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lmzxcom1

金虫 (著名写手)


[交流] 氢键的认识

最近在docking,所以氢键是肯定要讨论了。根据文献上,我看到的大部分认为氢键是X-H...Y中的H...Y的部分,不过也有人认为是X....Y的直线距离,个人感觉H...Y这个更合适一些。另外,H...Y之间的距离,在多少能算氢键,能够满足催化过程的需要呢,一般认为3埃?但是实际上4埃距离上也还是存在一个作用力的,只不过比较弱吧
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wally8962

木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不是xy距离和hxy角度两个么
2楼2013-09-04 11:58:26
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yaozhq

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个问题通常的算法都是算重原子的距离 再加上角度 至于3还是4 一般没硬性的 2.5-3.5都有用的
3楼2013-09-05 10:06:44
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