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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 质子化甲醛的NBO解释
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nnipp

金虫 (小有名气)

[求助] 质子化甲醛的NBO解释

想借助NBO看看孤对电子离域对带电离子的稳定作用，得到了质子化甲醛的NBO结果，还是很多地方不明白，请各位指教。
1.HO-CH2+ 和H2C=O+H是一对共振结构，能否用gaussian分别优化得到这两个共振结构，目前我只得到了H2C=O+H，这一结果。
2.如果分析O原子上孤对电子离域并与C原子形成pi键的情况应该如何分析呢？
NBO部分结果如下：
       (Occupancy)   Bond orbital/ Coefficients/ Hybrids
---------------------------------------------------------------------------------
      3. (1.99418) BD ( 1) C   1 - O   4  
                ( 30.56%)   0.5528* C   1 s( 24.33%)p 3.10( 75.40%)d 0.01(  0.27%)
                                           -0.0001 -0.4858 -0.0852  0.0010 -0.8266
                                            0.0729  0.0072  0.0621 -0.0153 -0.0015
                                           -0.2473 -0.0035  0.0009  0.0020 -0.0247
                                            0.0003 -0.0420  0.0186
                ( 69.44%)   0.8333* O   4 s( 28.22%)p 2.54( 71.68%)d 0.00(  0.10%)
                                            0.0000 -0.5311 -0.0098  0.0000  0.8221
                                           -0.0039 -0.0007 -0.1205 -0.0144  0.0028
                                           -0.1616 -0.0007 -0.0003  0.0165 -0.0006
                                           -0.0019 -0.0200  0.0180
     4. (1.99487) BD ( 2) C   1 - O   4  
                ( 22.27%)   0.4720* C   1 s(  5.13%)p18.40( 94.35%)d 0.10(  0.52%)
                                            0.0000 -0.2262 -0.0111 -0.0011 -0.1528
                                            0.0156  0.0009 -0.0049 -0.0108 -0.0019
                                            0.9585  0.0320  0.0017  0.0042  0.0699
                                           -0.0006 -0.0141  0.0103
                ( 77.73%)   0.8816* O   4 s(  0.35%)p99.99( 99.56%)d 0.26(  0.09%)
                                            0.0000 -0.0592 -0.0029  0.0001  0.1579
                                           -0.0001  0.0000  0.0183 -0.0031  0.0002
                                            0.9850  0.0090 -0.0015  0.0024 -0.0212
                                            0.0206 -0.0047 -0.0010
从结果看C1-O4形成两个键：BD ( 1) C   1 - O   4 的主要成分是2s和2px
                                             BD ( 2) C   1 - O   4 的主要成分是2pz
是不是可以认为BD ( 2) C   1 - O   4（pi键）电子主要来源于O原子2pz轨道上的孤对电子。
3.NHO 这部分应该如何解释呢？
                                Line of Centers        Hybrid 1              Hybrid 2
                                ---------------  -------------------   ------------------
                NBO               Theta   Phi    Theta   Phi    Dev    Theta   Phi    Dev
========================================================================================
     1. BD (   1) C   1 - H   2    77.0  114.5    83.3  112.4   6.6      --     --    --
     2. BD (   1) C   1 - H   3    81.1  239.2    85.0  239.2   4.0      --     --    --
     3. BD (   1) C   1 - O   4    86.2  353.6    71.5  356.5  15.0     78.9  170.8  15.1
     4. BD (   2) C   1 - O   4    86.2  353.6   172.1    7.4  86.1    170.9  185.6  77.4
     5. BD (   1) O   4 - H   5    95.5   63.9    93.4   63.0   2.3      --     --    --
     8. LP (   1) O   4             --     --     90.3  299.5   --       --     --    --
4.O4是孤对电子提供给BD（C1 - O4）键电子的供体，二阶微扰理论分析中为什么没有关于LP（O4）  与 BD（C1 - O4）的作用情况呢  ？

     Threshold for printing:   0.50 kcal/mol
                                                                              E(2)  E(j)-E(i) F(i,j)
         Donor NBO (i)                     Acceptor NBO (j)                 kcal/mol   a.u.    a.u.
===================================================================================================

within unit  1
   1. BD (   1) C   1 - H   2        / 52. BD*(   1) C   1 - O   4            1.89    0.88    0.036
   1. BD (   1) C   1 - H   2        / 53. BD*(   2) C   1 - O   4            1.96    0.51    0.028
   1. BD (   1) C   1 - H   2        / 54. BD*(   1) O   4 - H   5            0.51    1.02    0.020
   2. BD (   1) C   1 - H   3        / 32. RY*(   1) O   4                    0.63    1.79    0.030
   2. BD (   1) C   1 - H   3        / 52. BD*(   1) C   1 - O   4            0.58    0.86    0.020
   2. BD (   1) C   1 - H   3        / 53. BD*(   2) C   1 - O   4            1.81    0.50    0.027
   2. BD (   1) C   1 - H   3        / 54. BD*(   1) O   4 - H   5            1.70    1.01    0.037
   3. BD (   1) C   1 - O   4        / 53. BD*(   2) C   1 - O   4            3.42    0.82    0.047
   4. BD (   2) C   1 - O   4        / 46. RY*(   2) H   5                    1.16    1.95    0.043
   4. BD (   2) C   1 - O   4        / 52. BD*(   1) C   1 - O   4            1.61    0.72    0.030
   5. BD (   1) O   4 - H   5        /  9. RY*(   1) C   1                    3.01    1.85    0.067
   5. BD (   1) O   4 - H   5        / 50. BD*(   1) C   1 - H   2            0.86    1.17    0.028
   5. BD (   1) O   4 - H   5        / 51. BD*(   1) C   1 - H   3            1.10    1.18    0.032
   6. CR (   1) C   1                / 22. RY*(   1) H   2                    0.55   10.73    0.069
   6. CR (   1) C   1                / 24. RY*(   3) H   2                    0.51   12.12    0.070
   6. CR (   1) C   1                / 27. RY*(   1) H   3                    0.73   10.93    0.080
   6. CR (   1) C   1                / 52. BD*(   1) C   1 - O   4            0.81   10.51    0.082
   6. CR (   1) C   1                / 53. BD*(   2) C   1 - O   4            1.98   10.14    0.127
   7. CR (   1) O   4                /  9. RY*(   1) C   1                    1.33   20.10    0.146
   7. CR (   1) O   4                / 11. RY*(   3) C   1                    0.62   20.08    0.099
   7. CR (   1) O   4                / 48. RY*(   4) H   5                    0.84   20.79    0.118
   8. LP (   1) O   4                / 10. RY*(   2) C   1                    1.81    2.76    0.063
   8. LP (   1) O   4                / 45. RY*(   1) H   5                    1.66    2.38    0.056
   8. LP (   1) O   4                / 50. BD*(   1) C   1 - H   2            2.24    1.04    0.043
   8. LP (   1) O   4                / 51. BD*(   1) C   1 - H   3            2.09    1.05    0.042
质子化甲醛的NBO解释
CH2OH.png

[ Last edited by nnipp on 2013-10-14 at 15:29 ]
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1楼 2013-10-12 17:08:32
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