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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 氢键的认识
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lmzxcom1

金虫 (著名写手)

[交流] 氢键的认识

最近在docking，所以氢键是肯定要讨论了。根据文献上，我看到的大部分认为氢键是X-H...Y中的H...Y的部分，不过也有人认为是X....Y的直线距离，个人感觉H...Y这个更合适一些。另外，H...Y之间的距离，在多少能算氢键，能够满足催化过程的需要呢，一般认为3埃？但是实际上4埃距离上也还是存在一个作用力的，只不过比较弱吧
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1楼 2013-09-03 18:24:47
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yaozhq

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个问题通常的算法都是算重原子的距离 再加上角度 至于3还是4 一般没硬性的 2.5-3.5都有用的
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3楼2013-09-05 10:06:44
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wally8962

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
不是xy距离和hxy角度两个么
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2楼2013-09-04 11:58:26
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