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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 优化出错了，Linear angle in Bend. Error //g09/l103.exe
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123just

金虫 (正式写手)

[求助] 优化出错了，Linear angle in Bend. Error //g09/l103.exe

优化出错了，Linear angle in Bend.
Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l103.exe
用chemoffice 建模，分子画上去之后坐标都是默认的，没有改动过，求帮帮给看一下应该怎么写输入语句呢

%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\1.chk
#p opt rhf/6-31g geom=nocrowd  scf=(maxcyc=1025)

Title Card Required

0 1
C                 -2.96270000   -2.38740000    1.97270000
C                 -3.39150000   -3.20370000    0.93130000
C                 -2.66350000   -3.25830000   -0.25990000
C                 -1.48900000   -2.50100000   -0.43420000
C                 -1.09260000   -1.65540000    0.61660000
C                 -1.81180000   -1.61900000    1.81730000
C                 -0.77380000   -2.59470000   -1.76620000
O                  0.04740000   -0.89260000    0.58230000
C                  0.73490000   -2.63860000   -1.71900000
C                  1.41290000   -3.86570000   -1.69350000
C                  2.80950000   -3.90290000   -1.67320000
C                  3.54450000   -2.71720000   -1.67700000
C                  2.88490000   -1.48960000   -1.68660000
C                  1.48990000   -1.45540000   -1.68660000
O                  0.86580000   -0.23230000   -1.68660000
C                  0.89560000    3.56830000   -3.14220000
C                  0.58810000    4.90000000   -2.86400000
C                  0.03940000    5.24570000   -1.62910000
C                 -0.20180000    4.25970000   -0.67250000
C                  0.10570000    2.92800000   -0.95070000
C                  0.65440000    2.58230000   -2.18560000
C                 -0.79070000    4.63080000    0.65280000
O                 -0.12870000    1.97010000   -0.02140000
C                 -0.94860000    3.40080000    1.49150000
C                 -1.48110000    3.49690000    2.77700000
C                 -1.62810000    2.35090000    3.55850000
C                 -1.24260000    1.10880000    3.05430000
C                 -0.71020000    1.01270000    1.76870000
C                 -0.56310000    2.15870000    0.98730000
O                 -0.04580000    2.06540000   -0.26160000
P                  0.22730000    0.42810000   -0.34360000
C                 -1.34070000   -0.74890000    2.94080000
C                 -0.76130000   -1.61940000    4.04810000
C                 -2.51390000    0.05430000    3.48680000
C                 -0.26750000    0.20390000    2.43090000
C                  0.98450000    1.15300000   -2.48430000
C                  1.56600000    1.04910000   -3.88810000
C                 -0.28100000    0.31050000   -2.39460000
C                  2.00470000    0.64450000   -1.47420000
C                  0.84680000    5.95830000   -3.89080000
C                  0.42560000    7.31400000   -3.33940000
C                  0.04670000    5.65050000   -5.14950000
C                  2.33160000    5.98750000   -4.22840000
C                 -0.29660000   -0.32040000    1.22760000
C                  0.24750000   -0.14820000   -0.18450000
C                 -1.50110000   -1.25200000    1.19820000
C                  0.78480000   -0.91790000    2.11820000
C                 -4.63380000   -4.02420000    1.08700000
C                 -5.18150000   -4.38160000   -0.28840000
C                 -5.67650000   -3.22510000    1.85750000
C                 -4.30800000   -5.30120000    1.85040000
C                  3.66880000   -0.21430000   -1.69680000
C                  5.15790000   -0.53400000   -1.69460000
C                  3.32270000    0.60410000   -0.45990000
C                  3.32380000    0.58510000   -2.94640000
C                  3.51990000   -5.22040000   -1.64730000
C                  2.60110000   -6.30320000   -2.19760000
C                  3.90540000   -5.56100000   -0.21380000
C                  4.77630000   -5.13800000   -2.50420000
C                 -2.19950000    2.45400000    4.93830000
C                 -2.54050000    1.06130000    5.45170000
C                 -3.46160000    3.30570000    4.90250000
C                 -1.17810000    3.09990000    5.86510000
H                 -3.53000000   -2.34910000    2.91430000
H                 -3.01450000   -3.90530000   -1.07740000
H                 -1.06720000   -1.70720000   -2.37030000
H                 -1.08370000   -3.57210000   -2.19910000
H                  0.84140000   -4.80550000   -1.68930000
H                  4.64400000   -2.75120000   -1.67240000
