24小时热门版块排行榜    

查看: 2778  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

03010328

银虫 (正式写手)

[求助] 关于DNA连接的纳米粒子自组装的分子动力学模拟,求交流和分享 已有1人参与

本人所选课题暂定“模拟基于DNA连接的纳米粒子的自组装”,由于各种困难,包括构建合适的DNA粗粒化模型,这个研究方向在学术界一直都进展缓慢,主要是以实验为主,并且绝大数工作都依赖于美国西北大学著名的C. A. Mirkin教授的研究团队,一直到2011年,美国爱荷华州立大学的A. Travesset教授和C. Knorowski教授与路易斯安那州立大学的S. Burleigh合作才正式开启了此研究方向的里程碑,他们的研究成果发表在PRL期刊上:"Dynamics and Statics of DNA-Programmable Nanoparticle Self-Assembly and Crystallization", C. Knorowski, S. Burleigh and A. Travesset, Phys. Rev. Lett. 106, 215501 (2011)
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

self assembly 和毕设有关的

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

梦のしずく
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

03010328

银虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by huterx at 2013-11-22 20:20:07
这个要是自己编写的话难度很大啊。。。...

正在写程序,遇到一些非常棘手的问题。
梦のしずく
9楼2013-11-23 16:53:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

03010328

银虫 (正式写手)

因为我所看的两个课题组的研究成果都是利用分子动力学模拟的,而我上学期所了解的也是分子动力学,所以我期望得到热心人更多的帮助。
梦のしずく
2楼2013-09-06 17:38:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

03010328

银虫 (正式写手)

A. Travesset教授的研究团队主要对基于DNA直接连接的两种不同类型的纳米粒子自组装进行了模拟,并且只是单一的从较小的模拟体系(N=54)以及唯一的晶格(CsCl)出发,从均方位移、配分函数、静态结构因子等一系列进行了分析,获得了跟实验近似的结果。2012年,在A. Travesset教授和C. A. Mirkin教授的帮助下,西北大学Monica Olvera de la Cruz教授的研究团队对Travesset团队的DNA粗粒化模型进行了升级,模型变得更为复杂,但是精准度也相应提升,模拟体系不仅扩大到了256,同时晶格也扩大到Bcc、CsCl、AlB2、Cr3Si和Cs6C60,更为重要的是他们提出了三个关键的控制参数,并且绘制了相对较为准确的相图,研究成果发表在Nano Lett期刊上:Li, T. I. N. G.; Sknepnek, R.; Macfarlane, R. J.; Mirkin, C. A.;
Olvera de la Cruz, M. Nano Lett. 2012 , 12 , 2509 −2514
;随后不久,就在同一年,Travesset教授所带领的研究团队又对晶格的形成过程进行了精准分析,研究成果发表在Soft Matter期刊上:Knorowski, C.; Travesset, A. Soft Matter2012 , 8, 12053 −12059;2013年,Monica Olvera de la Cruz教授的研究团队将最新的研究成果发表在美国化学会志JACS期刊上:Ting I. N. Li, Rastko Sknepnek, Monica Olvera de la Cruz, JACS 135, 23 (2013)
梦のしずく
3楼2013-09-06 17:58:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

03010328

银虫 (正式写手)

通过仔细阅读这两个课题组的文献,发现还有一些地方他们没有涉及,现在我要开始自己的工作了,但是最让我头疼的是现在分子动力学程序的编写,因为网上找不到开源代码,这个问题一直纠结了我一个暑假,很是痛苦,希望有志同道合的人相互交流,最好有资源共享。
梦のしずく
4楼2013-09-06 18:01:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] FileCode能看出啥? +8 要乐观耀哥 2026-08-10 23/1150 2026-08-13 00:35 by 要乐观耀哥
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +8 majunge000 2026-08-10 9/450 2026-08-12 22:17 by 虫友是什么虫
[基金申请] 不应该看fileCode +5 且听虎啸 2026-08-12 6/300 2026-08-12 16:26 by Tide man
[基金申请] filecode +13 documentary 2026-08-10 15/750 2026-08-12 15:56 by 云上清扬
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
信息提示
请填处理意见