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lanmao20

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[交流] grow命令使用的疑惑

我有一个文件，在我解析的时候发现有应该是溶剂分子的四个q峰，在我对它进行命名之后，grow了一下（因为结构里有特殊位置，看了看分子的整体形状），发现似乎是形成了六元环，实验中的环溶剂只可能有甲苯，但是长出来的东西很奇怪，不是甲苯的样子，怎么说呢，感觉就是半个甲苯分子，但是甲基还不在特殊位置，另外，这几个长出来后貌似是苯的都不在特殊位置，但是删除它们q值很高，很疑惑，不明白为什么grow后会有这样的情况，应该怎么解决呢？这里真的有苯环存在么？谢谢。。。。根据实验，溶剂分子还可能有甲醇和乙醇，但是如果删除一个，命成乙醇后，电子密度很大，而且也不大对。。希望大家指教。。再次感谢。。。

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1楼 2007-11-29 17:15:04

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jackdeng

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对于你说的这种问题，我以前也遇到过，后来请高手解析该结构，发现几个大的Q峰被修成水分子的无序，即3个Q峰对应一个水分子的3个无序部分。根据你说叙述的，个人认为，这四个Q峰不象是甲苯分子，你可以试着按水分子无序修一下，用PART...1 PART...2 ... PART...0和EADP命令精修，如果无序的严重的话，水分子中氧原子的位移参数可能达到0.4左右。