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wzb129

新虫 (初入文坛)

[交流] 求放线菌基因组DNA的提取方法

是高温放线Thermomonospora curvata,中文名称弯曲热单孢菌,用了网上查到的微波炉法(《微生物学报》),也许是我没有掌握到这种方法的精髓吧,反正是效果不太好,有时提不出,有时提出的极微量,现在实验就卡在这动不了了,崩溃死了。烦劳大家帮帮我吧!不胜感激了!
后来用了分子克隆上的方法:
  (1〕取3ml培养过夜的细菌培养物离心0.5分钟,收集菌体;
〔2〕用无菌水洗涤菌体,12000rpm,离心1分钟;
〔3〕沉淀物加入567 u l TE(pH 8.0)缓冲液,重悬菌体,加入30 u l 溶菌酶(50mg/ml)混匀,于37℃温育1小时;
    〔4〕加入30 u l 10%的SDS和3 u l (20mg/ml)的蛋白酶K,混匀,于55℃温育1小时;
〔5〕加入100 u l 5M Nacl, 充分混匀,再加入80 u l CTAB/Nacl 溶液,混匀,于65℃温育10min;
〔6〕 加入2ul RNA酶,37℃温浴15分钟;
〔7〕加入等体积的酚/氯仿,混匀,抽提;
〔8〕加入等体积的氯仿,抽提一次;
〔9〕 加入1/10体积的3mol/L NaAc 溶液,2倍体积的无水乙醇,混匀,放置-20℃冰箱30分钟;
〔10〕 轻轻混合直到DNA沉淀下来,离心;
〔11〕 用70%乙醇洗涤沉淀1次,晾干;
〔12〕将已干的DNA溶于40 u l 超纯水中,-20℃保存。
结果电泳出来还是没有,重复提了三天了,现在希望得到高手指教....
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edragonfly

新虫 (初入文坛)

★ ★
telomerase(金币+2,VIP+0):谢谢分析!!!
推荐看一本《链霉菌遗传操作手册》

建议修改:
(2)用25mM的EDTA洗  
(3)温育时间延长或增加溶菌酶量(貌似你的菌体不少啊)

如果多糖不是很厉害 第5步可以不要

整体步骤应该是没有问题的。

到(9)应该能看到明显的絮状沉淀 没有的话 基本就没提出来了
生活是一面镜子,所以微笑面对!
2楼2007-11-16 12:22:45
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liudanlucky

银虫 (小有名气)

我提的也是放线菌
     加入溶菌酶温浴直到呈均匀粘稠状。纯度要求不是太高的话可以省去5,6步,4步中加入适量EDTA.第9步中直接用预冷的无水乙醇沉淀也可以。应该没问题,A260/A280可达到1.8-2.0
3楼2007-11-21 21:22:27
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lbhui326

金虫 (小有名气)

你的菌体有问题吧!上面介绍的各个方法都是经典的放线菌基因组提取方法。我一直在用效果很好,还能提到RNA。
4楼2007-11-25 17:24:22
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