H                  1.32840000    3.29570000   -4.11610000
H                 -0.20310000    6.29600000   -1.40960000
H                 -0.11520000    5.34800000    1.17060000
H                 -1.78610000    5.10360000    0.49700000
H                 -1.78520000    4.47650000    3.17460000
H                 -1.35860000    0.20510000    3.67050000
H                  0.05670000    2.86400000   -0.80610000
H                  0.09600000   -2.20640000    3.64910000
H                 -1.54560000   -2.31570000    4.42070000
H                 -0.41110000   -0.97250000    4.88340000
H                 -2.93730000    0.69040000    2.67750000
H                 -3.29820000   -0.64200000    3.85930000
H                 -2.16360000    0.70120000    4.32200000
H                 -0.69000000    0.84050000    1.62160000
H                  0.58950000   -0.38310000    2.03130000
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H                  2.49080000    1.66480000   -3.95370000
H                  0.82050000    1.42070000   -4.62630000
H                  1.81140000   -0.01350000   -4.11010000
H                 -0.70600000    0.38640000   -1.36870000
H                 -1.02660000    0.68210000   -3.13280000
H                 -0.03560000   -0.75220000   -2.61660000
H                  1.58070000    0.72000000   -0.44790000
H                  2.92930000    1.26060000   -1.53930000
H                  2.24940000   -0.41810000   -1.69710000
H                  1.01040000    7.53900000   -2.41950000
H                 -0.65950000    7.29270000   -3.09260000
H                  0.61800000    8.10080000   -4.10280000
H                  0.35450000    4.65970000   -5.55250000
H                 -1.03840000    5.62910000   -4.90280000
H                  0.23900000    6.43720000   -5.91290000
H                  2.64050000    4.99700000   -4.63150000
H                  2.91650000    6.21180000   -3.30840000
H                  2.52290000    6.77450000   -4.99180000
H                  1.12770000    0.53260000   -0.16300000
H                 -0.54280000    0.28840000   -0.83530000
H                  0.55500000   -1.13940000   -0.58680000
H                 -1.89870000   -1.37780000    2.23010000
H                 -2.29130000   -0.81540000    0.54730000
H                 -1.19360000   -2.24310000    0.79590000
H                  0.38820000   -1.04410000    3.15040000
H                  1.66480000   -0.23670000    2.14010000
H                  1.09160000   -1.90890000    1.71500000
H                 -4.41950000   -4.96560000   -0.85150000
H                 -5.41970000   -3.44840000   -0.84630000
H                 -6.10520000   -4.99170000   -0.17270000
H                 -5.27620000   -2.96390000    2.86260000
H                 -5.91470000   -2.29190000    1.29960000
H                 -6.60020000   -3.83510000    1.97320000
H                 -3.90760000   -5.04110000    2.85570000
H                 -3.54550000   -5.88490000    1.28760000
H                 -5.23220000   -5.91050000    1.96550000
H                  5.41090000   -1.13200000   -2.59850000
H                  5.41000000   -1.11820000   -0.78140000
H                  5.74070000    0.41420000   -1.70220000
H                  2.23450000    0.83770000   -0.46150000
H                  3.57480000    0.01990000    0.45330000
H                  3.90550000    1.55220000   -0.46750000
H                  2.23570000    0.81920000   -2.94900000
H                  3.57620000   -0.01320000   -3.85040000
H                  3.90710000    1.53300000   -2.95310000
H                  2.31940000   -6.05430000   -3.24520000
H                  1.68290000   -6.36340000   -1.57150000
H                  3.12920000   -7.28270000   -2.17840000
H                  4.57680000   -4.76970000    0.18830000
H                  2.98720000   -5.62120000    0.41240000
H                  4.43350000   -6.54050000   -0.19460000
H                  5.44850000   -4.34690000   -2.10290000
H                  4.49460000   -4.88850000   -3.55170000
H                  5.30360000   -6.11790000   -2.48430000
H                 -1.61820000    0.43880000    5.47780000
H                 -3.28690000    0.58920000    4.77430000
H                 -2.96530000    1.13790000    6.47750000
H                 -3.21240000    4.32350000    4.52730000
H                 -4.20800000    2.83370000    4.22520000
H                 -3.88640000    3.38240000    5.92840000
H                 -0.92820000    4.11780000    5.49080000
H                 -0.25560000    2.47780000    5.89080000
H                 -1.60390000    3.17610000    6.89060000

