10楼: Originally posted by wcfbio at 2013-10-20 16:04:12
我们实验室用的天根的提基因组试剂盒，不过也不是所有的细菌都适合用试剂盒法，有的用CTAB法提的比试剂盒要好，我们一般试剂盒提不出来的用CTAB法提，甘油保种的可以提，但是菌体可能有点少，我们一般都是接到液体培 ...

11楼: Originally posted by xiaomeng12 at 2013-11-20 22:28:34
想咨询一下，我在genbank上查某个基因，共有50多种，可以用聚类分析的方法对这个基因进行聚类分型吗？...

12楼: Originally posted by wcfbio at 2013-11-21 12:38:57
聚类分型，你是要做进化树分析么...

13楼: Originally posted by xiaomeng12 at 2013-11-21 12:41:35
它是同一种细菌，只是来自不同病人的不同菌株上的基因。可以做进化树吗？还有 1 cattttggtg agcttttata gagtaaaata aaagttctta tgggaatgct ttttatggta
       61 tccattggtg ttcgtattca ataataaaat tttctttatt at ...

14楼: Originally posted by wcfbio at 2013-11-21 17:06:09
可以的，但是你得去NCBI找更多的同源性比较高的序列。在TXT格式的文档里面碱基序列前面加>后面可以自己编辑个名字例如abc  。
>abc   
1 cattttggtg agcttttata gagtaaaata aaagttctta tgggaatgct tttta ...

15楼: Originally posted by xiaomeng12 at 2013-11-21 19:50:18
谢谢哈。。。你知道一种叫分层聚类法吗...

16楼: Originally posted by wcfbio at 2013-11-22 10:02:49
这个我还不了解的，在进化研究上我比较菜...

17楼: Originally posted by xiaomeng12 at 2013-11-22 10:41:15
呵呵，谢了。...