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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » zinc数据库怎么用？
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harriet7929

金虫 (小有名气)

[交流] zinc数据库怎么用？

进入zinc数据库后点击download，然后点击window download 中的mol2，出现对话框。点击保存，下载下来的是bat文件，若点击运行，闪了一下黑框就没有反应了。我是新手，不会用zinc下载，哪位大侠可以帮帮忙啊！！
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1楼 2013-09-23 17:28:52
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iovvoi

金虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-17 18:46:49
http://zinc.docking.org/browse/subsets/

到这里下载
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2楼2013-09-23 21:43:42
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shadow004

禁虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-17 18:46:57
本帖内容被屏蔽
3楼2013-09-24 11:28:57
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harriet7929

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by iovvoi at 2013-09-23 21:43:42
http://zinc.docking.org/browse/subsets/

到这里下载

我进入这个界面了，但保存下来的是bat后缀的文件
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4楼2013-09-24 11:46:00
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harriet7929

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by shadow004 at 2013-09-24 11:28:57
zinc的数据库是要放到能调用软件下面才能用的，我记得有一种格式下载后用ds可以直接打开

能再详细一些吗？什么软件可以调用？我用的是sybyl x.2
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5楼2013-09-24 11:46:59
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shadow004

禁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
6楼2013-09-24 12:57:57
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wwwqiujun

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你的 zinc知道怎么下拉么！我也没下下来 ，寻求帮助额！
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7楼2014-03-17 12:32:18
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xiaoxuancao

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主，你这个问题解决了没？我也想下载zinc数据库，但不知道怎么下的，求指导
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8楼2014-06-10 11:05:46
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zxc1984

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
点鼠标左键——另存为试试，我每次都是这样下载的
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9楼2014-07-07 18:05:10
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windf1ower

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
右键bat文件，以管理员身份运行试试
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10楼2014-07-19 20:08:43
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
可以用写字板类似的软件打开，里边有下载网址，拷贝出来直接去下载就好了
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11楼2014-08-27 10:59:48
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呆子想

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问，我也遇到同样的问题，楼主解决了吗
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12楼2015-05-16 12:15:52
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呆子想

银虫 (初入文坛)
内容已删除
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13楼2015-05-16 12:16:50
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stoneprince1979

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
用的是https://zinc.docking.org/substance这个网址吗，在搜索处直接输入要下载的名称等均可，点击go搜索，点击download下载mol2格式的，保存，即可。
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14楼2015-05-17 22:25:45
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
用文本打开里边会有下载地址，用那个再下载一下就可以了，下载之后是sdf格式的
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15楼2015-05-19 15:39:30
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yzl_cumt

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
以std-all为例，用记事本或emedit打开（win-mol2，右键另存为usual.mol2.bat），文件如：
# usual.mol2.bat from http://zinc.docking.org
set base=http://zinc.docking.org/db/bysubset/6
wget %base%/6_p0.0.mol2.gz
wget %base%/6_p0.1.mol2.gz
wget %base%/6_p0.10.mol2.gz
wget %base%/6_p0.100.mol2.gz
wget %base%/6_p0.101.mol2.gz
...
把wget %base%替换为http://zinc.docking.org/db/bysubset/6后，复制，扔迅雷里就行了
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16楼2015-06-25 12:22:51
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白鸽8633

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个问题解决了么？zinc数据库的批量下载，我也是，都是bat文件，请教。
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17楼2015-10-27 16:25:53
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白鸽8633

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by xiaoxuancao at 2014-06-10 11:05:46
请问楼主，你这个问题解决了没？我也想下载zinc数据库，但不知道怎么下的，求指导

这个问题怎么解决，我也想知道，一个文件可以下，我想知道批量下载如何操作？我也是下载之后，总有bat文件，不知道如何弄了
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18楼2015-10-27 16:26:39
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白鸽8633

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by zxc1984 at 2014-07-07 18:05:10
点鼠标左键——另存为试试，我每次都是这样下载的

批量下载如何操作，点击下载总是bat文件
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19楼2015-10-27 16:26:55
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白鸽8633

铁杆木虫 (著名写手)
急切盼回复
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20楼2015-10-28 11:55:58
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worgjin

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
16楼: Originally posted by yzl_cumt at 2015-06-25 12:22:51
以std-all为例，用记事本或emedit打开（win-mol2，右键另存为usual.mol2.bat），文件如：
# usual.mol2.bat from http://zinc.docking.org
set base=http://zinc.docking.org/db/bysubset/6
wget %base%/6_p0.0. ...

迅雷本身也提供批量下载功能，使用（*）代替12345这个编号即可，然后定义下*号范围
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21楼2016-02-16 16:26:01
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