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judy520

金虫 (小有名气)

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[交流] 多位点随机诱变后，突变基因如何进行定位和功能鉴定

手头有两株人工诱变之后选育的高产菌株，原核生物，野生型全基因组已经测序了，这俩高产菌株形态、产物变化都蛮大，突变位点可能比较多，老板愿意把高产菌株给测个序和野生型比对看看突变位点具体都是什么，但是突变位点鉴定完以后，怎么能稍微快速的鉴定突变的基因功能呢，现在常用的基因中断质粒构建很慢啊，并且这么多位点一个个来不晓得要弄到什么时候了，不知道大伙有没有什么建议啊？

这个全基因组测序据老板说目前有8000块能搞定的，不晓得准确率怎么样啊，或者有啥更好的办法呢？有知道的大牛指点一下吧。

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1楼 2013-08-18 19:22:57

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Sthunder

木虫 (正式写手)

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-08-19 18:33:18
judy520: 金币+5, 多谢回复。第一个哇感谢 2013-08-19 21:17:34

首先找出突变基因，查看其功能背景，然后结合你的功能进行核对，最后做个单、多特异突变，鉴于你的情况，个人觉得找到可疑基因后，直接克隆对应的突变基因进行过表达or特异突变，然后功能测试，Good luck！

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2楼2013-08-19 08:45:43

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judy520

金虫 (小有名气)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by Sthunder at 2013-08-19 08:45:43
首先找出突变基因，查看其功能背景，然后结合你的功能进行核对，最后做个单、多特异突变，鉴于你的情况，个人觉得找到可疑基因后，直接克隆对应的突变基因进行过表达or特异突变，然后功能测试，Good luck！

和我初步想法差不多，突变位点在NCBI上看看有木有相似序列，功能是什么，觉得有可能的基因做中断和回补实验，等拿回去做完测序比对完再看吧也不晓得突变位点具体多少

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4楼2013-08-19 21:17:54

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taochao3楼

2013-08-19 09:01 回复