24小时热门版块排行榜    

查看: 1054  |  回复: 6

ck3369

铁虫 (小有名气)

[交流] 一个重大疑惑求解答 已有3人参与

大家好,我有一个疑惑想让各位帮我解答:我是个大学讲师,9月出来清华上博士,导师给的方向是用分子动力学的方法模拟自组装过程(我之前没有搞过计算,我以前是做实验的,当初只是觉得我们单位实验平台不好,搞搞理论可能自由度大一点)。可是,我来上博士才发现,其实分子模拟很费计算资源的,几百个核并行计算,gromacs可能也得要上百个核。这样的平台条件,不知道得多少钱?一般单位能满足不?如果我们单位不能满足这样的条件,我毕业回去怎么持续我的工作呢?难道一直用老板的计算资源,给老板打工吗?老板的学生也多,这样可行吗?我现在该怎么做?该换一个对计算资源要求低的(比如说,做量化,做模型等)方向呢,还是继续做这个方向?我很痛苦,请大家指点!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
做蒙特卡洛吧,这个需求比MD低不少,一般5万以内的机器也能玩
2楼2013-10-19 08:59:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sciencejoy

新虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你想得太多了,把现在的活干好就是了。至于以后独立工作的计算资源,不会成问题,硬件价格在下降,技术在提高,比如英伟达的GPU,英特尔的Xeon Phi
3楼2013-10-19 12:02:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ck3369

铁虫 (小有名气)

非常感谢两位的解答。我是9月份刚刚入学接触这个东西的。我也很着急,因为我还没入门,想快点入门,我现在的看是,看了分子模拟的基本原理,正开始解除namd和gromacs软件的使用,不过我对linux系统不熟。对于那些硬件的价格,性能都不了解。我现在想着,要不做完分子模拟的课题后,也学一点量化计算的方法呢?这样掌握的技能又多一个。这个应该不要求很昂贵的计算资源吧?而且组里搞量化的人很多。拜托各位再次给我解答!谢谢!
4楼2013-10-19 16:51:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
大有大的算法,小有小的做法。
别纠结这问题了。这就不是问题。
5楼2013-10-21 21:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sciencejoy

新虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by ck3369 at 2013-10-19 16:51:35
非常感谢两位的解答。我是9月份刚刚入学接触这个东西的。我也很着急,因为我还没入门,想快点入门,我现在的看是,看了分子模拟的基本原理,正开始解除namd和gromacs软件的使用,不过我对linux系统不熟。对于那些硬 ...

量化也是很费计算资源的。其实,做模拟,是不是费资源和体系与模型有关,而不是方法。
建议还是安心做MD模拟吧,人的精力是有限的
6楼2013-10-22 09:36:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ck3369

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
谢谢!呵呵
7楼2013-10-23 15:26:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ck3369 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 12/600 2026-08-12 01:27 by 南京中西医
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +17 Lanmanbaby 2026-08-09 29/1450 2026-08-12 00:24 by zhanghaozhu
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 9/450 2026-08-11 22:12 by 医学老男孩
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +3 工厂打螺丝 2026-08-08 3/150 2026-08-11 13:42 by 会议编辑
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] FileCode能看出啥? +7 要乐观耀哥 2026-08-10 17/850 2026-08-11 10:50 by 要乐观耀哥
[基金申请] filecode +9 documentary 2026-08-10 9/450 2026-08-11 10:08 by wk7465
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
请填处理意见