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fimer木虫 (小有名气)
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[交流]
怎么从粉末谱解析结构呀?谢谢
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| 有专门的软件作晶体修饰,解粉末谱么? |
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yalefield
金虫 (文坛精英)
老汉一枚
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3楼2007-12-01 15:58:01
fimer
木虫 (小有名气)
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4楼2007-12-01 16:02:45
patriot_csu
至尊木虫 (正式写手)
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lingzi326(金币+3,VIP+0):Thank you very much.^_^
lingzi326(金币+3,VIP+0):Thank you very much.^_^
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粉末图谱和单晶衍射图谱相比，主要是存在于三维空间的d-向量值重叠成一维的d-绝对数值了，所以，很多结构信息丢失了。例如，把同直径的三维的圆球、圆柱和圆锥，从顶上投影到二维之后都变成了同直径的圆，再将3个二维的圆投影到一维变成等长度的直径线段。如果要你从这3个等长度的线段来反推哪个是球哪个是柱哪个是锥，难度可想而知。现在有很多结构都是用粉末图谱解出来的，但总的来说，只要不是很简单的结构，其求解的过程都比较复杂、比较费时的。所以如果能长出单晶来的材料，尽量优先考虑先长出单晶再说。 用粉末解结构主要是有3类方法： 1类叫正空间法，大致是利用什么蒙特卡罗、能量最小方法（模拟退火、最大熵、基因法等）得到初始模型（可以始随机的，也可以是自己利用已知化学信息构造的），再将模型模拟成粉末图谱，再和实验图谱比较，查看匹配度，再反复循环的利用上述方法，直到2个图谱的匹配度最大为止。运用上述方法解结构的软件主要有：MICE,EXPO, DASH等； 如果已知一些部分结构的话，用正空间法比较容易出结果。 1类叫倒空间法，主要是想办法将粉末图谱中重叠峰的衍射强度分成单个衍射峰的强度，Lebail法和pawley法是最常用也最简单的最小二乘方法，就是直接把重叠峰的强度平均等分，再多次循环，直到计算图谱和实验图谱的差别最小为止，然后再使用和解单晶一样的方法如直接法、patternson法等来解。这类方法成功的关键在分峰上。有一种相对来说比lebail和pawley更好的分峰算法叫FIPS的（fast iterative patterson squaring），功能很强大。 还有1类，其实就是前2者的杂交，即调用所有已知正空间和倒空间的信息来对解结构过程进行不同程度的限制，再利用数学上的手段找到答案。 很多很好的免费软件都可以在CCP14的网站上找到： http://www.ccp14.ac.uk/ |
5楼2007-12-01 16:50:02
xiexie99
至尊木虫 (著名写手)
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6楼2007-12-01 18:09:52
