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marson

银虫 (正式写手)

[交流] 使用重水做溶剂高斯计算时大家都是怎么考虑溶剂化模型呢？PCM里面好像没有重水的选项

使用重水做溶剂高斯计算时大家都是怎么考虑溶剂化模型呢？PCM里面好像没有重水的选项
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1楼 2013-10-15 21:37:06
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
marson: 金币+7, 你的回答一下解决了我很多疑惑~万分感谢~ 2013-10-20 12:37:30
gkf高: 金币+4 2013-10-21 09:57:45
引用回帖:
14楼: Originally posted by marson at 2013-10-17 12:49:15
如何使用显示溶剂呢？高斯能完成不？我只关心水与重水的溶剂效应对反应路径能量的影响~...

用高斯模拟重水的溶剂化效应恐怕很难。你是要跟轻水计算的溶剂化效应相比较吗？

我认为重水不改变反应路径，即不改变反应势能面，不改变反应能垒和产物反应物的能差。因为这个势能面是由电子结构决定的，而H原子加一个中子并不改变其本身的电子结构。但是，重水能减缓其中的反应速率。根据分子碰撞理论，反应速率与碰撞的频率有关，这个频率包含在阿伦尼乌斯公式的指前因子里面。因为重水比较重，振动的慢，碰撞也慢，所以其中的反应速率也慢。
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15楼2013-10-18 10:15:40
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
marson(金币+1): 谢谢参与
gkf高: 金币+3 2013-10-17 09:21:51
隐式溶剂模型考虑的是溶剂对溶质的平均的、静电的诱导极化作用。此作用仅与溶剂的核外电子有关，与核无关。重水多一个中子，此中子并不影响水分子的核外电子排布，不参与静电作用，因此不存在重水的隐式溶剂选项。

当然，在真实的体系中，重水与轻水的溶剂化效应对一些与质量有关的性质的影响是有差别的，比如振动耦合。如果这是你关心的，你应该使用显式溶剂并跑分子动力学模拟之。

[ Last edited by ChemiAndy on 2013-10-16 at 10:37 ]
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13楼2013-10-17 06:35:57
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marson

银虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by ChemiAndy at 2013-10-17 06:35:57
隐式溶剂模型考虑的是溶剂对溶质的平均的、静电的诱导极化作用。此作用仅与溶剂的核外电子有关，与核无关。重水多一个中子，此中子并不影响水分子的核外电子排布，不参与静电作用，因此不存在重水的隐式溶剂选项。
...

如何使用显示溶剂呢？高斯能完成不？我只关心水与重水的溶剂效应对反应路径能量的影响~
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14楼2013-10-18 08:49:15
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