应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 无机非金属 » 制备成型 » 【表面模拟】关于castep计算的几个问题
61/1返回列表
查看: 587  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【奖励】 本帖被评价4次，作者csfn增加金币 3.5 个
当前主题已经存档。

csfn

荣誉版主 (知名作家)

[资源] 【表面模拟】关于castep计算的几个问题

CODE:
3个问题：
1 计算表面过程中，计算成功，但是castep结果中提示
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
SCF loop      Energy           Fermi           Energy gain       Timer   <-- SCF
                               energy          per atom          (sec)   <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
Initial  -1.24983546E+004  5.76278315E+001                        55.44  <-- SCF
      1  -1.59703259E+004 -1.69750335E+000   2.89330938E+002     197.97  <-- SCF
Warning: There are no empty bands for at least one kpoint and spin; this may slow the convergence and/or lead to an inaccurate groundstate. If this warning persists, you should consider increasing nextra_bands and/or reducing smearing_width in the param file. Recommend using nextra_bands of 11 to 24.                             
        2  -1.62762609E+004 -6.23532889E+000   2.54945870E+001     356.62  <-- SCF
Warning: There are no empty bands for at least one kpoint and spin; this may slow the convergence and/or lead to an inaccurate groundstate. If this warning persists, you should consider increasing nextra_bands and/or reducing smearing_width in the param file.Recommend using nextra_bands of 11 to 24.   
2  要在表面上吸附小分子，如H2 ，或者CO，可以选择不同的位置，比如top, bridge, 等，但是如何确定具体每个原子的position? 直接根据原子半径按照几何知识来计算吗？另外在计算表面吸附total energy的时候，是否选择上"optimized cell" ?
如果不选择，就应该是每个原子的位置保持固定，那么如何知道所确定的吸附原子的位置是对的呢？
3 进行计算时选择上"spin polarized", 对于不同元素，其参数如何设置？"initial pin"和"charge"。

CODE:
第一个问题：
大家回答的差不多。你的结果肯定是有问题的，必须要调试到没这个警告出现。增加bands的做法不是很可靠，最好是调整smearing，怎么调?最好的方法是测试，就是大小都调。不过你这里提示是要你减小这个数值，可以一试。
第二个问题：
1，每个位置都要算，通过能量高低判断最佳吸附位置。对于分子可能有多种组合的位置，都要计算，不过最好参考下文献，一般是在高对称点咯！推荐下，计算的时候固定xy坐标，保持高度变化就ok！
2，根绝原子半径判断，呵呵，在表面就不要考虑，如果你考虑他可能吸附到体内去，比如那里是fcc位置，有一个洞，那是可以考虑原子半径。因为半径大了，那个洞容不下他肯定不会进去咯。不过你把他放到洞里算下就知道哒。一般是用吸附能判断，吸附能为正就是可以吸附，为负不吸附。不过吸附能定义的计算方法要搞正确就是。吸附能定义为吸附前后物质总能量的变化，是结合能的反数，也就是吸附体系的能量减去清洁表面的能量，再减去被吸附物质的能量。
3，是否选择“optimized cell”
一般的体系都可以不选择，选择上了计算量增大太多。如果不选择，也不是位置固定。只是那个合子，或者说整体的体积和外形不变化而已。我是这样的理解的！
4,怎么模拟表面
一般来说计算表面吸附是不会固定下面的基地的，固定了可信度小，发出去自己也没底气。^_^一般采用的2种办法，一种是楼上说的，固定的最下面层，然后上面和吸附原子接触的就relax，这个是相当于只考虑一个表面。固定的层数对半开。第二种方法是不固定层数，选择很大的层数，或者选择小一点的层数，固定中间层数，两面的原子层数不固定，这个就是有两个表面的情况。还有少数是全部固定原子层数。对于楼主来说，castep要固定的话，肯定在你计算的时候你选择的任务是只算能量，我估计你应该是选择了结构优化，所以我想你是没固定原子位置的。
第三个问题：
选择自旋极化，推荐采用默认设置。正常情况下，都会收敛到比较合理的值。除非自己了解很透彻，再自定义。

[ Last edited by csfn on 2007-12-2 at 17:51 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2007-11-29 09:08:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

csfn

荣誉版主 (知名作家)



最后欢迎大家多多光临物理版，系列有奖活动等待大家
做计算的虫子将会在那里等待大家一起交流探讨




[ Last edited by csfn on 2007-11-29 at 09:12 ]
赞一下 回复此楼
2楼2007-11-29 09:10:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dali2006

木虫 (著名写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

很好的资料！
回复此楼
3楼2007-11-29 09:28:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kissgoodbye

金虫 (著名写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

初学，感觉受益匪浅
赞一下 回复此楼
4楼2007-12-23 04:32:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 csfn 的主题更新
61/1返回列表
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 347求调剂 +4 mhyqyy 2026-04-06 4/200 2026-04-12 02:27 by 秋豆菜芽
[考研] 291求调剂 +10 关忆北. 2026-04-09 11/550 2026-04-12 00:45 by xuxiang
[考研] 药学305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-10 8/400 2026-04-12 00:07 by zhouwenxian
[考研] 291求调剂 +7 关忆北. 2026-04-11 7/350 2026-04-11 23:48 by baobaoye
[考研] 274求调剂求调剂 +11 Jachenbingoo 2026-04-06 14/700 2026-04-11 11:37 by 紫曦紫棋
[考研] 298求调剂 +5 残荷新柳 2026-04-07 5/250 2026-04-11 11:02 by 紫曦紫棋
[考研] 086000调剂 +5 十七sa 2026-04-07 5/250 2026-04-11 10:38 by 紫曦紫棋
[考研] 生物学调剂 +8 小冉要努力 2026-04-10 9/450 2026-04-11 10:22 by wwj2530616
[考研] 农业管理302分求调剂 +3 xuening1 2026-04-10 3/150 2026-04-11 10:18 by zhq0425
[考研] 337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 08:57 by zhq0425
[考研] 309求调剂 +14 wdhw 2026-04-10 15/750 2026-04-10 21:06 by zhouxiaoyu
[考研] 287求调剂 +15 Fnhc 2026-04-07 21/1050 2026-04-10 19:09 by chemisry
[考研] 求机械专硕297第二批调剂 +5 拾柒12。 2026-04-08 5/250 2026-04-09 16:43 by 允当适度
[考研] 生物学308分求调剂（一志愿华东师大） +13 相信必会光芒万� 2026-04-06 16/800 2026-04-09 13:54 by 徐良白眉大侠
[考研] 086000生物与医药调剂 +7 awwwwwooooo 2026-04-09 7/350 2026-04-09 13:31 by 北极159263
[考研] 求调剂 +3 猪肉墩粉条cc 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:05 by 猪肉墩粉条cc
[考研] 331求调剂 +5 luoxin0706. 2026-04-08 5/250 2026-04-08 22:15 by zhouyuwinner
[考研] 一志愿211，化学学硕，310分，本科重点双非，求调剂 +10 努力奋斗112 2026-04-07 10/500 2026-04-08 15:01 by screening
[考研] 一志愿苏州大学材料工程（085601）专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +11 大火山小火山 2026-04-05 11/550 2026-04-06 22:55 by yunlongyang
[考研] 调剂 +3 李广火 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:57 by 蓝云思雨
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