24小时热门版块排行榜    

查看: 476  |  回复: 3
当前主题已经存档。

ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 原子分裂的无序精修方法求助

在1st文件中有下面的提示,不知道在ins文件中加什么命令来解决?
Principal mean square atomic displacements U

   0.0580   0.0292   0.0254   Cu1  
   0.0434   0.0334   0.0278   S1  
   0.0761   0.0334   0.0322   O1  
   0.0583   0.0455   0.0263   O2  
   0.0940   0.0515   0.0328   O3  
   0.0802   0.0495   0.0363   O4  
   0.0397   0.0342   0.0274   N4  
   0.0510   0.0334   0.0281   N5  
   0.0390   0.0351   0.0317   N6  
   0.0473   0.0419   0.0320   C1  
   0.0669   0.0592   0.0354   C2  
   0.0898   0.0582   0.0322   C3  
   0.0958   0.0542   0.0298   C4  
   0.0718   0.0461   0.0336   C5  
   0.0486   0.0346   0.0297   C6  
   0.0496   0.0330   0.0289   C7  
   0.0496   0.0409   0.0277   C8  
   0.0707   0.0413   0.0323   C9  
   0.0703   0.0631   0.0284   C10  
   0.0682   0.0610   0.0276   C11  
   0.0528   0.0497   0.0303   C12  
   0.0399   0.0329   0.0307   C13  
   0.0385   0.0337   0.0293   C14  
   0.0586   0.0438   0.0330   C15  
   0.0748   0.0492   0.0303   C16  
   0.0713   0.0421   0.0299   C17  
   0.0515   0.0401   0.0307   C18  
   0.2147   0.0760   0.0526   C19    may be split into  0.2633  0.4056  0.5084  and  0.2928  0.3802  0.5143
   0.1546   0.1309   0.0445   C20  
   0.1613   0.0736   0.0438   O5  

C19,C20,O5都是乙醇溶剂上的原子。下面是我的ins文件:

