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前田庆次

木虫 (著名写手)

[求助] 各位大神,求一个脚本解决我服务器资源不足的问题

如题,本人的计算资源相当有限,服务器只有8个核,每天晚上回去的时候都会挂上一些任务,但是每天早晨起来发现任务都算完了,所以,能否有一个脚本,能够挨个文件夹算?比如:我有五个任务需要算,这五个任务分别在五个文件夹里面,分别名字为cal1,cal2,ca3,cal4,cal5,如何先在cal1文件夹中执行“mpirun -np 8 vasp”,然后再转到cal2中,再执行“mpirun -np 8 vasp”,然后再……依次类推,高分求脚本!
哪位大侠有可以站内信联系啊
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长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 感谢参与 2013-10-17 07:38:51
前田庆次: 金币+25, ★★★很有帮助 2013-10-17 08:08:58
cd就是了
cd /home/.../cal1
mpirun -np 8 vasp
cd /home/.../cal2
mpirun -np 8 vasp
....
2楼2013-10-17 00:41:11
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 感谢参与 2013-10-17 07:38:48
前田庆次: 金币+25, ★★★很有帮助 2013-10-17 08:08:37
CODE:
#!/bin/bash

for N in {1..5}
do

cd cal${N}
mpirun -np 8 vasp xxx
cd ..

done

3楼2013-10-17 06:19:53
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ChemiAndy at 2013-10-17 06:19:53
#!/bin/bash

for N in {1..5}
do

cd cal${N}
mpirun -np 8 vasp xxx
cd ..

done

大侠,这个脚本要放在哪里执行呢?任意位置?另外如果文件夹不叫cal1,cal2,……而叫DOS,Band,Static,这应该怎么改写呢?
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
4楼2013-10-17 08:08:29
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2013-10-17 00:41:11
cd就是了
cd /home/.../cal1
mpirun -np 8 vasp
cd /home/.../cal2
mpirun -np 8 vasp
....

大侠,这个要放在哪里运行?是不是要加个什么#!/bin/bash的文件头?
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
5楼2013-10-17 08:10:13
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

你用绝对路径, 放在那里都可以
6楼2013-10-17 08:30:40
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jerkwin at 2013-10-17 08:30:40
你用绝对路径, 放在那里都可以

多谢大侠指教!
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
7楼2013-10-17 12:42:40
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by 前田庆次 at 2013-10-16 12:10:13
大侠,这个要放在哪里运行?是不是要加个什么#!/bin/bash的文件头?...

放到cal1, cal2, cal3, cal4, cal5这些子文件夹所在的位置,与它们并列。
#! /bin/bash 表示使用bash shell来执行此脚本。
把这个脚本存成比run.sh
然后还要加可执行权限: chmod +x run.sh
然后执行它: ./run.sh

建议找本“Linux常用操作”“shell速成”之类的书看看。
8楼2013-10-17 12:43:13
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by ChemiAndy at 2013-10-17 12:43:13
放到cal1, cal2, cal3, cal4, cal5这些子文件夹所在的位置,与它们并列。
#! /bin/bash 表示使用bash shell来执行此脚本。
把这个脚本存成比run.sh
然后还要加可执行权限: chmod +x run.sh
然后执行它: ./ru ...

多谢大侠指教
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
9楼2013-10-17 15:00:44
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