| 查看: 762 | 回复: 4 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
[求助]进化树问题，成功后送BB4
|
|||
|
用Clustaw X 进行比对后生成进化树，用Treeview打开，问题是 1、节点的数值是如何显示的？ 2、如何导入到word中，并且文字是文本框形式，可以编辑的！ 谢谢大家帮助！希望详细点 [ Last edited by telomerase on 2007-11-12 at 16:52 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
求调剂
已经有4人回复
-
0854求调剂
已经有27人回复
-
材料相关专业344求调剂双非工科学校或课题组
已经有27人回复
-
300求调剂
已经有12人回复
-
291求调剂
已经有10人回复
-
一志愿沪9，326求生物学调剂
已经有12人回复
-
生物学调剂
已经有10人回复
-
320求调剂
已经有5人回复
-
接受任何调剂
已经有7人回复
-
化学070300 求调剂
已经有29人回复
reasonspare
木虫 (著名写手)
- BioEPI: 10
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.894
- 金币: 2137.1
- 红花: 11
- 帖子: 1909
- 在线: 72.5小时
- 虫号: 180928
- 注册: 2006-02-10
- 专业: All in one
2楼2007-11-12 17:35:08
3楼2007-11-12 18:16:06
johnsooh
荣誉版主 (正式写手)
此用户来自小木虫总部信号不好
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.8
- 金币: 2053.6
- 帖子: 465
- 在线: 3.5小时
- 虫号: 256819
- 注册: 2006-06-03
- 性别: GG
- 专业: 分子生物学
- 管辖: 生物科学
RE:
★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):版主，分析精辟，令人敬佩。
reasonspare(金币+2,VIP+0):版主，分析精辟，令人敬佩。
|
Clustaw X中所谓的＂节点数值＂，就是在１００或１０００次重复比对后得到的Bootstrapping值，是支持率，对于每个分支聚类（clustering）后加以说明,在节点处显示（node）． 楼主不要说是节点值，＾＿＾ Bootstrapping值，在Clustaw X比队后会输出，用TREEVIEW看图时可以显示，但是要在多个序列比队后才可以生成带支持率的图像，至少４个，简单的就是直接用Clustaw X软件输出该值，在菜单 -＞ TREES ->NJ ->Bootstrap N-J Tree 这个方法是最简单的，最好使用MEGA等比对软件，有更多的算法可以选择，你这样就可以得到较为准确可靠的比对结果，生成的树型拓扑也可以同样说明一个问题，NJ比对树型图比较常用，还有ML,MP以及ME等算法，不同算法结果可能得到的树型不同，建议取趋向一致的，树型较好的， 我以前用过UPGMA算法， 现在淘汰了，建议楼主不要取，本人一点经验，见笑． |
4楼2007-11-12 18:59:36
5楼2007-11-14 21:17:18
50