TITL A in P-1
CELL 0.71073   8.4529  10.9750  11.2959  82.225  76.716  86.754
ZERR    2.00   0.0008   0.0011   0.0011   0.001   0.001   0.001
LATT 1
SFAC C  H  N  O  S  Cu
UNIT 40 42 6 10 2 2
OMIT  -3.00  51.00
L.S. 20
ACTA
BOND $H
FMAP 2
PLAN 5
CONF
HTAB
htab c12 o2_$2
htab c9 o1
htab c7 o4_$1
eqiv $2 1-x, 1-y, -z
eqiv $1 -x, -y, -z
HTAB O5 O1
SIZE 0.304 0.403 0.171
WGHT  0.062100  0.629500
FVAR  0.578990
TEMP 18
MOLE 1
Cu1    6   0.212556  0.253878  0.220593 11.000000  0.032200  0.026790 =
           0.049870 -0.009010  0.001320 -0.002390
S1     5   0.234912  0.159953 -0.050708 11.000000  0.038800  0.029530 =
           0.035320 -0.006190 -0.004280 -0.004230
O1     4   0.019855  0.262960  0.345133 11.000000  0.043450  0.037640 =
           0.054060 -0.013800  0.008480 -0.007640
O2     4   0.234504  0.278951 -0.004608 11.000000  0.053300  0.028430 =
           0.047400 -0.007820 -0.006340 -0.006310
O3     4   0.376439  0.139103 -0.147967 11.000000  0.065980  0.051580 =
           0.049000 -0.011570  0.014390 -0.002980
O4     4   0.080031  0.135749 -0.075773 11.000000  0.057880  0.048010 =
           0.069220 -0.005670 -0.032440 -0.006670
N4     3   0.169829  0.089342  0.190772 11.000000  0.039150  0.028410 =
           0.033800 -0.005860 -0.007510  0.000680
N5     3   0.236585  0.434509  0.206633 11.000000  0.033800  0.029920 =
           0.047300 -0.009100 -0.003730 -0.000370
N6     3   0.462911  0.260489  0.185085 11.000000  0.033900  0.034030 =
           0.038090 -0.007000 -0.007640  0.000840
C1     1  -0.078410  0.173151  0.399776 11.000000  0.032650  0.046760 =
           0.040640 -0.004270 -0.005940 -0.003390
C2     1  -0.205911  0.194780  0.500051 11.000000  0.043150  0.060530 =
           0.052220 -0.010990  0.002990 -0.001630
AFIX 43
H2     2  -0.217667  0.271809  0.527163 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C3     1  -0.313544  0.104598  0.558880 11.000000  0.037850  0.085030 =
           0.049310  0.002060  0.001510 -0.005690
AFIX 43
H3     2  -0.396063  0.121459  0.625210 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C4     1  -0.300445 -0.011281  0.520407 11.000000  0.041160  0.076730 =
           0.056510  0.013790 -0.007960 -0.021570
AFIX 43
H4     2  -0.373462 -0.071763  0.560824 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C5     1  -0.180328 -0.035451  0.423453 11.000000  0.048480  0.050510 =
           0.053530  0.005310 -0.016710 -0.016750
AFIX 43
H5A    2  -0.173134 -0.112767  0.397279 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C6     1  -0.065224  0.054001  0.360776 11.000000  0.033890  0.041160 =
           0.038530  0.000850 -0.011410 -0.007120
C7     1   0.050968  0.022776  0.255750 11.000000  0.043870  0.029880 =
           0.041450 -0.002960 -0.017210 -0.003670
AFIX 43
H7     2   0.040539 -0.053330  0.231165 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C8     1   0.260530  0.047833  0.076862 11.000000  0.045540  0.032390 =
           0.040340 -0.008720 -0.009270  0.007050
AFIX 23
H8A    2   0.221366 -0.031065  0.067949 11.000000 -1.200000
H8B    2   0.374896  0.037754  0.078148 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C9     1   0.112716  0.516385  0.223888 11.000000  0.037580  0.037290 =
           0.066800 -0.011230 -0.004560  0.002760
AFIX 43
H9     2   0.006983  0.488181  0.244930 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C10    1   0.136382  0.641351  0.211541 11.000000  0.056890  0.035080 =
           0.067780 -0.010160 -0.010920  0.012490
AFIX 43
H10    2   0.048178  0.696520  0.222909 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C11    1   0.292594  0.682569  0.182166 11.000000  0.067460  0.027810 =
           0.060390 -0.003210 -0.012960 -0.003880
AFIX 43
H11    2   0.311378  0.766160  0.175532 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C12    1   0.421936  0.599126  0.162481 11.000000  0.048520  0.035080 =
           0.048700 -0.002220 -0.009280 -0.010110
AFIX 43
H12    2   0.528342  0.625952  0.140842 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C13    1   0.390356  0.474869  0.175537 11.000000  0.037090  0.032540 =
           0.033400 -0.004850 -0.005720 -0.004170
C14    1   0.518446  0.376542  0.160047 11.000000  0.033800  0.035750 =
           0.033060 -0.007280 -0.007690 -0.003300
C15    1   0.683501  0.399869  0.123762 11.000000  0.036750  0.050460 =
           0.048770 -0.011520 -0.005810 -0.008750
AFIX 43
H15    2   0.719223  0.480296  0.107672 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C16    1   0.794300  0.301791  0.111834 11.000000  0.030890  0.070110 =
           0.056480 -0.018640 -0.010480 -0.000290
AFIX 43
H16    2   0.905125  0.315563  0.085375 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C17    1   0.737977  0.183553  0.139726 11.000000  0.039380  0.058230 =
           0.051080 -0.017500 -0.018840  0.014120
AFIX 43
H17    2   0.810498  0.116531  0.133492 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C18    1   0.572469  0.165748  0.177069 11.000000  0.040690  0.038570 =
           0.045300 -0.009530 -0.014030  0.007990
AFIX 43
H18    2   0.535268  0.085806  0.197370 11.000000 -1.200000
AFIX 0
C19    1   0.278033  0.392937  0.511349 10.500000  0.128980  0.148900 =
           0.060870 -0.013580  0.005530 -0.076170
AFIX 23
H19A   2   0.310451  0.469782  0.460295 10.500000 -1.200000
H19B   2   0.332447  0.327038  0.466925 10.500000 -1.200000
AFIX 0
C20    1   0.337025  0.389622  0.617693 10.500000  0.079450  0.153570 =
           0.116260 -0.020590 -0.056920 -0.012550
AFIX 137
H20A   2   0.353058  0.472021  0.631405 10.500000 -1.500000
H20B   2   0.438625  0.344169  0.608295 10.500000 -1.500000
H20C   2   0.259899  0.350399  0.686406 10.500000 -1.500000
AFIX 0
O5     4   0.116237  0.382936  0.523715 10.500000  0.079000  0.138500 =
           0.070470 -0.053500 -0.007910 -0.021830
AFIX 147
H5     2   0.099819  0.348647  0.467671 10.500000 -1.500000
AFIX 0
Q1     1   0.313100  0.439600  0.615900 11.000000  0.050000      0.58
Q2     1   0.360600  0.347800  0.560500 11.000000  0.050000      0.56
Q3     1   0.234500  0.454800  0.536300 11.000000  0.050000      0.44
Q4     1   0.442000  0.461100  0.537000 11.000000  0.050000      0.41
Q5     1   0.254300  0.101900  0.021100 11.000000  0.050000      0.39
HKLF 4
END  
麻烦高手能否直接在上面加上什么命令帮帮忙?谢谢。
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangwu

新虫 (小有名气)

Part

C19A 1 0.2633  0.4056  0.5084 10.5 0.05
C19B 1 0.2928  0.3802  0.5143 10.5 0.05
2楼2007-11-12 05:32:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

douvei

金虫 (正式写手)

差不多,可以先试试
欢迎访问无机超分子论坛: http://15151.5d6d.com/ 晶体解析/软件下载/超分子配位化学-应有尽有!!! 晶体论坛小木虫博客 http://blog.emuch.net/134386/
3楼2007-11-12 09:05:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

Title: {[(2-Hydroxy-benzylidene)-amino]-methanesulfonic-2N,O,O'}-
bipyridine-2N,N) Copper(II) ethanol solvate


has .....The ethanol molecule lies on a general position.  In the first
submission, I had asked you to treat the disorder but you instead halved the
occupancy so as to reduce the large temperature factors.  I note that you
did not supply elemental percentages to support the half occupancy
ethanol..........
所以那样处理显然不行的,请帮忙吧.
4楼2007-11-12 19:20:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ljmmarise 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见