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ZhaoSnowice

新虫 (初入文坛)

[求助] 安装WIEN2k时,lapw0编译出现错误

错误如下:
…………
…………
ifort -o lapw0 cputim.o modules.o reallocate.o ainv.o am05_xscss.o b88.o blyp.o brj.o charg2.o  charg3.o charge.o chfac.o chslv.o corgga.o corpbe_revtpss.o corpbe_tpss.o cub_xc_back.o corlsd.o dfxhpbe.o dfxrevtpss.o dfxtpss.o drho.o dylm.o efg.o energy.o epot1.o eramps.o errclr.o errflg.o ev92.o ev92ex.o exch.o exch17.o fftw_para.o fithi.o fxhpbe.o fx_revtpss.o fx_tpss.o gbass.o gcor.o gea.o geaex.o  getff1.o getfft.o gpoint.o gpointm.o grans.o gtfnam.o hcth.o htbs.o ifflim.o kcis.o lapw0.o latgen.o multfc.o multsu.o outerr.o pbea.o pbem.o pbe1.o pbe2.o pbesol.o poissn.o potfac.o pwxad4.o pwxad5.o qranf.o readstruct.o rean0.o rean1.o rean3.o rean4.o rhopw.o rotate.o rotdef.o rpbe.o setff0.o setff1.o setfft.o setff2.o seval.o sevald.o sevaldd.o sevali.o sevalin.o sicpbe.o sicpbe_revtpss.o sicpbe_tpss.o sogga.o sphbes.o spline.o srolyl.o stern.o sumfac.o suml.o SymmRot.o th1.o th2.o vpw91.o vresp.o vs98.o vxc15.o vxc16.o vxc17.o vxc24.o vxc26.o vxclm2.o vxcpw2.o vxi35.o vxi35a.o wc05.o workf1.o xcener.o xcpot.o xcpot1.o xcpot3.o ykav.o  ylm.o zfft3d.o  W2kutils.o W2kinit.o fftw_seq.o -FR -mp1 -w -prec_div -pc80 -pad -ip -DINTEL_VML -O3 -xW -L/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64 -pthread /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64/libmkl_lapack95_lp64.a -Wl,--start-group /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64/libmkl_intel_lp64.a /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64/libmkl_intel_thread.a /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64/libmkl_core.a -Wl,--end-group -liomp5 -lpthread -lm
make[1]: Leaving directory `/opt/WIEN2k/SRC_lapw0'
make: *** 没有规则可以创建目标“complex”。 停止。
if [ -f .sequential ]; then \
           rm -f .sequential modules.o reallocate.o energy.o fftw_para.o getff1.o getfft.o gtfnam.o lapw0.o rean0.o rean3.o rean4.o setff1.o setff2.o setfft.o xcpot1.o xcpot3.o zfft3d.o W2kinit.o *.mod; \
        fi
touch .parallel
…………
…………
