|
|
[求助]
质子化甲醛的NBO解释
想借助NBO看看孤对电子离域对带电离子的稳定作用,得到了质子化甲醛的NBO结果,还是很多地方不明白,请各位指教。
1.HO-CH2+ 和H2C=O+H是一对共振结构,能否用gaussian分别优化得到这两个共振结构,目前我只得到了H2C=O+H,这一结果。
2.如果分析O原子上孤对电子离域并与C原子形成pi键的情况应该如何分析呢?
NBO部分结果如下:
(Occupancy) Bond orbital/ Coefficients/ Hybrids
---------------------------------------------------------------------------------
3. (1.99418) BD ( 1) C 1 - O 4
( 30.56%) 0.5528* C 1 s( 24.33%)p 3.10( 75.40%)d 0.01( 0.27%)
-0.0001 -0.4858 -0.0852 0.0010 -0.8266
0.0729 0.0072 0.0621 -0.0153 -0.0015
-0.2473 -0.0035 0.0009 0.0020 -0.0247
0.0003 -0.0420 0.0186
( 69.44%) 0.8333* O 4 s( 28.22%)p 2.54( 71.68%)d 0.00( 0.10%)
0.0000 -0.5311 -0.0098 0.0000 0.8221
-0.0039 -0.0007 -0.1205 -0.0144 0.0028
-0.1616 -0.0007 -0.0003 0.0165 -0.0006
-0.0019 -0.0200 0.0180
4. (1.99487) BD ( 2) C 1 - O 4
( 22.27%) 0.4720* C 1 s( 5.13%)p18.40( 94.35%)d 0.10( 0.52%)
0.0000 -0.2262 -0.0111 -0.0011 -0.1528
0.0156 0.0009 -0.0049 -0.0108 -0.0019
0.9585 0.0320 0.0017 0.0042 0.0699
-0.0006 -0.0141 0.0103
( 77.73%) 0.8816* O 4 s( 0.35%)p99.99( 99.56%)d 0.26( 0.09%)
0.0000 -0.0592 -0.0029 0.0001 0.1579
-0.0001 0.0000 0.0183 -0.0031 0.0002
0.9850 0.0090 -0.0015 0.0024 -0.0212
0.0206 -0.0047 -0.0010
从结果看C1-O4形成两个键:BD ( 1) C 1 - O 4 的主要成分是2s和2px
BD ( 2) C 1 - O 4 的主要成分是2pz
是不是可以认为BD ( 2) C 1 - O 4(pi键)电子主要来源于O原子2pz轨道上的孤对电子。
3.NHO 这部分应该如何解释呢?
Line of Centers Hybrid 1 Hybrid 2
--------------- ------------------- ------------------
NBO Theta Phi Theta Phi Dev Theta Phi Dev
========================================================================================
1. BD ( 1) C 1 - H 2 77.0 114.5 83.3 112.4 6.6 -- -- --
2. BD ( 1) C 1 - H 3 81.1 239.2 85.0 239.2 4.0 -- -- --
3. BD ( 1) C 1 - O 4 86.2 353.6 71.5 356.5 15.0 78.9 170.8 15.1
4. BD ( 2) C 1 - O 4 86.2 353.6 172.1 7.4 86.1 170.9 185.6 77.4
5. BD ( 1) O 4 - H 5 95.5 63.9 93.4 63.0 2.3 -- -- --
8. LP ( 1) O 4 -- -- 90.3 299.5 -- -- -- --
4.O4是孤对电子提供给BD(C1 - O4)键电子的供体,二阶微扰理论分析中为什么没有关于LP(O4) 与 BD(C1 - O4)的作用情况呢 ?
Threshold for printing: 0.50 kcal/mol
E(2) E(j)-E(i) F(i,j)
Donor NBO (i) Acceptor NBO (j) kcal/mol a.u. a.u.
===================================================================================================
within unit 1
1. BD ( 1) C 1 - H 2 / 52. BD*( 1) C 1 - O 4 1.89 0.88 0.036
1. BD ( 1) C 1 - H 2 / 53. BD*( 2) C 1 - O 4 1.96 0.51 0.028
1. BD ( 1) C 1 - H 2 / 54. BD*( 1) O 4 - H 5 0.51 1.02 0.020
2. BD ( 1) C 1 - H 3 / 32. RY*( 1) O 4 0.63 1.79 0.030
2. BD ( 1) C 1 - H 3 / 52. BD*( 1) C 1 - O 4 0.58 0.86 0.020
2. BD ( 1) C 1 - H 3 / 53. BD*( 2) C 1 - O 4 1.81 0.50 0.027
2. BD ( 1) C 1 - H 3 / 54. BD*( 1) O 4 - H 5 1.70 1.01 0.037
3. BD ( 1) C 1 - O 4 / 53. BD*( 2) C 1 - O 4 3.42 0.82 0.047
4. BD ( 2) C 1 - O 4 / 46. RY*( 2) H 5 1.16 1.95 0.043
4. BD ( 2) C 1 - O 4 / 52. BD*( 1) C 1 - O 4 1.61 0.72 0.030
5. BD ( 1) O 4 - H 5 / 9. RY*( 1) C 1 3.01 1.85 0.067
5. BD ( 1) O 4 - H 5 / 50. BD*( 1) C 1 - H 2 0.86 1.17 0.028
5. BD ( 1) O 4 - H 5 / 51. BD*( 1) C 1 - H 3 1.10 1.18 0.032
6. CR ( 1) C 1 / 22. RY*( 1) H 2 0.55 10.73 0.069
6. CR ( 1) C 1 / 24. RY*( 3) H 2 0.51 12.12 0.070
6. CR ( 1) C 1 / 27. RY*( 1) H 3 0.73 10.93 0.080
6. CR ( 1) C 1 / 52. BD*( 1) C 1 - O 4 0.81 10.51 0.082
6. CR ( 1) C 1 / 53. BD*( 2) C 1 - O 4 1.98 10.14 0.127
7. CR ( 1) O 4 / 9. RY*( 1) C 1 1.33 20.10 0.146
7. CR ( 1) O 4 / 11. RY*( 3) C 1 0.62 20.08 0.099
7. CR ( 1) O 4 / 48. RY*( 4) H 5 0.84 20.79 0.118
8. LP ( 1) O 4 / 10. RY*( 2) C 1 1.81 2.76 0.063
8. LP ( 1) O 4 / 45. RY*( 1) H 5 1.66 2.38 0.056
8. LP ( 1) O 4 / 50. BD*( 1) C 1 - H 2 2.24 1.04 0.043
8. LP ( 1) O 4 / 51. BD*( 1) C 1 - H 3 2.09 1.05 0.042
![质子化甲醛的NBO解释]()
CH2OH.png
[ Last edited by nnipp on 2013-10-14 at 15:29 ] |
|