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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 各位大神，求一个脚本解决我服务器资源不足的问题
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前田庆次

木虫 (著名写手)

[求助] 各位大神，求一个脚本解决我服务器资源不足的问题

如题，本人的计算资源相当有限，服务器只有8个核，每天晚上回去的时候都会挂上一些任务，但是每天早晨起来发现任务都算完了，所以，能否有一个脚本，能够挨个文件夹算？比如：我有五个任务需要算，这五个任务分别在五个文件夹里面，分别名字为cal1，cal2,ca3,cal4,cal5，如何先在cal1文件夹中执行“mpirun -np 8 vasp”，然后再转到cal2中，再执行“mpirun -np 8 vasp”，然后再……依次类推，高分求脚本！
哪位大侠有可以站内信联系啊
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长枪一横花飘零，松风追月伴我行。无双人间世如梦，倾奇万世永留名。
1楼 2013-10-16 22:23:22
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 前田庆次 at 2013-10-16 12:10:13
大侠，这个要放在哪里运行？是不是要加个什么#！/bin/bash的文件头？...

放到cal1, cal2, cal3, cal4, cal5这些子文件夹所在的位置，与它们并列。
#! /bin/bash 表示使用bash shell来执行此脚本。
把这个脚本存成比run.sh
然后还要加可执行权限： chmod +x run.sh
然后执行它： ./run.sh

建议找本“Linux常用操作”“shell速成”之类的书看看。
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8楼2013-10-17 12:43:13
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 感谢参与 2013-10-17 07:38:51
前田庆次: 金币+25, ★★★很有帮助 2013-10-17 08:08:58
cd就是了
cd /home/.../cal1
mpirun -np 8 vasp
cd /home/.../cal2
mpirun -np 8 vasp
....
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2楼2013-10-17 00:41:11
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 感谢参与 2013-10-17 07:38:48
前田庆次: 金币+25, ★★★很有帮助 2013-10-17 08:08:37
CODE:
#!/bin/bash

for N in {1..5}
do

cd cal${N}
mpirun -np 8 vasp xxx
cd ..

done
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3楼2013-10-17 06:19:53
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前田庆次

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ChemiAndy at 2013-10-17 06:19:53
#!/bin/bash

for N in {1..5}
do

cd cal${N}
mpirun -np 8 vasp xxx
cd ..

done

大侠，这个脚本要放在哪里执行呢？任意位置？另外如果文件夹不叫cal1，cal2,……而叫DOS,Band,Static，这应该怎么改写呢？
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长枪一横花飘零，松风追月伴我行。无双人间世如梦，倾奇万世永留名。
4楼2013-10-17 08:08:29
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