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cxzcool

木虫 (正式写手)

[交流] [求助]进化树问题,成功后送BB4

用Clustaw X 进行比对后生成进化树,用Treeview打开,问题是
1、节点的数值是如何显示的?
2、如何导入到word中,并且文字是文本框形式,可以编辑的!
谢谢大家帮助!希望详细点

[ Last edited by telomerase on 2007-11-12 at 16:52 ]
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reasonspare

木虫 (著名写手)

★
johnsooh(金币+1,VIP+0):是的, 谢谢斑斑, 编辑好了可以用PPT 生成图片的,Treeview生成的是透明图,生成后注意分辨率
第一个,不好说

第二个,你不要先到达word,你先到ppt,然后取消组合,就能进行编辑,
编辑好了,就可以用了,不一定非要word。
大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
2楼2007-11-12 17:35:08
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enxl

金虫 (小有名气)

★
johnsooh(金币+1,VIP+0):thx
不知Clustaw X 中会不会有节点数值,如果有可以在tree view中显示。
1)在treeview的tree菜单下——show internal edge labels。
2)在treeview中保存save as graphic,然后在word中双击或点右键就可编辑。

[ Last edited by enxl on 2007-11-13 at 09:45 ]
3楼2007-11-12 18:16:06
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johnsooh

荣誉版主 (正式写手)

此用户来自小木虫总部信号不好

RE:

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):版主,分析精辟,令人敬佩。
Clustaw X中所谓的"节点数值",就是在100或1000次重复比对后得到的Bootstrapping值,是支持率,对于每个分支聚类(clustering)后加以说明,在节点处显示(node).
楼主不要说是节点值,^_^
Bootstrapping值,在Clustaw X比队后会输出,用TREEVIEW看图时可以显示,但是要在多个序列比队后才可以生成带支持率的图像,至少4个,简单的就是直接用Clustaw X软件输出该值,在菜单 -> TREES ->NJ ->Bootstrap N-J Tree
这个方法是最简单的,最好使用MEGA等比对软件,有更多的算法可以选择,你这样就可以得到较为准确可靠的比对结果,生成的树型拓扑也可以同样说明一个问题,NJ比对树型图比较常用,还有ML,MP以及ME等算法,不同算法结果可能得到的树型不同,建议取趋向一致的,树型较好的, 我以前用过UPGMA算法, 现在淘汰了,建议楼主不要取,本人一点经验,见笑.
___▂▂▃▄▅▆▇█无信号︻╋████�?
4楼2007-11-12 18:59:36
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cxzcool

木虫 (正式写手)

谢谢大家的帮助, 我由于没有设置评分,不能送大家金币,无论如何向回帖者道歉谢谢reasonspare
信息
5楼2007-11-14 21:17:18
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