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marson

银虫 (正式写手)

[交流] 使用重水做溶剂高斯计算时大家都是怎么考虑溶剂化模型呢？PCM里面好像没有重水的选项

使用重水做溶剂高斯计算时大家都是怎么考虑溶剂化模型呢？PCM里面好像没有重水的选项
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1楼 2013-10-15 21:37:06
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marson

银虫 (正式写手)
引用回帖:
16楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-10-18 13:05:59
重水这个东西，要看是否参与反应了。若不参与，用隐式模型就修改一下溶剂的一些参数就行。如果用显示模型，可以尝试一下用QM/MM计算一下试试

修改参数如何进行呢，我也尝试看了下修改参数的东西，模拟没有模拟出来~
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18楼2013-10-20 12:38:14
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
marson(金币+1): 谢谢参与
gkf高: 金币+3 2013-10-17 09:21:51
隐式溶剂模型考虑的是溶剂对溶质的平均的、静电的诱导极化作用。此作用仅与溶剂的核外电子有关，与核无关。重水多一个中子，此中子并不影响水分子的核外电子排布，不参与静电作用，因此不存在重水的隐式溶剂选项。

当然，在真实的体系中，重水与轻水的溶剂化效应对一些与质量有关的性质的影响是有差别的，比如振动耦合。如果这是你关心的，你应该使用显式溶剂并跑分子动力学模拟之。

[ Last edited by ChemiAndy on 2013-10-16 at 10:37 ]
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13楼2013-10-17 06:35:57
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marson

银虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by ChemiAndy at 2013-10-17 06:35:57
隐式溶剂模型考虑的是溶剂对溶质的平均的、静电的诱导极化作用。此作用仅与溶剂的核外电子有关，与核无关。重水多一个中子，此中子并不影响水分子的核外电子排布，不参与静电作用，因此不存在重水的隐式溶剂选项。
...

如何使用显示溶剂呢？高斯能完成不？我只关心水与重水的溶剂效应对反应路径能量的影响~
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14楼2013-10-18 08:49:15
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