mpif90 -o lapw0_mpi cputim.o modules.o reallocate.o ainv.o am05_xscss.o b88.o blyp.o brj.o charg2.o  charg3.o charge.o chfac.o chslv.o corgga.o corpbe_revtpss.o corpbe_tpss.o cub_xc_back.o corlsd.o dfxhpbe.o dfxrevtpss.o dfxtpss.o drho.o dylm.o efg.o energy.o epot1.o eramps.o errclr.o errflg.o ev92.o ev92ex.o exch.o exch17.o fftw_para.o fithi.o fxhpbe.o fx_revtpss.o fx_tpss.o gbass.o gcor.o gea.o geaex.o  getff1.o getfft.o gpoint.o gpointm.o grans.o gtfnam.o hcth.o htbs.o ifflim.o kcis.o lapw0.o latgen.o multfc.o multsu.o outerr.o pbea.o pbem.o pbe1.o pbe2.o pbesol.o poissn.o potfac.o pwxad4.o pwxad5.o qranf.o readstruct.o rean0.o rean1.o rean3.o rean4.o rhopw.o rotate.o rotdef.o rpbe.o setff0.o setff1.o setfft.o setff2.o seval.o sevald.o sevaldd.o sevali.o sevalin.o sicpbe.o sicpbe_revtpss.o sicpbe_tpss.o sogga.o sphbes.o spline.o srolyl.o stern.o sumfac.o suml.o SymmRot.o th1.o th2.o vpw91.o vresp.o vs98.o vxc15.o vxc16.o vxc17.o vxc24.o vxc26.o vxclm2.o vxcpw2.o vxi35.o vxi35a.o wc05.o workf1.o xcener.o xcpot.o xcpot1.o xcpot3.o ykav.o  ylm.o zfft3d.o  W2kutils.o W2kinit.o fftw_seq.o -FR -mp1 -w -prec_div -pc80 -pad -ip -DINTEL_VML -O3 -xW -L/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64 -pthread  /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64/libmkl_scalapack_lp64.a -Wl,--start-group /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64/libmkl_intel_lp64.a /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64/libmkl_intel_thread.a /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64/libmkl_core.a /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/mkl/lib/intel64/libmkl_blacs_openmpi_lp64.a -Wl,--end-group -liomp5 -lpthread -lm -I/opt/openmpi/include -L/opt/mathlibs/fftw3/lib -lfftw3_mpi -lfftw3
fftw_para.o: In function `exec_fftw_para_':
fftw_para.F.text+0x77): undefined reference to `fftwnd_f77_mpi_'
fftw_para.F.text+0xb2): undefined reference to `fftwnd_f77_mpi_'
fftw_para.o: In function `init_fftw_para_':
fftw_para.F.text+0xf7): undefined reference to `fftw3d_f77_mpi_create_plan_'
fftw_para.F.text+0x121): undefined reference to `fftw3d_f77_mpi_create_plan_'
fftw_para.F.text+0x14a): undefined reference to `fftwnd_f77_mpi_local_sizes_'
make[1]: *** [lapw0_mpi] 错误 1
make[1]: Leaving directory `/opt/WIEN2k/SRC_lapw0'
make: *** [para] 错误 2

