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xiaomeng12

银虫 (正式写手)

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[求助] DNA测序

请问如果对微生物中（有来自两个地区的标本）某一蛋白进行sanger测序，得到的结果可以分析哪些东西？有没有人在在做DNA测序方面的工作？求指教。

[ Last edited by xiaomeng12 on 2013-10-19 at 10:56 ]

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xiaomeng12

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1楼 2013-10-19 09:03:35

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木虫 (正式写手)

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引用回帖:

13楼: Originally posted by xiaomeng12 at 2013-11-21 12:41:35
它是同一种细菌，只是来自不同病人的不同菌株上的基因。可以做进化树吗？还有 1 cattttggtg agcttttata gagtaaaata aaagttctta tgggaatgct ttttatggta
61 tccattggtg ttcgtattca ataataaaat tttctttatt at ...

可以的，但是你得去NCBI找更多的同源性比较高的序列。在TXT格式的文档里面碱基序列前面加>后面可以自己编辑个名字例如abc  。
>abc
1 cattttggtg agcttttata gagtaaaata aaagttctta tgggaatgct ttttatggta
   61 tccattggtg ttcgtattca ataataaaat tttctttatt ataacccatt ttcatgcccc
   121 taattttatt ttttaaaaat aaagcccttt aaaatttcaa actttaaccg ataatagttc
   181 caaccaaaag caaggatgcc tttgggtttt ttataacaag gagttacaac aatggctttt
   241 caggtcaata caaatatcaa tgcgatgaat gcgcatgtgc aatccgcact cactcaaaac
这个就可以了