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shucaiyuanyi

银虫 (小有名气)

[交流] 求助菌落PCR的技术流程

求助菌落PCR的技术流程
查了好多资料,都没有详细的技术流程,希望各位帮下忙啊 ,
在下感激不尽!!

[ Last edited by telomerase on 2007-11-13 at 11:10 ]
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glucidum

金虫 (正式写手)

菌落PCR要注意的是,有些人加好样进行PCR之前喜欢离心甩一下。菌落PCR不能离心的,否则菌体沉到管底就扩增不到了。
7楼2007-11-14 08:55:58
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yangchang1018

★ ★ ★
telomerase(金币+2,VIP+0):谢谢应助!!欢迎多多参与交流!!
asr(金币+1,VIP+0):thanks,辛苦了.
常规的大概流程是:1. 挑菌;2. 摇菌;3. 提取菌液DNA(可采用试剂盒);4. 构建PCR体系并进行PCR;5.电泳检测结果。
具体操作在文章上都可查到,当然必要时可根据你的具体要求对实验操作进行一些更改.

还有一种比较简便的方法就是菌落PCR(Colony PCR),优点是可不必提取基因组DNA,不必酶切鉴定,而是直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,省时少力。建议使用载体上的通用引物。通常利用此方法进行重组体的筛选或者DNA测序分析。最后的PCR产物大小是载体通用引物之间的插入片断大小。
具体方法:
1、PCR混合物的制备
Taq buffer(10×)                  20 ul
dNTP(2.5 mM)                     5 ul
Primer Forward(50 mM)      10 ul
Primer Reverse(50 mM)     10 ul
ddH2O                                    147 ul
Taq(2U/ul)                            8 ul
total                                        200 ul
将上述溶液混匀,10 ul每管分装于200 ul PCR管中。

2、常温下随机挑选转化板上的转化子,用灭菌的牙签或枪头挑取少量菌体,在LB琼脂糖平板上轻点,做一拷贝;然后将沾有菌体的牙签或枪头置于相应的装有PCR混合物的PCR管中洗涤数下(管子做好记号,如平板上点的是1#,则管子上也标1#,以便筛选到克隆后的扩到培养),盖紧管子。

3、将混有菌体的PCR混合物置于PCR仪中,按常规条件扩增。电泳检测是否得到目的片断。如有则为阳性克隆。

4、将已经接种有菌落的平板置37℃培养箱培养过夜,使菌落扩增;次日挑选阳性克隆做进一步筛选或培养。步骤2也可以不点板,直接接种摇菌,如果早上做PCR的话,下午就可以提质粒,得到重组载体。

注意事项:设计引物很关键。一般如果是定向克隆,用载体上的通用引物即可;如pET系列可用T7通用引物。如果是非定向克隆(如单酶切或平末端连接),一条引物用载体,一条引物用目的基因上的,这样就可以比较方便的鉴定了,而且错误概率很低。PCR条件的选择接近最佳,同时挑取的菌体不宜太多,否则会有非特异性扩增。

[ Last edited by yangchang1018 on 2007-11-13 at 11:30 ]
2楼2007-11-13 11:19:33
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telomerase

至尊木虫 (著名写手)

cain


johnsooh(金币+1,VIP+0):thx
pcr鉴定菌吗?
简单的做法,  拿一个平板,背面画出小格子,并标号.
准备pcr反应体系,不加模版。
挑一半菌涂板,另一半PCR。除了阳性结果,再提质粒,酶切鉴定下,然后测序!!
我的路靠我的脚踩出来!!!不走寻常路!!!
3楼2007-11-13 11:29:31
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reasonspare

木虫 (著名写手)


johnsooh(金币+1,VIP+0):thx
兄弟,菌落PCR个人意见,
没有什么

第一用灭菌的牙签挑取少量的菌落
加入PCR管,

加入准备好的PCR反应体系
离心就可以PCr了,

一般使用通用引物
退火温度高一点60-63可以jiuxing
30循环
大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
4楼2007-11-13 11:40:39
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