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rain309309

金虫 (初入文坛)

[求助] msd计算中的错误

现在模拟碳管中金属元素的生长情况,要计算金属元素的msd,可是一直弄不通,请大家帮助看看不胜感激!输入文件中将原子分成两类:
group       C   type 1
group       Au type 2
在计算Au的msd时,用了compute  mymsd   Au  msd com yes
输出msd用
fix  1   Au  ave/time 1  100  50000   c_mymsd[1] c_mymsd[2] c_mymsd[3] c_mymsd[4] file  msd.tmp  mode  vector
可是报错:ERROR: Fix ave/time compute does not calculate an array;
后来将ave/time那句中的vector换成了scalar,倒是可以运行起来,但是结果感觉完全不对!
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Bessel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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fix  1   Au  ave/time 100 1 100 c_mymsd[1] c_mymsd[2] c_mymsd[3] c_mymsd[4] file  msd.tmp  mode  scalar。

The Nevery, Nrepeat, and Nfreq 三个参数的意思你没搞明白,好好读读说明,再看看Lammps里现成的msd例子。
2楼2013-08-22 15:58:52
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