1 2 2.0 6 1.0 64 1.0
2 3 1.0 48 1.0
3 4 2.0 65 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5 6 2.0 8 1.0
6 32 1.0
7 9 1.0 66 1.0 67 1.0
8 31 1.0
9 10 2.0 14 1.0
10 11 1.0 68 1.0
11 12 2.0 56 1.0
12 13 1.0 69 1.0
13 14 2.0 52 1.0
14 15 1.0
15 31 1.0
16 17 2.0 21 1.0 70 1.0
17 18 1.0 40 1.0
18 19 2.0 71 1.0
19 20 1.0 22 1.0
20 21 2.0 23 1.0
21 36 1.0
22 24 1.0 72 1.0 73 1.0
23 31 1.0
24 25 2.0 29 1.0
25 26 1.0 74 1.0
26 27 2.0 60 1.0
27 28 1.0 75 1.0
28 29 2.0 44 1.0
29 30 1.0
30 76 1.0
31
32 33 1.0 34 1.0 35 1.0
33 77 1.0 78 1.0 79 1.0
34 80 1.0 81 1.0 82 1.0
35 83 1.0 84 1.0 85 1.0
36 37 1.0 38 1.0 39 1.0
37 86 1.0 87 1.0 88 1.0
38 89 1.0 90 1.0 91 1.0
39 92 1.0 93 1.0 94 1.0
40 41 1.0 42 1.0 43 1.0
41 95 1.0 96 1.0 97 1.0
42 98 1.0 99 1.0 100 1.0
43 101 1.0 102 1.0 103 1.0
44 45 1.0 46 1.0 47 1.0
45 104 1.0 105 1.0 106 1.0
46 107 1.0 108 1.0 109 1.0
47 110 1.0 111 1.0 112 1.0
48 49 1.0 50 1.0 51 1.0
49 113 1.0 114 1.0 115 1.0
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51 119 1.0 120 1.0 121 1.0
52 53 1.0 54 1.0 55 1.0
53 122 1.0 123 1.0 124 1.0
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55 128 1.0 129 1.0 130 1.0
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1楼2013-10-21 09:09:34
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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gkf高: 金币+2 2013-10-21 09:57:03
123just: 金币+3, ★★★很有帮助, 把构型重新整了一下，还是出错了Error in internal coordinate system，L103 2013-10-23 10:16:53
你的分子结构里，粗看了一下，31P和45C，30O和23O，20C和76H， 这些原子互相重叠。
你的分子结构本来就是如此吗？
赞一下 回复此楼
3楼2013-10-21 09:29:10
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2013-11-13 19:36:32
引用回帖:
4楼: Originally posted by 123just at 2013-11-13 12:43:18
你好，我这个分子又出错了，改了输入文件，麻烦你帮忙看一下，到底什么情况啊，跑了快十天了，结果Atoms too close.Error termination via Lnk1e in /home/cxw/Gaussian/g09/l202.exe.  我只想优化一下这个分子，如 ...

我照你的分子去画画来画去都少了12个原子。。。。你那分子画得看得人眼睛花。。。建议你用GV重新画一个，适当调整一两个二面角让某些看上去很近的原子隔得远一些，然后在优化看看，用nosymm打破对称性试试
赞一下 回复此楼
5楼2013-11-13 13:41:57
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