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grape_0805

木虫 (初入文坛)


[求助] 高斯中怎么计算inverted compliance constant(ICC)

在一篇文献中看到有人用gaussian03计算了inverted compliance constant,单位是N cm-1.有哪位知道具体的算法,请指教!谢谢!
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★ ★ ★ ★
gkf高: 金币+5 2013-09-29 23:21:23
从fchk文件读直角坐标力常数矩阵
从gaussian输出文件读取内坐标的b矩阵,或者根据几何结构自己写程序产生b矩阵
利用b矩阵把力常数矩阵从直角坐标转成内坐标
求内坐标力常数矩阵的逆矩阵
逆矩阵的对角元就是compliance constant
compliance constant求倒数,就是inverted compliance constant,物理意义为内坐标的力常数

利用上面的计算过程,inverted compliance constant已经在下面的程序中实现
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4417697
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2013-09-29 22:26:37
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agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿

★ ★
gmy1990: 金币+2 2013-10-04 05:00:31
引用回帖:
2楼: Originally posted by beefly at 2013-09-29 09:26:37
从fchk文件读直角坐标力常数矩阵
从gaussian输出文件读取内坐标的b矩阵,或者根据几何结构自己写程序产生b矩阵
利用b矩阵把力常数矩阵从直角坐标转成内坐标
求内坐标力常数矩阵的逆矩阵
逆矩阵的对角元就是comp ...

以前没听说过这个名词,我通过看你的解释,觉得这个compliance const就是把hessian投影到内坐标空间之后对角化求得的本征值,然后再对其求逆就得到inverted compliance constant?
理论与计算化学,化学物理,生物物理
3楼2013-10-01 04:47:48
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

引用回帖:
3楼: Originally posted by agent99 at 2013-10-01 04:47:48
以前没听说过这个名词,我通过看你的解释,觉得这个compliance const就是把hessian投影到内坐标空间之后对角化求得的本征值,然后再对其求逆就得到inverted compliance constant?...

计算内坐标空间的hessian,但是不需要对角化(或者说,对角化只用于计算逆矩阵)
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2013-10-01 10:02:46
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agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿

引用回帖:
4楼: Originally posted by beefly at 2013-09-30 21:02:46
计算内坐标空间的hessian,但是不需要对角化(或者说,对角化只用于计算逆矩阵)...

求解为何不需要对角化?或者你的hessian在投影到内坐标空间之前已经是对角化的?
理论与计算化学,化学物理,生物物理
5楼2013-10-04 02:29:28
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

引用回帖:
5楼: Originally posted by agent99 at 2013-10-04 02:29:28
求解为何不需要对角化?或者你的hessian在投影到内坐标空间之前已经是对角化的?...

内坐标下的hessian求逆(求逆可以通过对角化获得)以后,对角项就是compliance constant
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
6楼2013-10-04 09:22:39
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