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[求助]进化树问题，成功后送BB4
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用Clustaw X 进行比对后生成进化树，用Treeview打开，问题是 1、节点的数值是如何显示的？ 2、如何导入到word中，并且文字是文本框形式，可以编辑的！ 谢谢大家帮助！希望详细点 [ Last edited by telomerase on 2007-11-12 at 16:52 ] |
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3楼2007-11-12 18:16:06
reasonspare
木虫 (著名写手)
- BioEPI: 10
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2楼2007-11-12 17:35:08
johnsooh
荣誉版主 (正式写手)
此用户来自小木虫总部信号不好
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- 专业: 分子生物学
- 管辖: 生物科学
RE:
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reasonspare(金币+2,VIP+0):版主，分析精辟，令人敬佩。
reasonspare(金币+2,VIP+0):版主，分析精辟，令人敬佩。
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Clustaw X中所谓的＂节点数值＂，就是在１００或１０００次重复比对后得到的Bootstrapping值，是支持率，对于每个分支聚类（clustering）后加以说明,在节点处显示（node）． 楼主不要说是节点值，＾＿＾ Bootstrapping值，在Clustaw X比队后会输出，用TREEVIEW看图时可以显示，但是要在多个序列比队后才可以生成带支持率的图像，至少４个，简单的就是直接用Clustaw X软件输出该值，在菜单 -＞ TREES ->NJ ->Bootstrap N-J Tree 这个方法是最简单的，最好使用MEGA等比对软件，有更多的算法可以选择，你这样就可以得到较为准确可靠的比对结果，生成的树型拓扑也可以同样说明一个问题，NJ比对树型图比较常用，还有ML,MP以及ME等算法，不同算法结果可能得到的树型不同，建议取趋向一致的，树型较好的， 我以前用过UPGMA算法， 现在淘汰了，建议楼主不要取，本人一点经验，见笑． |
4楼2007-11-12 18:59:36
5楼2007-11-14 21:17:18
