24小时热门版块排行榜    

查看: 2937  |  回复: 15

月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by pigrass at 2014-03-03 22:57:59
初步试下来可能是fix cartesian position的原因
教程中minimize操作解除了之前部分原子cartesian position的fix,minimize前后结构的能量表达式改变,所以虽然结构看起来一样,但是能量计算方式不同,结果不同

...

非常感谢您时间的付出。
如果按照教程来,我也发现“最后结构没有变化,但是out文件的能量不一样”,那么是不是可以认为,尽管out文件中显示能量有差异,但实际上原结构并没有被优化呢?
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
11楼2014-03-04 08:27:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-04 16:51:11
引用回帖:
11楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-03-04 08:27:01
非常感谢您时间的付出。
如果按照教程来,我也发现“最后结构没有变化,但是out文件的能量不一样”,那么是不是可以认为,尽管out文件中显示能量有差异,但实际上原结构并没有被优化呢?...

我觉得是这么理解吧
结构是被优化了,只是正好优化后的结构和初始结构一致
因为原子位置限制的原因,所以两个结构能量有较大差异
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
12楼2014-03-04 09:33:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+50, ★★★很有帮助, 您终于选择应助,可以给你金币了。 2014-03-04 11:14:58
dis里初始结构和最终结果原子的限定状态不一样
在forcite里,初始结构fix,最终结构也限定了
这点上感觉dis不是很靠谱……

forcite数据
1、不限定原子
几何优化前后能量是差异不大
---- Initial structure ----
Total enthalpy                  : -21161.553598 kcal/mol
  External pressure term        : 0.000000 kcal/mol
Total energy                    :      -21161.553598 kcal/mol
---- Final structure ----
Total enthalpy                  : -21218.565110 kcal/mol
  External pressure term        : 0.000000 kcal/mol
Total energy                    :      -21218.565110 kcal/mol
2、限定原子
几何优化前后能量是差异不大
---- Initial structure ----
Total enthalpy                  : -4791.154883 kcal/mol
  External pressure term        : 0.000000 kcal/mol
Total energy                    :       -4791.154883 kcal/mol
---- Final structure ----
Total enthalpy                  : -4819.258852 kcal/mol
  External pressure term        : 0.000000 kcal/mol
Total energy                    :       -4819.258852 kcal/mol
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
13楼2014-03-04 09:53:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
13楼: Originally posted by pigrass at 2014-03-04 09:53:35
dis里初始结构和最终结果原子的限定状态不一样
在forcite里,初始结构fix,最终结构也限定了
这点上感觉dis不是很靠谱……

forcite数据
1、不限定原子
几何优化前后能量是差异不大
---- Initial structure  ...

https://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7004165&target=self&page=1
帮忙给这个帖子看看吧。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
14楼2014-03-04 11:16:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

昨天我也不知道为啥没有应助选项,就一个“只回复”和“送红花”
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
15楼2014-03-04 13:04:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
15楼: Originally posted by pigrass at 2014-03-04 13:04:22
昨天我也不知道为啥没有应助选项,就一个“只回复”和“送红花”

哦,那是因为金币已经送完,主题已经完结,就只有以上选项。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
16楼2014-03-04 16:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 月只蓝 的主题更新
信息提示
请填处理意见