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fegnzaixie

木虫 (著名写手)

[求助] 高斯软件计算吸收光谱

计算有机小分子的吸收光谱
在稳定基态分子的构型基础上，TD计算分子的吸收光谱，数据如下：
Excitation energies and oscillator strengths:

Excited State   1:   Singlet-A      3.5253 eV  351.69 nm  f=0.0019
     136 ->137         0.70215
This state for optimization and/or second-order correction.
Total Energy, E(RPA) =  -2297.29416011   
Copying the excited state density for this state as the 1-particle RhoCI density.

Excited State   2:   Singlet-A      3.9493 eV  313.94 nm  f=0.0000
     135 ->137         0.70554

Excited State   3:   Singlet-A      4.0406 eV  306.85 nm  f=0.0269
     135 ->144         0.18816
     136 ->139        -0.21217
     136 ->140         0.62624

Excited State   4:   Singlet-A      4.0905 eV  303.11 nm  f=0.2520
     136 ->139         0.39070
     136 ->140         0.10833
     136 ->141         0.53205
     136 ->142        -0.14131

Excited State   5:   Singlet-A      4.1932 eV  295.68 nm  f=0.0059
     136 ->138         0.54877
     136 ->142         0.38604
     136 ->143        -0.19660

Excited State   6:   Singlet-A      4.2915 eV  288.91 nm  f=0.0022
     136 ->138         0.42270
     136 ->139        -0.20765
     136 ->142        -0.37742
     136 ->143         0.33710

Excited State   7:   Singlet-A      4.3722 eV  283.58 nm  f=0.0054
     136 ->139         0.48248
     136 ->140         0.18003
     136 ->141        -0.41725
     136 ->142        -0.13397
     136 ->143         0.14841

Excited State   8:   Singlet-A      4.5104 eV  274.89 nm  f=0.0126
     134 ->140         0.10123
     135 ->139         0.24934
     135 ->140         0.36786
     135 ->141         0.49098
     135 ->142        -0.15071
     136 ->144        -0.11793

Excited State   9:   Singlet-A      4.5670 eV  271.48 nm  f=0.0637
     135 ->139        -0.34438
     135 ->140         0.37452
     135 ->141        -0.20980
     136 ->142        -0.13192
     136 ->143        -0.15590
     136 ->144        -0.34271

Excited State  10:   Singlet-A      4.5731 eV  271.12 nm  f=0.0084
     135 ->139        -0.10035
     135 ->140         0.12055
     136 ->141         0.12372
     136 ->142         0.37684
     136 ->143         0.53260
     136 ->144        -0.11755
请问如果处理这个结果，可以得到吸收谱图。
求救
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1楼 2013-10-11 19:30:36
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ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用Gaussview打开log文件，result---》UV-Vis可以看到以柱状图和曲线图表示的模拟出来的UV-Vis，曲线图的数据可以保存用来Origin画图。
也可直接取这些跃迁的波长及振子强度，在Oringin中画柱状图。
跃迁归属方面，你如果把跃迁吸收的平方乘以二，就得到该跃迁对该波长的贡献，然后通过该跃迁涉及的分子轨道，就可以解释跃迁归属。
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2楼2013-10-12 10:17:28
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ZJboy

木虫 (著名写手)
引用回帖:
26楼: Originally posted by fmchtde481 at 2015-04-25 21:52:53
你好，请问曲线图的数据怎么保存到origin里来画图？谢谢！...

在高斯View的UV-Vis功能出来的图谱窗口中，单击右键，选择save data，写文件名，然后将Range的起始区间以及步长都按需求及爱好修改，然后Save。
就得到了可以在Origin中画图的数据文件（但可能需要先在Excel中分列）。
半峰宽也可以改。
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fmchtde481
27楼2015-04-26 00:37:08
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fegnzaixie

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ZJboy at 2013-10-12 10:17:28
用Gaussview打开log文件，result---》UV-Vis可以看到以柱状图和曲线图表示的模拟出来的UV-Vis，曲线图的数据可以保存用来Origin画图。
也可直接取这些跃迁的波长及振子强度，在Oringin中画柱状图。
跃迁归属方面， ...

你好，我用Gaussview看Log文件，但是Gaussview中的Results中除了SUmmary,surface是高亮显示的，其它的选项都不可查看。怎么办。我的高斯是window版本的
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3楼2013-10-12 10:24:39
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ZJboy

木虫 (著名写手)
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23楼2014-01-02 00:33:32
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fmchtde481

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ZJboy at 2013-10-12 10:17:28
用Gaussview打开log文件，result---》UV-Vis可以看到以柱状图和曲线图表示的模拟出来的UV-Vis，曲线图的数据可以保存用来Origin画图。
也可直接取这些跃迁的波长及振子强度，在Oringin中画柱状图。
跃迁归属方面， ...

你好，请问曲线图的数据怎么保存到origin里来画图？谢谢！
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26楼2015-04-25 21:52:53
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by fegnzaixie at 2013-10-12 10:24:39
你好，我用Gaussview看Log文件，但是Gaussview中的Results中除了SUmmary,surface是高亮显示的，其它的选项都不可查看。怎么办。我的高斯是window版本的...

在基态优化构型基础上用TD计算频率，就可以看vibration和UV了
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4楼2013-10-12 10:42:26
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fegnzaixie

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-12 10:42:26
在基态优化构型基础上用TD计算频率，就可以看vibration和UV了...

我一开始用以下命令算吸收光谱：#p td=(singlets,nstates=20,root=1) b3lyp/6-31g(d)；
你现在的意思是在基态构型上用#p b3lyp/6-31g(d) freq 计算下，就可以用GV查看光谱了？请指教
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5楼2013-10-12 10:46:18
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ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-12 10:42:26
在基态优化构型基础上用TD计算频率，就可以看vibration和UV了...

TD算出来的频率其实和不加TD的应该一样。都是基态的优化几何对应的频率。除了T1态以外，其它激发态应该不能算频率。
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6楼2013-10-12 10:51:59
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ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by fegnzaixie at 2013-10-12 10:46:18
我一开始用以下命令算吸收光谱：#p td=(singlets,nstates=20,root=1) b3lyp/6-31g(d)；
你现在的意思是在基态构型上用#p b3lyp/6-31g(d) freq 计算下，就可以用GV查看光谱了？请指教...

不加TD当然不能算吸收光谱。
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7楼2013-10-12 10:52:31
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fegnzaixie

木虫 (著名写手)
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8楼2013-10-12 10:54:10
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ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by fegnzaixie at 2013-10-12 10:46:18
我一开始用以下命令算吸收光谱：#p td=(singlets,nstates=20,root=1) b3lyp/6-31g(d)；
你现在的意思是在基态构型上用#p b3lyp/6-31g(d) freq 计算下，就可以用GV查看光谱了？请指教...

你原先的命令是没错的。频率没必要和光谱一起算，freq可以和opt放在一个任务里，也可以单独算，但必须基于优化好的结构。
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9楼2013-10-12 11:03:03
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ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by fegnzaixie at 2013-10-12 10:24:39
你好，我用Gaussview看Log文件，但是Gaussview中的Results中除了SUmmary,surface是高亮显示的，其它的选项都不可查看。怎么办。我的高斯是window版本的...

我一般用Linux版本的Gaussian，
请问你的Gaussian与GV的版本。
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10楼2013-10-12 11:04:05
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