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liuqingrui5

金虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质鉴定

纯化的蛋白质经二级质谱鉴定后搜库得到匹配蛋白,那么这两个蛋白就是同一个蛋白吗,性质就完全一样吗?其氨基酸序列就100%相同吗?
另外,怎么知道纯化出来的蛋白的氨基酸序列?要全部测序吗?价格贵吗?分子量大概为55kDa
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wsh01300

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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kx444555: 金币+5, 鼓励交流 2013-09-04 16:35:50
不是同一个蛋白,只能说是同一类蛋白,这两个蛋白在氨基酸组成上很相似,因此这两个蛋白的有些性质可能相同,要知道纯化出来的蛋白的氨基酸序列,全部测序是不可能的,你可以对这个蛋白进行N端和C端测序,各测十几个氨基酸,然后跟据所测的氨基酸序列反推基因编码序列,与已有的全基基组测序结果或基因组文库的测序结果进行比对分析来推测编码该蛋白的基因,再跟据推测的全长基因推导出蛋白质的氨基酸序列。以上还只是推测的,如果要进一步确认的话,可以跟据推测的基因序列,设计PCR引物,然后扩增基因,进行基因克隆和表达,对表达的蛋白进行分析来进一步确认该基因确实是编码该蛋白的基因,从而使推导的氨基酸序列更具备说服力。

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2楼2013-09-04 15:47:52
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liuqingrui5

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by wsh01300 at 2013-09-04 15:47:52
不是同一个蛋白,只能说是同一类蛋白,这两个蛋白在氨基酸组成上很相似,因此这两个蛋白的有些性质可能相同,要知道纯化出来的蛋白的氨基酸序列,全部测序是不可能的,你可以对这个蛋白进行N端和C端测序,各测十几个 ...

那我能不能根据数据库里所匹配上的蛋白的基因序列设计引物,提取DNA,PCR,基因测序,进而推导我的蛋白质的氨基酸序列呢?非常感谢
3楼2013-10-18 15:27:36
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DBWJ

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

根据数据库里所匹配上的蛋白的基因序列设计引物,提取DNA,PCR,基因测序做的也是数据库的蛋白呀,没办法推测出你的蛋白的
还是根据2楼的方法弄比较靠谱些
4楼2013-10-18 16:26:39
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