参考了http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1221069
之前也有人有这个错误http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3294497
但是我用fftw-2.1.5和fftw-3.3.3都试过,都有这个错误
求救
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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ZhaoSnowice: 金币+5, 有帮助 2013-09-24 12:54:56
这个是fftw的mpi编译问题。如果不需要的话建议配置时,WIEN2k不使用mpi并行编译,lapw0的mpi并行对总性能提升很小,可以避免这一错误
2楼2013-09-15 20:13:52
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ZhaoSnowice

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by KalaShayminS at 2013-09-15 20:13:52
这个是fftw的mpi编译问题。如果不需要的话建议配置时,WIEN2k不使用mpi并行编译,lapw0的mpi并行对总性能提升很小,可以避免这一错误

那我不管它,就进行串行计算可以不?

现在串行计算出现这个又是什么原因?

LAPW0 END
*** glibc detected *** /opt/WIEN2k/lapw1: malloc(): memory corruption: 0x000000001c5b4db0 ***
======= Backtrace: =========
/lib64/libc.so.6[0x3f79a6e9ae]
/lib64/libc.so.6[0x3f79a70c16]
/lib64/libc.so.6(__libc_malloc+0x7a)[0x3f79a7225a]
/lib64/libc.so.6(catopen+0x3c)[0x3f79a2f4bc]
/opt/WIEN2k/lapw1[0xf85203]
/opt/WIEN2k/lapw1[0xf89938]
/lib64/libpthread.so.0[0x3f7aa0e5d0]
/opt/WIEN2k/lapw1[0x76b0e0]
======= Memory map: ========
00400000-011ba000 r-xp 00000000 08:02 6861153                            /opt/WIEN2k/lapw1
013b9000-013d8000 rwxp 00db9000 08:02 6861153                            /opt/WIEN2k/lapw1
013d8000-01617000 rwxp 013d8000 00:00 0
1c04f000-1c707000 rwxp 1c04f000 00:00 0                                  [heap]
329a200000-329a280000 r-xp 00000000 08:02 1339598                        /lib64/libm-2.7.so
329a280000-329a47f000 ---p 00080000 08:02 1339598                        /lib64/libm-2.7.so
329a47f000-329a480000 r-xp 0007f000 08:02 1339598                        /lib64/libm-2.7.so
329a480000-329a481000 rwxp 00080000 08:02 1339598                        /lib64/libm-2.7.so
32a7400000-32a740d000 r-xp 00000000 08:02 1339618                        /lib64/libgcc_s-4.1.2-20080825.so.1
32a740d000-32a760d000 ---p 0000d000 08:02 1339618                        /lib64/libgcc_s-4.1.2-20080825.so.1
32a760d000-32a760e000 rwxp 0000d000 08:02 1339618                        /lib64/libgcc_s-4.1.2-20080825.so.1
3f79600000-3f7961b000 r-xp 00000000 08:02 1339594                        /lib64/ld-2.7.so
3f7981a000-3f7981b000 r-xp 0001a000 08:02 1339594                        /lib64/ld-2.7.so
3f7981b000-3f7981c000 rwxp 0001b000 08:02 1339594                        /lib64/ld-2.7.so
3f79a00000-3f79b42000 r-xp 00000000 08:02 1339595                        /lib64/libc-2.7.so
3f79b42000-3f79d41000 ---p 00142000 08:02 1339595                        /lib64/libc-2.7.so
3f79d41000-3f79d45000 r-xp 00141000 08:02 1339595                        /lib64/libc-2.7.so
3f79d45000-3f79d46000 rwxp 00145000 08:02 1339595                        /lib64/libc-2.7.so
3f79d46000-3f79d4b000 rwxp 3f79d46000 00:00 0
3f79e00000-3f79e02000 r-xp 00000000 08:02 1339597                        /lib64/libdl-2.7.so
3f79e02000-3f7a002000 ---p 00002000 08:02 1339597                        /lib64/libdl-2.7.so
3f7a002000-3f7a003000 r-xp 00002000 08:02 1339597                        /lib64/libdl-2.7.so
3f7a003000-3f7a004000 rwxp 00003000 08:02 1339597                        /lib64/libdl-2.7.so
3f7aa00000-3f7aa16000 r-xp 00000000 08:02 1339596                        /lib64/libpthread-2.7.so
3f7aa16000-3f7ac15000 ---p 00016000 08:02 1339596                        /lib64/libpthread-2.7.so
3f7ac15000-3f7ac16000 r-xp 00015000 08:02 1339596                        /lib64/libpthread-2.7.so
3f7ac16000-3f7ac17000 rwxp 00016000 08:02 1339596                        /lib64/libpthread-2.7.so
3f7ac17000-3f7ac1b000 rwxp 3f7ac17000 00:00 0
2b588cc41000-2b588cc43000 rwxp 2b588cc41000 00:00 0
2b588cc43000-2b588cd14000 r-xp 00000000 08:02 9801680                    /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/compiler/lib/intel64/libiomp5.so
2b588cd14000-2b588cf14000 ---p 000d1000 08:02 9801680                    /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/compiler/lib/intel64/libiomp5.so
2b588cf14000-2b588cf1d000 rwxp 000d1000 08:02 9801680                    /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.9.293/compiler/lib/intel64/libiomp5.so
2b588cf1d000-2b588cf35000 rwxp 2b588cf1d000 00:00 0
2b588cf4b000-2b588ef18000 rwxp 2b588cf4b000 00:00 0
2b589054e000-2b589076e000 rwxp 2b589054e000 00:00 0
2b5894000000-2b5894021000 rwxp 2b5894000000 00:00 0
2b5894021000-2b5898000000 ---p 2b5894021000 00:00 0
7fff9854f000-7fff98564000 rwxp 7ffffffe9000 00:00 0                      [stack]
ffffffffff600000-ffffffffffe00000 ---p 00000000 00:00 0                  [vdso]

>   stop error
3楼2013-09-15 20:41:37
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