
[找工作] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:28 by ez6fGg9abYaj
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-28 22:21 by ez6fGg9abYaj
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:15 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 18:51 by 9lS3ad5oOymn
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意! +7 zju2000 2026-09-26 8/400 2026-09-28 16:42 by beefly
信息提示
请填处理意见